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A+ 물리화학실험1 <Exp 10. Analyzing Electronic Structure of Small Organic Molecules using PySCF> 레포트

8 페이지
어도비 PDF
최초등록일 2024.08.14 최종저작일 2024.06
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A+ 물리화학실험1 &lt;Exp 10. Analyzing Electronic Structure of Small Organic Molecules using PySCF&gt; 레포트
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    • 전문성
    • 논리성
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    • 유사도 지수
      참고용 안전
    • 🔬 양자화학 계산의 심층적인 이론과 실습 제공
    • 💻 PySCF를 활용한 실제 분자 전자구조 분석 방법론 학습
    • 🧪 분자의 HOMO-LUMO, IR 스펙트럼 등 고급 분석 기법 소개

    미리보기

    소개

    안녕하세요.

    물리화학실험 실험10. 계산화학 레포트입니다.
    물리화학실험 A+ 받았으며, 해당 레포트 감점없이 100점 입니다.

    레포트 외에도 최신 기출을 반영한 <기말고사 대비 정리노트>를 함께 판매 중이니 공부하시는데 도움이 되길 바라겠습니다.

    목차

    1. Title
    2. Purpose
    3. Result
    4. Discussion
    5. Reference

    본문내용

    1. Title
    Exp 10. Analyzing Electronic Structure of Small Organic Molecules using PySCF.

    2. Purpose
    PySCF를 사용하여 benzene 및 diethyl ether의 전자 구조를 분석한다.
    ⚫ 구해야 하는 물리량
    1) Geometry optimization
    2) Molecular orbitals
    3) Vibrational frequencies

    3. Result
    Table 1. Benzene 및 diethyl ether의 계산 수행 결과.

    <중 략>

    4. Discussion
    본 실험에서는 benzene과 diethyl ether 분자의 HOMO, LUMO 구조를 예측하고, SCF Converged energy, Zero-point energy를 확인하였으며, 이론적인 IR spectrum을 얻고 가장 intensity가 큰 wavenumber에 해당하는 normal mode의 vibrational motion을 관찰을 진행하였다.
    분자를 비롯한 미시 세계의 운동이나 상태를 설명할 때 고전 역학적인 접근법에는 한계가 존재하는데 이를 극복할 방안으로 양자역학이 발전하였다. 양자역학에서는 분자를 파동함수로 나타내며, Schrödinger 방정식을 풀어 분자의 orbital 정보와 에너지를 도출한다. 그러나 이 과정은 입자 간의 복잡한 상호작용으로 인하여 해석이 어렵다. 이에 여러 적절한 근사 방법을 적용하여 계산을 간소화시킨다. 본 실험에서 사용한 PySCF (Pyton-based Simulations of Chemistry Framework)는 전자 구조 계산 모듈을 제공하는, 파이썬으로 구현된 오픈 소스 플랫폼으로, 이 프로그램을 통하여 분자, 결정, custom Hamiltonians의 시뮬레이션이 가능하다.

    참고자료

    · 서강대학교 Soft Matter Computational Chemistry Lab, 2024 Physical Chemistry Experiment 1 Computational Chemistry Manual, 2024, pp. 1~25.
    · Sun Q, Berkelbach TC, Blunt NS, et al, Recent developments in the PySCF program package, The Journal of Chemical Physics, 2020, 153(2), p. 24109.
    · Hehre WJ, Ditchfield R, People JA, Self‐Consistent Molecular Orbital Methods. XII. Further Extensions of Gaussian‐Type Basis Sets for Use in Molecular Orbital Studies of Organic Molecules. The Journal of Chemical Physics, 1972, 56(5), pp. 2257~2261.
    · Boys SF, Electronic wave functions-I. A general method of calculation for the stationary states of any molecular system, 1950, Proceedings of the Royal Society of London. Series A. Mathematical and Physical Sciences, 200(1063), pp, 542~554.
  • AI와 토픽 톺아보기

    • 1. Hartree-Fock 방법
      Hartree-Fock 방법은 양자 화학에서 매우 중요한 역할을 하는 근사 방법입니다. 이 방법은 전자 상호 작용을 평균장 근사를 통해 다루며, 전자 상관 관계를 완전히 고려하지 않습니다. 하지만 계산 비용이 상대적으로 낮고 정확도가 높은 편이어서 널리 사용되고 있습니다. Hartree-Fock 방법은 분자 구조 최적화, 분자 궤도함수 계산, 분자 에너지 계산 등 다양한 분야에 적용되며, 더 정확한 방법의 기반이 되기도 합니다. 이 방법의 한계를 극복하기 위해 전자 상관 관계를 고려하는 방법들이 개발되어 왔지만, Hartree-Fock 방법은 여전히 양자 화학 계산에서 중요한 역할을 하고 있습니다.
    • 2. Basis set
      Basis set은 양자 화학 계산에서 매우 중요한 역할을 합니다. Basis set은 분자 궤도함수를 표현하기 위해 사용되는 일련의 수학적 함수들입니다. 이 함수들의 선형 조합으로 분자 궤도함수를 나타낼 수 있습니다. Basis set의 선택은 계산 결과의 정확도에 큰 영향을 미치므로, 문제에 적합한 basis set을 선택하는 것이 중요합니다. 일반적으로 더 큰 basis set을 사용할수록 정확도가 높아지지만, 계산 비용도 증가합니다. 따라서 문제의 특성과 요구되는 정확도 수준에 맞는 적절한 basis set을 선택하는 것이 필요합니다. Basis set 선택의 중요성을 고려할 때, 이에 대한 이해와 경험이 양자 화학 계산에서 매우 중요하다고 할 수 있습니다.
    • 3. HOMO와 LUMO
      HOMO(Highest Occupied Molecular Orbital)와 LUMO(Lowest Unoccupied Molecular Orbital)는 분자 궤도함수 이론에서 매우 중요한 개념입니다. HOMO는 가장 높은 에너지 준위의 점유 궤도함수를, LUMO는 가장 낮은 에너지 준위의 비점유 궤도함수를 나타냅니다. 이 두 궤도함수는 분자의 화학적 반응성과 밀접한 관련이 있습니다. HOMO-LUMO 간 에너지 차이는 분자의 전자 전이 에너지를 결정하며, 이는 분자의 광학적 및 전기적 특성을 이해하는 데 중요한 정보를 제공합니다. 또한 HOMO-LUMO 간 에너지 차이는 분자의 화학적 안정성과도 관련이 있습니다. 따라서 HOMO와 LUMO에 대한 이해는 분자 구조와 특성을 이해하는 데 필수적이라고 할 수 있습니다.
    • 4. HOMO-LUMO energy gap
      HOMO-LUMO energy gap은 분자의 전자 구조와 화학적 특성을 이해하는 데 매우 중요한 개념입니다. HOMO-LUMO energy gap은 HOMO와 LUMO 사이의 에너지 차이를 나타내며, 이는 분자의 전자 전이 에너지, 광학적 특성, 화학 반응성 등을 결정하는 핵심 요소입니다. 일반적으로 HOMO-LUMO energy gap이 작은 분자는 전자 전이가 쉽게 일어나 반응성이 높고, 광학적 특성이 우수한 경향이 있습니다. 반면 HOMO-LUMO energy gap이 큰 분자는 전자 전이가 어려워 상대적으로 안정적이고 비반응성입니다. HOMO-LUMO energy gap은 분자 구조, 치환기, 공액 시스템 등 다양한 요인에 의해 영향을 받습니다. 따라서 HOMO-LUMO energy gap을 조절하여 분자의 특성을 설계하는 것은 유기 전자 소재, 광전자 소자, 촉매 등 다양한 분야에서 중요한 연구 주제가 되고 있습니다. 이처럼 HOMO-LUMO energy gap은 분자 구조와 특성을 이해하고 제어하는 데 핵심적인 개념이라고 할 수 있습니다.
    • 5. IR spectrum 분석
      IR(Infrared) 스펙트럼 분석은 분자 구조 분석에 매우 유용한 도구입니다. IR 스펙트럼은 분자 내 화학 결합의 진동 모드에 해당하는 특징적인 흡수 피크를 보여줍니다. 이를 통해 분자 내 작용기, 결합 유형, 분자 구조 등을 파악할 수 있습니다. IR 스펙트럼 분석은 다음과 같은 장점이 있습니다. 첫째, 비파괴적인 분석 방법이므로 시료 손상 없이 분석이 가능합니다. 둘째, 시료 전처리가 간단하여 신속한 분석이 가능합니다. 셋째, 유기 화합물, 고분자, 생체 분자 등 다양한 물질에 적용할 수 있습니다. 넷째, 정성 분석뿐만 아니라 정량 분석에도 활용할 수 있습니다. 이처럼 IR 스펙트럼 분석은 분자 구조 규명, 화학 반응 모니터링, 불순물 검출 등 다양한 분야에서 널리 사용되고 있습니다. 특히 최근에는 기기 성능 향상과 데이터 분석 기술 발전으로 IR 스펙트럼 분석의 활용도가 더욱 증가하고 있습니다.
    • 6. PySCF
      PySCF(Python-based Simulations of Chemistry Framework)는 양자 화학 계산을 위한 강력한 오픈 소스 소프트웨어 패키지입니다. PySCF는 Python 기반으로 개발되어 사용이 편리하고, 다양한 양자 화학 방법을 지원하며, 계산 성능도 우수합니다. PySCF의 주요 특징은 다음과 같습니다. 첫째, Hartree-Fock, MP2, CCSD, CASSCF 등 다양한 전자 상관 관계 방법을 지원합니다. 둘째, 분자 구조 최적화, 분자 궤도함수 계산, 분광학 특성 계산 등 다양한 기능을 제공합니다. 셋째, 병렬 처리를 통해 대규모 계산을 효율적으로 수행할 수 있습니다. 넷째, 사용자 친화적인 API와 풍부한 문서화로 초보자도 쉽게 사용할 수 있습니다. PySCF는 학계와 산업계에서 널리 사용되고 있으며, 지속적으로 개발되고 있습니다. 특히 최근에는 기계 학습 기반 방법과의 연계, 그래픽 처리 장치(GPU) 활용 등 다양한 기능이 추가되고 있습니다. 이처럼 PySCF는 양자 화학 계산에서 강력한 도구로 자리잡고 있습니다.
  • 자료후기

      Ai 리뷰
      본 실험은 양자 화학 계산 프레임워크인 PySCF를 활용하여 유기 분자의 전자 구조를 분석하였으며, 분자 궤도함수와 IR 스펙트럼을 효과적으로 예측하였습니다.
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