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계산화학 실습

서울대학교 화학실험 A+ 레포트입니다
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최초등록일 2023.07.19 최종저작일 2021.06
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계산화학 실습
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    소개

    서울대학교 화학실험 A+ 레포트입니다

    목차

    1. INTRODUCTION

    2. RESULT
    2.1 분자오비탈 도표
    2.2 분자의 최적화
    2.3 퍼텐셜 에너지 곡면

    3. DATA ANALYSIS AND DISCUSSION
    3.1 HE2, O2, N2결합 차수 및 결합 에너지
    3.2 HE2, N2의 퍼텐션에너지 곡면
    3.3 결합 길이, 결합 에너지의 실제 값과 이론 값

    4. ASSIGNMENT
    4.1 과제1
    4.2 과제2
    4.3 과제4

    5. REFERENCE

    본문내용

    1. Introduction
    그동안 화학에서 다양한 실험을 통해 화학에 대한 지식을 넓힐 수 있었지만, 여전히 실험이나 수학적 방법으로 알기 어려운 부분들이 존재한다. 화학자들은 풀기 어려운 수식들을 컴퓨터를 사용하는 계산화학이라는 학문을 통하여 실제에 가까운 계에 대한 해결을 시도하게 되었다. 계산화학 방법론 중에서도 분자동력학, 양자화학 등이 있는데, 본 실험에서는 양자화학 방법론을 이용하여 N¬2, He¬2, O2의 최적화된 구조를 결정하고, 이때의 결합 길이와 결합 에너지를 알아볼 것이다. 이후 결합 길이를 조정하여 이에 따른 결합 에너지 그래프인 퍼텐셜 에너지 곡면 그래프를 그려볼 것이다. 본 실험은 계산화학 프로그램인 GAMESS 계산을 통하여 계산화학에 대한 이해도를 높이는 데에 목표를 두고 있다.
    양자계산
    양자화학 방법론은 Schrondinger 방정식을 풀면서 계산하는 것인데, 수소와 같은 단순한 계가 아닌 복잡한 계에 대해서는 슈뢰딩거 방정식의 정확한 해를 구할 수 없다. 따라서 해가 될 수 있는 함수의 종류를 국한시키고 자체-일관성 장(self-consistent field, SCF) 방법론을 사용해 해와 방정식이 수렴할 수 있도록 점점 다가간다. 본 실험에서 사용하는 SCF 방법론은 개개의 오비탈에 대한 방정식으로 나누는 Hartree-Fock방법론을 사용한다.
    2. RESULT
    2.1 분자오비탈 도표
    He¬2¬, N¬2¬, O¬2의 분자 오비탈을 아래와 같이 나타낼 수 있다. 결합차수(bond order)는 다음과 같이 구할 수 있다.
    2.2 분자의 최적화
    Avogadro를 실행하여 분자의 최적화를 진행한 후, edison 사이트에서의 GAMESS 프로그램에서 결합 길이, 분자 에너지, 개별 원자의 에너지 값을 얻을 수 있었다.
    모든 분자의 Basic Setup에서 equilibrium geometry를 계산하고, basis set은 6-31G로 설정했다.

    참고자료

    · https:// www.msg.chem.iastate.edu/gamess/GAMESS_Manual/input.pdf : GAMESS 매뉴얼
    · Schmidt, Michael W., et al. "General atomic and molecular electronic structure system." Journal of computational chemistry 14.11 (1993), 1347 1363.
    · Zumdall, 줌달의 일반화학 9판, 화학교재연구회(역), 사이플러스(2014), 49-50, 1060-1063
    · 정우 한. “Computational Catalysis and Emerging Materials Laboratory, POSTECH.” 2020, www.cheric.org/PDF/NICE/NI38/NI38-1-0038.pdf.
  • AI와 토픽 톺아보기

    • 1. 계산화학
      계산화학은 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 화학 시스템의 구조와 반응을 연구하는 분야입니다. 이 분야는 실험적 접근이 어렵거나 비용이 많이 드는 경우에 유용하게 활용될 수 있습니다. 계산화학은 양자역학과 통계역학의 원리를 바탕으로 하며, 분자 구조, 반응 메커니즘, 분광학적 특성 등을 예측할 수 있습니다. 최근에는 컴퓨팅 파워의 발전과 더불어 계산화학 기법이 크게 발전하고 있으며, 다양한 화학 분야에 폭넓게 적용되고 있습니다. 특히 신약 개발, 신소재 설계, 환경 화학 등의 영역에서 계산화학이 중요한 역할을 하고 있습니다.
    • 2. 분자 오비탈
      분자 오비탈은 화학 결합을 이해하는 데 핵심적인 개념입니다. 분자 오비탈 이론은 원자 오비탈이 결합하여 형성된 분자 오비탈의 에너지 준위와 전자 분포를 설명합니다. 이를 통해 분자의 안정성, 반응성, 전자 구조 등을 이해할 수 있습니다. 분자 오비탈 이론은 양자역학에 기반하며, 단순한 분자부터 복잡한 생체 분자까지 다양한 화학 시스템에 적용될 수 있습니다. 최근에는 고성능 컴퓨터와 계산화학 기법의 발전으로 분자 오비탈 이론이 더욱 정교해지고 있으며, 새로운 물질 설계와 반응 메커니즘 연구에 활용되고 있습니다.
    • 3. 퍼텐셜 에너지 곡면
      퍼텐셜 에너지 곡면은 화학 반응 과정에서 시스템의 에너지 변화를 나타내는 다차원 그래프입니다. 이 곡면은 반응 좌표에 따른 에너지 변화를 보여주며, 반응 경로, 중간체, 전이 상태 등의 정보를 제공합니다. 퍼텐셜 에너지 곡면은 양자화학 계산을 통해 얻을 수 있으며, 반응 메커니즘 연구, 촉매 설계, 반응 동력학 분석 등에 활용됩니다. 최근에는 기계 학습 기법을 활용하여 퍼텐셜 에너지 곡면을 효율적으로 모델링하는 연구가 진행되고 있습니다. 이를 통해 복잡한 화학 반응을 보다 정확하게 예측하고 이해할 수 있게 되었습니다.
    • 4. Hartree-Fock 방법론
      Hartree-Fock 방법론은 양자화학에서 가장 널리 사용되는 근사 기법 중 하나입니다. 이 방법은 전자 상관 관계를 고려하지 않고 각 전자가 평균 전위장 내에서 움직인다고 가정합니다. 이를 통해 다전자 시스템의 파동 함수와 에너지를 계산할 수 있습니다. Hartree-Fock 방법은 계산 효율성이 높아 다양한 화학 시스템에 적용될 수 있지만, 전자 상관 관계를 완전히 고려하지 않아 정확도가 다소 떨어집니다. 따라서 최근에는 전자 상관 관계를 더 잘 반영할 수 있는 방법론들이 개발되고 있으며, Hartree-Fock 방법은 이러한 고급 방법의 출발점으로 활용되고 있습니다.
    • 5. 계산화학 응용
      계산화학은 다양한 화학 분야에 폭넓게 응용되고 있습니다. 신약 개발 분야에서는 계산화학 기법을 활용하여 후보 물질의 구조, 활성, 독성 등을 신속하게 예측할 수 있습니다. 신소재 설계 분야에서는 계산화학을 통해 물질의 구조, 전자 특성, 열역학적 안정성 등을 미리 확인할 수 있어 실험 비용과 시간을 크게 절감할 수 있습니다. 또한 계산화학은 환경 화학, 에너지 화학, 생화학 등의 분야에서도 중요한 역할을 하고 있습니다. 최근에는 기계 학습 기법과 계산화학을 결합하여 더욱 정확하고 효율적인 모델링이 가능해졌습니다. 이를 통해 계산화학의 응용 범위가 지속적으로 확대되고 있습니다.
  • 자료후기

      Ai 리뷰
      화학실험 보고서로, 계산화학 기법을 활용하여 이원자 분자의 구조와 결합 특성을 심도 있게 분석한 내용이다.
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