ucsc genome brower - Using the UCSC Genome browser

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NGS( Next Generation Sequencing)- Sanger Sequencing과 달리 대량의 병렬 데이터 생산(Massive parallel sequencing)으로 유전체의 염기서열을 고속으로 분석(Highthroughput sequencing) 하는 기술로, 하나의 유전체를 수많은 조각으로 분해하여 각 조각을 동시에 읽은 후 전산기술을 이용하여 조합함으로써 방대한 유전체 정보를 빠르게 해독하는 방법.
Human Genome Project-사람의 30억개 base pair모든 염기서열을 알아내고자 하는 목적으로 1990~2003년까지 진행된 대형 프로젝트로 염기서열 뿐만 아니라 유전자 종류, 기능도 밝히고자 했고 이 프로젝트의 결과로 환자와 정상인 사이 유전자 차이를 찾고 개인별 맞춤 의료에 적용하는 등 다방면으로 활용이 가능 하다는데 큰 의의가있다. 이 프로젝트는 미국 주도하에 영국, 일본, 프랑스, 독일, 중국 과 같은 나라들이 모여 함께 진행하였고 중간 Next generation sequencing( NGS)같은 기술의 발전으로 좀 더 빠른속도로 서열을 분석할수 있게 되어 15년으로 예상했던 프로젝트를 2년 단축시켜 2003년에 종료할수 있었다. 서열을 알아내는 것은 이해할수 없는 언어로 쓰인 책을 읽는 것과 같아서 human genome을 더욱 더 이해 하기 위해서 human genome project이후에도 다양한 인종으로 구성된 인간1000명의 유전체를 해독하는 1000 Genome project 나 인간 유전체의 functional element를 알아내는 ENCODE PROJECT 등의 다양한 프로젝트들이 진행되었다.

참고자료

· Prashant Mali, Luhan Yang, Kevin M. Esvelt, John Aach, Marc Guell, James E. DiCarlo, Julie E. Norville, GeorgeM.Church/RNA-Guided Human Genome Engineering via Cas9/science/2013
· D. Karolchik, R. Baertsch, M. Diekhans, T. S. Furey, A. Hinrichs, Y. T. Lu, K. M. Roskin, M. Schwartz, C. W. Sugnet, D. J. Thomas, R. J. Weber, D. Haussler, W. J. Kent, The UCSC Genome Browser Database/ Nucleic Acids Research/ 2003