[일반생물학실험]미생물 유전정보 분석

소개

염기서열을 sequencing과정을 통해 미생물의 종을 확인해보며 Hydrolysis test, 그람염색법 그리고 Oxidase, catalase test을 이용해 실험으로 확인할 수 있는 균들의 특징을 확인해보는 실험입니다.

목차

1. 실험 목적

2. 실험 이론 및 원리
가. 미생물(Microorganium)
나. 획선평판법
다. PCR(Polymerase Chain Reaction, 중합효소 연쇄 반응)
라. 겔 전기영동
마. BLAST(Basic Local Alinment Search Tool)
바. 그람 염색법 (Gram stain)

3. 실험 기구 및 시약
가. 실험 기구
나. 시약 및 용액

4. 실험 방법
가. 배지 제작 및 미생물 배양
나. PCR & 겔 전기영동, BLAST & EZ-Biocloud , Phylogeneic Tree
다. 배양한 미생물의 특성 확인

5. 실험 결과
가. 미생물 배양
나. PCR & 겔 전기영동 , BLAST & EZ-Biocloud , Phylogeneic Tree
다. Staphylococcus aureus의 실험적 특성

6. 토의 사항
가. 실험 고찰

7. 참고 문헌

본문내용

1. 실험 목적
균을 장기간 보관할 수 있는 stock solution와 균을 배양학 위한 LB agar 배지를 직접 제작해본다. 이 과정에서 마이크로피펫을 포함한 다양한 실험 기구들의 사용방법을 익힌다. 또한 PCR과 겔 전기영동의 원리를 이해하고 이를 활용해 배양한 균의 염기서열을 직접 산출해낸다. 산출된 염기서열을 sequencing과정을 통해 미생물의 종을 확인해보며 Hydrolysis test, 그람염색법 그리고 Oxidase, catalase test을 이용해 실험으로 확인할 수 있는 균들의 특징을 확인해 보는 것까지가 이번 실험의 목표이다.

2. 실험 이론 및 원리
2.1. 미생물(Microorganium)
미생물은 육안으로 관찰할 수 없는 작은 생물을 흔히 일컫는 말이다. 미생물은 우리가 살고 있는미생물지구상에 압도적으로 많은 수를 자랑한다. 즉 거의 대부분의 장소와 물건에서 미생물이 존재한다는 것이다. 이러한 미생물의 종류로는 원핵세포, 진핵세포 그리고 바이러스로 분류된다. 원핵세포는 진핵세포에 비해 단순한 구조를 가지고 있으며, 형태가 매우 원시적이다. 또한 핵과 세포기관이 없으며, 유전물질이 핵막에 둘러싸여 있지 않고 세포질의 핵양체가 위치해 있다. 원핵세포에는 진정세균, 고세균 등이 대표적이다. 진핵세포는 복잡한 구조를 가진 진화된 세포로, 뚜력한 핵막과 세포기관을 가지고 있다. 우리가 알고 있는 모든 동식물의 세포들은 전부 진핵세포로 분류되며 그 외에도 원생동물, 진균 그리고 조류도 모두 진핵세포로 분류되어 있다. 바이어스는 위의 두 종류의 미생물들과는 달리, 세포가 아니며, 세포벽도 존재하지 않는다. 바이러스는 자신만의 독자적인 분류체계를 가지며 유전물질(DNA)과 단백질 껍질만으로 이루어져 있다.

2.2. 획선평판법
미생물 배양 시 single colony를 얻기 위한 배양법들 중 한 가지이다. 고체 배지에 반복하여 긋는 동안 세균이 차례로 떨어져 나와 colony를 형성한다.

참고자료

· Thiran, E. ; Di Ciccio, P.A. ; Graber, H.U. ; Zanardi, E. ; Ianieri, A. ; Hummerjohann, J., Biofilm formation of Staphylococcus aureus dairy isolates representing different genotypes, Staphylococcus Aureus ; Biofilm ; Genotype ; Spa Type, 2018, 101(2) , pp. 1000-1012
· 최신심플 미생물학, Masayuki Saijo, 김병극 외 8명, 편역, 대광의학, 2016, p.237-239
· 병원미생물학, Kathleen Park Talaro, 김종배 외 8명, 편역, 라이프라이언스, 2012, p.190-196