Bacteria feeding RNAi in C. elegans

소개

dsRNA가 transcription되어 있는 E. coli를 먹이로 먹이는 방법으로 C. elegans의 유전자 발현을 suppression시키는 RNA interference(RNAi)에 대해 알아보는 실험보고서

목차

1. abstract
2. introduction
3. material & method
4. result
5. discussion
6. reference

본문내용

Abstract
이번 실험은 dsRNA가 transcription되어 있는 E. coli를 먹이로 먹이는 방법으로 C. elegans의 유전자 발현을 suppression시키는 RNA interference(RNAi)에 대해 알아보는 실험이었다. RNA interference(RNAi)는 dsRNA에 의해 서열 특이적으로 mRNA가 분해되어 유전자 발현이 억제(gene silencing)되는 현상이다. 실험은 NGM(nematode growth media) plate에 C. elegans의 먹이가 되는 E. coli를 seeding한 후 dsRNA의 induction 및 seeding하여 RNAi agar plate를 만든다. 이 후 C. elegans를 분주한 뒤 3일 뒤 발현이 억제된 C. elegans의 수를 세어주었다. 결과는 bli-1 gene이 발현되지 않아 cuticular collagen을 비정상적으로 encord시켜 피층이 함몰되어 꺾이는 것 같은 특이한 구조를 만든 C. elegans가 평균적으로 126마리이며 bli-1 gene이 발현된 C. elegans가 평균적으로 48마리였다. mutant가 일어나는 비율은 126/174가 되어 72.41%이다. dpy-13 gene이 발현되지 않으면 피층의 collagen을 과발현 시켜 wild type보다 두껍고 짧은 C. elegans를 만드는데 dpy-13 gene이 평균적으로 24마리가 발현되지 않았고 dpy-13 gene이 발현된 평균적으로 C. elegans는 9마리가 발현되었다. mutant가 일어나는 비율은 24/33이 되어 72.73%이다.
Introduction
RNA interference(RNAi)는 double-stranded RNA(dsRNA)에 의해 서열 특이적으로 mRNA가 분해되어 유전자 발현이 억제(gene silencing)되는 현상이다. dsRNA에 의해 유전자가 silencing 된다는 사실을 처음 알게 된 발단은 C. elegans에서의 antisense를 이용한 연구에서였다. 1995년 Guo와 Kemphues는 par-1이라고 불리는 유전자를 antisense RNA로 억제하는 실험을 실시했다. antisense RNA를 주입하자 예상대로 par-1 발현을 억제했지만 놀랍게도 대조구로서 이용한 sense RNA도 마찬가지로

참고자료

· 자료내에 포함