MALDI-TOP펩티드_정량분석

소개

MALDI-TOP를 이용한 펩티드 정량분석 실험 보고서 입니다.

목차

1. Abstract & Introduction
2. Materials
3. Methods
4. Data & Results
5. Disscussion
5. Reference

본문내용

1. Abstract & Introduction
최근에 프로테오믹스라는 학문 분야가 각광받고 있다. 프로테오믹스는 단백질을 중점으로 한 branch of discovery science이다. 프로테오믹스는 genome에 대한 정보와 그것의 발현 사이의 gap을 연결해 줄 수 있는 학문으로 화학과 생물학에서 중요한 위치를 차지할 것으로 기대된다. 프로테오믹스에서는 단백질을 동정하는 것이 중요한데 MALDI-TOF MS(Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization time of flight Mass Spectrometry)의 방법으로 단백질을 동정할 수 있다.
MALDI는 분자를 이온화 하는 방법으로, UV레이저가 매트릭스 분자에 쏘이면 매트릭스 분자는 들뜬 상태가 되고, 매트릭스 속에 들어있던 시료분자들이 진공 속으로 분출하게 된다. 이 과정에서 시료분자는 H+를 받아 이온화가 된다. 매트릭스는 레이저를 잘 흡수 할 수 있게 발색단을 가져야 하고 시료 물질과 같은 용매에 잘 용해되어야 한다. 이번 실험에서는 -cyano-4-hydroxy-cinnamic acid(CHCA)를 매트릭스로 쓰는데, 비교적 작은 분자를 분석할 때에 좋은 매트릭스이다.

<CHCA>
시료분자가 이온화되면 전기장에서 가속시켜 비행하는 시간에 따라 분자들을 분리한다. 이 과정을 통해 시료분자들의 분자량을 알 수 있다.
단백질은 아미노산의 축합중합체로, 효소에 의해 가수분해 될 수 있다. 이번 실험에서는 단백질의 특정부위를 가수분해하는 트립신으로 미지의 단백질을 펩티드 조각으로 나눈 뒤, MALDI-TOF MS로 펩티드 조각의 분자량을 측정한다. 측정된 분자량들과 미리 알고 있던 단백질의 아미노산 서열에서 얻은 펩티드 조각의 분자량을 비교해 미지의 단백질을 알아낸다.

참고자료

· 김희준·김병문·김성근·신석민, <<생명의 화학 삶의 화학>>, 자유아카데미, 2009, p447~450
· 임구일·최명식, <[핵심 광 기술소개] MALDI(Matrix Assisted Laser
· Desorption/Ionization) 질량분석법>, <<광학과 기술>>, 한국 광학회, p29~33
· Daniel C. Harris, Quantitative Chemical Analysis, 7/ed, FREEMAN, 2007, p494
· Richard a. Simpson, Proteins and Proteomics A Laboratory Manual,
· CSHL PRESS, 2003, p2~4
· 임구일·최명식, <[핵심 광 기술소개] MALDI(Matrix Assisted Laser
· Desorption/Ionization) 질량분석법>, <<광학과 기술>>, 한국 광학회, p430