차별 발현 역전사중합효소연쇄반응법을 이용한 원발 간세포암종의 유전자 발현 분석 (Analysis of Gene Expression in Primary Hepatocellular Carcinoma Using Differentially Displayed Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction)

서지정보

· 발행기관 : 대한소화기학회
· 수록지 정보 : 대한소화기학회지 / 53권 / 6호 / 361 ~ 368페이지
· 저자명 : 이영춘, 허원희, 최정은, 박련숙, 홍성우, 배시현, 최종영, 윤승규

초록

목적: 원발 간세포암종에서 특이하게 과발현되는 특정 유전자를 규명하는 것은 간세포암종 발암 기전의 연구나, 암의 조기진단 및 암 특이 유전자를 표적으로 한 유전자 치료에 매우 중요한 정보를 제공한다. 이에 이번 연구에서는 차별 발현 역전사중합효소연쇄반응법을 활용한 유전자 분석을 통해 간세포암에서 특이하게 과발현되는 특이 유전자를 밝혀내고 이 유전자의 발현율을 여러 시료에서 확인하여 간세포암 관련 유전자들의 기능을 탐색하고자 하였다. 대상 및 방법: 원발 간세포암종으로 수술을 시행 받았던 3명의 간세포암 환자의 간 적출물에서 간세포암종 조직과 암주변의 비 간세포암 조직 3쌍을 채취한 후 차별 발현 역전사중합효소연쇄반응법을 이용하여 간세포암종 조직에서 과발현되거나 소실된 유전자 혹은 저발현되어 있는 유전자를 겔로부터 DNA를 용출하여 이를 클로닝한 후 염기서열분석을 통하여 나타난 유전자의 서열을 유전자 검색프로그램에 넣어 그 유전자의 이름이나 특성들을 탐색하였다. 이후 새로 규명된 유전자의 기능을 검증하기 위하여 11쌍의 간세포암종 및 비간세포암종 조직과 인간 암세포주인 간세포암종 세포주[HepG2, Hep3B, Huh7], 자궁암 세포주[HeLa], 대장암 세포주[HT1299], 섬유육종 세포주[HT1080], 폐암 세포주[A549]에서 실시간 중합효소연쇄반응을 이용하여 이들 유전자의 발현을 확인한 후 분석하였다. 결과: 이번 연구를 통해서 단백 대사, 유비퀴틴 의존성 단백 대사, 탄수화물 대사, 지방대사, 유전자 복구, 염증 반응 등의 다양한 기능을 가지는 21종의 유전자들을 탐색하였다. 결론: 이번 연구를 통하여 간세포암종 조직과 비간세포암종 조직에서 발현차이를 보이는 유전자를 탐색하였고, 이러한 유전자의 특성 규명은 간세포암종의 발암 기전을 규명하거나 조기 간세포암을 진단하는 바이오 마커의 개발 혹은 분자표적을 대상으로 하는 유전자 치료의 개발에 기초자료로 유용할 것으로 생각한다.

영어초록

Background/Aims: The investigation of a specific tumor marker for hepatocellular carcinoma (HCC) is needed to examine the carcinogenesis and to select the patients for treatment options. The aim of this study was to find the genes related to HCC. We also examined the expression level of these genes in cancer cell lines and tissue specimens. Methods: Three pairs of HCC tissue and non-neoplastic hepatic tissue around the HCC were collected from three patients who underwent resection for HCC. Differential display reverse transcriptase-PCR (DD RT-PCR) using GeneFishingTM PCR was used to detect the differences in the gene expression between in HCC tissue and non-neoplatic tissue. Up- or down-regulated genes in HCC tissue were identified through BLAST searches after cloning and sequencing assays. Real-time RT-PCR assay was employed to detect the expression rate in 11 HCC tissues and human cancer cell lines. Results: Differentially expressed 21 genes were identified, and they were classified as genes involved in protein metabolism, ubiquitin-dependent protein catabolism, carbohydrate metabolism, lipid metabolism, DNA repair, and inflammatory response. Conclusions: We identified differentially expressed genes in HCC, and these genes may play an important role in the study of hepatocarcinogenesis, development of biomarker, and target therapy for HCC.

참고자료

· 없음