가시나무류의 RAPD 유전분석을 위한 Genomic DNA 최적 추출조건 및 RAPD Primer 선별 (Optimal Genomic DNA Extraction Conditions and Primer Selection for RAPD Analysis of Evergreen Quercus spp.)

서지정보

· 발행기관 : 경상국립대학교 농업생명과학연구원
· 수록지 정보 : 농업생명과학연구 / 52권 / 2호 / 45 ~ 54페이지
· 저자명 : 박동진, 최명석

초록

유전분석을 위해서, CTAB buffer를 이용하여 가시나무류 4종의 genomic DNA를 분리하였다. CTABbuffer를 이용하여 분리한 genomic DNA의 순도는 Edward buffer를 이용했을 때보다 더 높게 나타났다.
가시나무(Q. myrsinaefolia)로부터적정 순도 gDNA는 2% CTAB에 0, 1 또는 2% PVP가 첨가된 buffer를이용했을 때 얻어졌다. 종가시나무(Q. glauca)로부터 1% CTAB buffer와 1% PVP를 첨가한 buffer를 이용하여 얻은 gDNA 순도는 1.84±0.02(A260/280)였다. 참가시나무(Q. salicina)의 적정순도 gDNA는 2%CTAB와 1 또는 5% PVP가 첨가된 buffer를 이용하여 분리할 수 있었다. 2% CTAB와 2% PVP가 첨가된buffer를 이용했을 때, 졸가시나무(Q. phillyraeoides)의 gDNA의 순도는 1.85±0.01(A260/280)였다. 18개의 RAPD primer를 사용하여 PCR을 수행하였을 때, 가시나무에서는 15개 primer에 의해 53개의 다형질DNA가 발견되었다. 종가시나무에서는 11개의 primer에 의해 40개의 다형질 DNA가 나타났다. 참가시나무의 경우 16개의 primer에 의해 50개의 증폭된 DNA밴드를 확인 할 수 있었다. 졸가시나무에서 14의primer가 증폭반응을 일으켰고, 53개의 다형질 DNA가 나타났다. 이 결과들은 가시나무류의 유전분석에이용할 수 있다.

영어초록

For genetic analysis of four species of evergreen Quercus spp, their genomic DNA were isolatedusing CTAB buffer method. The purity values of genomic DNA of each species isolated usingCTAB buffer were higher than those isolated using Edward buffer. The adequate purity of genomicDNA of Quercus myrsinaefolia was obtained using the buffer containing 2% CTAB and 0, 1 or2% PVP. The purity of gnomic DNA of Q. glauca was 1.84±0.02(A260/280) when the buffercontaining 1% CTAB and 1% PVP was used. Adequate genomic DNA purity of Q. salicina couldbe isolated using the buffer containing 2% CTAB and 1 or 5% PVP. The purity of genomic DNAof Q. phillyraeoides was 1.85±0.01(A260/280), and it was obtained when the buffer 2% CTAB and2% PVP was used. When the PCR reactions using 18 RAPD primers were performed, 15 primerproduced 53 amplified fragments of Q. myrsinaefolia. Eleven primers produced 40 polymorphicDNA of Q. glauca. For amplification of random polymorphic DNA of Q. salicina, 16 primersproduced 50 bands. Of Q. phillyraeoides, 53 polymorphic bands were amplified by 14 randomprimers. These results can be used for genetic analysis of evergreen Quercus spp.

참고자료

· 없음