고농도 생물량 담수 시료 내 자유생활아메바 검출을 위한 다중 nested PCR법의 개발 및 적용 (Optimization and application of multiplex nested PCR to detect free-living amoebas in biomass-rich freshwater samples)

서지정보

· 발행기관 : 한국미생물학회
· 수록지 정보 : 미생물학회지 / 58권 / 1호 / 33 ~ 40페이지
· 저자명 : 김은정, 신지수, 김도환, 조영철

초록

생물량이 많은 시료에서 기회성 감염을 일으키는 자유생활아메바인 Naegleria fowleri와 Acanthamoeba spp.를 동시에검출하기 위한 다중 nested PCR 방법을 최적화하였다. 18S rRNA를 대상으로 PCR에 필요한 primer를 설계하였으며, 이를 활용하여 PCR 조건을 최적화하였다. 본 연구에서 개발된방법은 대상 자유생활아메바가 시료 당 하나만 존재하여도 검출할 수 있었다. 낙동강에서 채집된 56개의 시료를 대상으로다중 nested PCR법을 적용한 결과, N. fowleri는 9개 시료(16.1%), Acanthamoeba spp.는 55개 시료(98.2%)에서 검출되었다. 본 연구에서 개발된 방법은 생물량이 많은 수시료에서N. fowleri와 Acanthamoeba spp.를 모니터링하는데 적합한 것으로 판단된다.

영어초록

Multiplex nested PCR method to detect Naegleria fowleri and Acanthamoeba spp., opportunistic pathogenic free-living amoebas (FLAs), in biomass-rich samples was optimized and applied in the samples taken from Korean freshwaters. The appropriate PCR primers targeted 18S rRNA gene of these FLAs were selected or designed and the reaction conditions were optimized.
The optimized method can detect these FLAs even if a single cell is present in the sample. When the optimized method was applied to the 56 samples taken from the Nakdong River in Korea, N. fowleri and Acanthamoeba spp. were detected in 9 samples (16.1%) and 55 samples (98.2%), respectively. In conclusion the method optimized in this study can be used to monitor N. fowleri and Acanthamoeba spp. and in biomass-rich samples.

참고자료

· 없음