c-Src 티로신 키나아제의 순차적인 구조 변화와 이마티닙 결합에 대한 연구 (A Study on Imatinib Binding to c-Src Tyrosine Kinase According to Sequential Conformational Change)

서지정보

· 발행기관 : 한국물리학회
· 수록지 정보 : 새물리 / 69권 / 9호 / 984 ~ 988페이지
· 저자명 : 박수현, 우상욱

초록

c-Src 티로신 키나아제 (Tyrosine Kinase) 는 세포 분화와 성장에 관여하는 단백질이다. 이마티닙(Imatinib) 또는 상품명 글리벡 (Gleevec®)은 Abl 티로신 키나아제의 활성 억제에 매우 효과적으로 작용하는 약물이다. Abl 티로신 키나아제와 c-Src 티로신 키나아제는 아미노산 서열의 유사성이 47 퍼센트에달한다. 우리는 분자 동역학 시뮬레이션과 분자 도킹 기술을 이용하여,c-Src 티로신 키나아제와 이마티닙의결합에 대한 연구를 하였다. 타겟 분자 동역학 시뮬레이션을 통해, c-Src 티로신 키나아제의 비활성상태에서 활성 상태로의 구조 변화 과정을 분자 동역학 시뮬레이션을 이용하여 생성하였다. 이마티닙은 c-Src 티로신 키나아제 구조에 따라, 서로 다른 영역에 결합 하는 것으로 나타난다. 이를 통해, 여러 형태의 구조중에서, 이마티닙이 가장 안정적으로 결합하는 c-Src 티로신 키나아제 구조가 존재하는 것으로 추정된다.

영어초록

c-Src tyrosine kinase plays a key role in cell differentiation and growth. Imatinib (Gleevec®) is an effective inhibitor for suppressing the activity of Abl-tyrosine kinase. c-Src tyrosine kinase has a 47 percent similarity to Abl tyrosine kinase in the amino acid sequence. We investigate the binding of imatinib to c-Src tyrosine kinase by using MD simulation and molecular docking. In particular, we use a targeted MD simulation to generate several conformational structures in the process of the conformational change of c-Src tyrosine kinase from an inactive state to an active state. The results establish that most stable conformation of c-Src tyrosine kinase to imatinib, from among the various conformations, has the highest binding affinity.

참고자료

· 없음