원핵생물 2,296개에 분포된 보존적 유전자 (Conserved Genes Distributed among 2,296 Prokaryotes)

서지정보

· 발행기관 : 한국생명과학회
· 수록지 정보 : 생명과학회지 / 35권 / 2호 / 202 ~ 207페이지
· 저자명 : 이동근

초록

저자는 이전에 원핵생물 1,309개에 분포된 COGs (clusters of orthologous groups of proteins)에 관하여 연구하였다. COG 데이터베이스가 2024년에 2,296개의 원핵생물로 업데이트되어, 새로운 연구결과를 보고한다. 전체 4,981종류의 COG 중 각 원핵생물은 82‒2,294 종류를 보유했고 1,001–2,000 종류를 가진 원핵생물이 전체의 81.71%였다. 문(phylum) 수준에서 보유한 COG 종류의 평균은 575.42 (Mycoplasmatota 문)‒1,879.24개 (Myxococcota 문) 사이였다. 각 COG에 속하는 단백질 수는 2개에서 35,457개 사이였고, 상위 11종류 COG들은 18,990개 이상의 단백질을 가졌다. 이 상위 11개 COG들의 기능은 DNA에 결합하고 유전자 발현에 관여하는 COG가 5종류, 호흡 연쇄에 필요한 ubiquinone/menaquinone 합성 관련이 2종류였고 나머지 4개는 각각 1종류씩 다양한 물질대사에 활용되는 NAD(P) 대사, 세포벽 합성, 아라비노스 유출, 신호전달 이었다. 원핵생물 2,296개 중 2,270개 이상에서 공통적인 24종류의 COG 중 23종류는 단백질 합성과 관련되었다. 이 연구는 원핵생물의 생명 현상 이해와 약물 개발에 기여할 것으로 기대된다.

영어초록

The author previosuly reported on COGs (clusters of orthologous groups of proteins) distributed in 1,309 prokaryotes. This study report new findings as the COG database was updated to 2,296 prokaryotes in 2024. Among the total 4,981 COG IDs, the number of COG IDs possessed by each prokaryote ranged from 82 to 2,294, and prokaryotes possessing 1,001 to 2,000 COG IDs accounted for 81.71% of the total. The average number of COG IDs at the phylum level ranged from 575.42 (phylum Mycoplasmatota) to 1,879.24 (phylum Myxococcota). The number of proteins belonging to each COG ranged from 2 to 35,457 and the top 11 COGs contained more than 18,990 proteins. The functions of top 11 COGs are as follows: five are involved in DNA binding and gene expression, two in ubiquinone or menaquinone synthesis for respiratory chain, and remaining four are related to NAD(P) metabolism, cell wall synthesis, signal transduction, and arabinose efflux, respectively. Among the 24 COG IDs common to more than 2,270 among 2,296 prokaryotes, 23 IDs were related to protein synthesis. This study is expected to contribute to understanding the life phenomena of prokaryotes and developing new drugs.

참고자료

· 없음