레닌저 생화학 5~8장 (Lehninger Principles of BIOCHEMISTRY)

소개

- 레닌저 생화학 8판 (원서) 5~8장 정리본입니다.
- 교과서보단 핸드아웃 위주로 정리된 글입니다.
- 핸드아웃 (ppt)으로 제공된 이미지 자료에 대한 해석이 포함되어 있습니다.
- 중간/기말 시험지가 모두 영어로 작성되었기 때문에, 고유명사 혹은 일부 동사나 형용사가 영어로 표기되어 있습니다.
- 일부가 약자로 표기되어 있습니다.
: ptn=protein, aa=amino acid, H=hormone

목차

Chapter 1. Protein function
Chapter 2. Enzyme
Chapter 3. Carbohydrates and glycobiology
Chapter 4. DNA- based information technology

본문내용

1. Introduction
■ 단백질의 기능 by. 다른 분자와의 상호작용
- 단백질은 상호작용하는 분자의 conformation (구조), configuration (구성)을 바꾸거나 바꾸지 않을 수 있음.
- ligand: 단백질과 reversibly (가역적으로) 결합하는 분자. ex. 효소의 기질 (대부분 가역적 상호작용)
- 단백질의 binding site: ligand는 특이적+선택적으로 단백질의 site에 결합함. ex. 효소의 actalytic/active site

2. Reversible binding of a protein to ligand
2-1. Myoglobin (in. 근육), hemoglobin (in. RBC)
- Oxygen binding protein인 Globin의 일종. ex. Neroglobin, cytoglobin
- Mb의 8개 α-helix segment 중, α-helix F의 proximal His와 coordinate 하는 Fe+과 O2가 결합함. (1:1)
- O2는 낮은 용해도를 가짐 → 체내에서 O2의 수송과 저장을 위한 단백질을 필요로 함. (=Mb, Hb)
- O2는 Hb와 Mb의 Fe [in. Heme. (⊂ prosthetic group, 보결 분자단)]과 결합함. 단백질과 결합하는 것
아님!! cf. Cu와도 결합 가능

2-2. Heme
- Prosthetic group (보결 분자단)의 일종. cf. cofactor와 달리 단백질과 공유결합을 형성함.
- Fe+와 결합된 protoporphyrin ring 구조를 가짐. (280nm에서 흡광도 가짐.)
- Fe+는 protoporphyrin ring 내부의 equatorial (적도방향) N 4개 + perpendicular (축방향) His residue의 N 1개에 의해 coordinate.
- O2 외에도 NO나 CO와도 결합할 수 있음.

참고자료

· Lehninger Principles of BIOCHEMISTRY