계산화학을 이용한 분자의 전자 구조 분석 결과레포트[물리화학실험, A+]

소개

계산화학을 이용한 분자의 전자 구조 분석 결과 레포트입니다. 본 실험 과목 A+ 받았습니다. 내용적인 측면에서 자세히 작성하였습니다.

목차

1. 실제 실험 방법
2. 결과 처리
3. 결과 분석 및 토의
4. 결론

본문내용

1. 실제 실험방법
① 슈퍼컴퓨터 서버 원격 접속하기
1) 다음과 같은 명령어를 입력하여 서버에 접속한다.

2) passwd 명령어를 사용하여 암호를 변경한다. → passwd: 1 enter

② Avogadro 프로그램 실행 후 H2 분자에 대한 입력 파일 생성하기
1) 왼쪽 ‘Element’에서 수소(hydrogen)를 선택하여 수소 분자를 그린다.
2) 위쪽 ‘Extensions’에서 ‘Optimize Geometry’를 선택하여 구조 최적화를 수행한다. → 0.708 A'

3) ‘Extensions’에서 ‘Orca’ 의 ‘Generate Orca Input'을 선택하여, 하단부에 자동 생성된 입력값을 복사한다.

4) vi H2_sp.in 새 텍스트 파일을 생성한다.
5) i를 입력하여 편집 모드로 들어간다.
6) 복사한 입력값을 붙여 넣는다.
* RHF.(Restricted Hartree Fock): 전자의 움직임을 제한함을 의미한다.
7) ‘esc → :wq → enter‘를 눌러 종료한다.

참고자료

· PySCF 개발자, Self-consistent field (SCF) methods
· WIKIPEDIA, Coupled cluster
· WIKIPEDIA, Electronic correlation
· 허가현, 이광렬, 키보드 위의 화학-계산과학을 이용한 재료연구, 화학세계, 2014.