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생화학 실험/실습 보고서 (전기영동을 이용한 단백질의 관찰)2025.01.231. SDS-PAGE SDS-PAGE는 도데실황화 나트륨 폴리아크릴아마이드 겔 전기영동으로, 단백질이 전기장에 가해진 gel에서 크기에 따라 이동속도가 다름을 이용해 이들을 분리 및 분석하는 기법이다. SDS는 단백질의 3차원 구조를 풀어주고 단백질이 같은 전하/분자량을 가지도록 만들어준다. 단백질이 running gel에서 크기에 따라 이동성을 다르게 나타내는 원리를 이용하여 단백질을 분리한다. 2. 등전점 전기영동 등전점 전기영동은 단백질을 pH 기울기가 존재하는 gel에 놓고 전기장을 가해 주면, 단백질이 환경에 따른 전하를 ...2025.01.23
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10_PAGE를 이용한 단백질 검정 보고서2025.01.181. 단백질의 구조와 기능 단백질은 수백에서 수만 개의 아미노산으로 이루어진 중합체이다. 아미노산은 아미노기와 카복실기를 가지고 있는 단량체로, 곁사슬의 성질에 따라 소수성, 친수성, 염기성, 산성 등으로 구분된다. 단백질은 1차, 2차, 3차, 4차 구조를 가지며, 이러한 구조에 따라 다양한 기능을 수행한다. 단백질은 효소, 구조 단백질, 운동 단백질, 신호 단백질, 수용체 단백질, 수송 단백질, 방어 단백질, 저장 단백질 등 다양한 종류가 있다. 2. 단백질 합성 과정 단백질 합성은 mRNA, 리보솜, tRNA를 이용하여 이루어...2025.01.18
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PAGE를 이용한 단백질의 검정2025.05.131. 단백질의 구조와 기능 단백질은 아미노산이라는 작은 구성인자의 중합체이며, 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조, 4차 구조로 이루어져 있다. 단백질은 효소, 호르몬, 항체, 수송 단백질, 수용체 단백질, 운동 단백질, 구조 단백질 등 다양한 기능을 수행한다. 단백질은 pH, 염의 농도, 온도 등의 변화에 의해 변성될 수 있다. 2. 전기영동을 이용한 단백질 분리 전기영동은 전기적 힘을 이용하여 단백질과 같은 큰 분자들을 gel에서 이동시켜 크기에 따라 분리하는 기술이다. SDS-PAGE는 SDS와 polyacrylamide를 이...2025.05.13
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대장균에서 재조합 단백질의 생산과 Western blot에 관한 실험2025.01.131. IPTG IPTG는 대장균 lactose operon의 효소합성을 유도하는 강력한 유도물질이다. 보통 유도물질은 operon의 활동에 의해 만들어지는 β-D-galactosidase에 의해 대사 이용하는 것이 많지만, IPTG는 분해되지 않아 비대사성 유도물질이라고도 불린다. 또한, 고농도로 사용시 galactoside permease가 없는 세포에도 투과할 수 있기 때문에 permease가 없는 균주에서의 유도실험에도 사용된다. 2. Buffer condition Tank buffer에는 glycine과 Cl-(Tris-ba...2025.01.13
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PAGE를 이용한 단백질 검정 실험 보고서2025.05.141. 단백질 전기영동 이번 실험은 단백질의 전기영동을 통해 말 혈청 속 단백질의 크기를 확인하기 위한 실험입니다. 전기영동은 주로 단백질의 순도나 성질의 분석 및 분리에 사용하는 방법으로, 단백질 분자가 이동하는 속도는 각 단백질이 가지고 있는 전기적 or 물리적 상태에 따라 서로 다르기 때문에 분리가 일어나게 됩니다. 이번 실험에서는 SDS-PAGE 방법을 사용해 실험을 진행했습니다. 2. SDS-PAGE 원리 SDS-PAGE는 Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis...2025.05.14
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Cycloheximide chase assay를 이용한 단백질 half-life 측정2025.01.141. 단백질 분해 경로 세포 내에는 주요한 단백질 분해 경로인 ubiquitin-proteasome pathway와 autophagy-lysosome pathway가 존재한다. 이 두 경로를 통해 세포 내 단백질이 분해되며, 특정 단백질의 half-life는 이 분해 경로에 따라 달라진다. 2. cycloheximide의 작용 기전 cycloheximide는 진핵세포의 단백질 번역 과정을 억제하여 새로운 단백질 합성을 막는다. 따라서 기존에 존재하던 단백질만 남게 되어 시간에 따른 단백질 분해 정도를 관찰할 수 있다. 3. 단백질 ...2025.01.14
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단백질 검출 실험: BCA assay, 뷰렛반응, 닌히드린 반응2025.01.131. 단백질 단백질은 아미노산이 펩티드 결합으로 연결된 복잡한 사슬구조의 고분자 물질이다. 단백질의 존재를 증명하기 위해서는 발색반응을 사용할 수 있는데, 단백질 분자에 포함된 반응기가 특수한 시약과 어울려서 나타내는 반응이다. 2. BCA assay BCA assay는 알칼리의 조건에서 단백질의 펩타이드 결합과 반응하여 Cu2+가 Cu+로 환원되고, 이후 2분자의 Bicinchoninic acid(BCA)가 환원된 Cu+와 배위 결합해 562nm에서 최대 흡광도를 가지는 강한 보라색을 띠는 반응을 이용한다. Cu+의 생성은 곧 단...2025.01.13
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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SDS-PAGE를 통한 단백질 분리 실험2025.01.031. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 기법으로, 단백질을 SDS로 변성시켜 모든 단백질이 유사한 전하/분자량 비를 가지도록 만든 후 전기영동을 통해 분리한다. 이 실험에서는 SDS-PAGE의 원리와 사용되는 시약들의 특성을 이해하고, 실제로 단백질 분리 실험을 진행하여 결과를 분석하였다. 2. 단백질 변성 SDS는 단백질의 3차원 구조를 풀어 선형 구조로 만들어 주며, 단백질에 음전하를 부여한다. 이를 통해 단백질의 고유 전하와 상관없이 분자량에 따라 분리할 수 있게 된다. 실험에서는 단백질 시료를...2025.01.03
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서강대학교 일반생물학실험1 실험 6. GFP 단백질과 단백질 정량 (Protein Measurements)2025.01.021. 단백질 정량 방법 실험에서는 Lowry assay와 Extinction coefficient assay 두 가지 단백질 정량 방법을 사용하여 EGFP의 질량농도를 측정하였다. Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction을 거쳐 750nm에서 흡광도를 측정하고 BSA 표준곡선을 이용하여 EGFP 농도를 계산하였다. Extinction coefficient assay는 EGFP의 몰흡광계수와 Lambert-Beer's Law를 이용하여 488nm에서 EGFP 농도를 직접 계산하였다. 두 방법의 ...2025.01.02
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