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Western Blotting2025.01.211. Western Blotting Western blotting은 sample 내 특정 단백질의 존재 여부나 크기, 양 등을 확인하는 실험법으로, 해당 단백질과 결합하는 antibody를 이용하여 단백질을 찾아내는 방식을 이용한다. 이 실험을 통해 western blotting의 과정과 원리를 이해할 수 있다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS(Sodium Dodecyl Sulfate)로 coating 된 단백질을 2PAGE(Polyacrylamide Gel Electrophoresis)를 통해 크기에 따라 분리하는 ...2025.01.21
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[충남대] 분자생물, 생화학 실험 보고서12025.01.281. 대장균 배양 실험에서는 대장균(Escherichia coli, E. coli.)을 이용하여 실험을 진행하였다. 대장균은 정온동물의 창자에서 많이 볼 수 있는 박테리아로 단백질 발현에 대해 가장 일반적인 숙주이다. 대장균은 실험실에서 보관과 배양이 용이하다는 장점이 있어 주로 사용하는 원핵생물 모델이며, 자가복제를 하는 DNA 고리인 Plasmid DNA를 가지고 있다. 이는 DNA vector(운반체)로써 유전자 재조합 기술의 중요한 재료이다. 2. 배지 제조 실험에서는 TB(Terrific broth) 배지를 사용하였다. T...2025.01.28
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생화학 실험/실습 보고서 (전기영동을 이용한 단백질의 관찰)2025.01.231. SDS-PAGE SDS-PAGE는 도데실황화 나트륨 폴리아크릴아마이드 겔 전기영동으로, 단백질이 전기장에 가해진 gel에서 크기에 따라 이동속도가 다름을 이용해 이들을 분리 및 분석하는 기법이다. SDS는 단백질의 3차원 구조를 풀어주고 단백질이 같은 전하/분자량을 가지도록 만들어준다. 단백질이 running gel에서 크기에 따라 이동성을 다르게 나타내는 원리를 이용하여 단백질을 분리한다. 2. 등전점 전기영동 등전점 전기영동은 단백질을 pH 기울기가 존재하는 gel에 놓고 전기장을 가해 주면, 단백질이 환경에 따른 전하를 ...2025.01.23
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단백질의 분리2025.01.231. 단백질 분리 실험을 통해 원심분리를 이용하여 세포 내 단백질을 분리하는 방법을 익혔다. 단백질 분리를 위해 세포를 깨고 RIPA 버퍼에 녹인 후 원심분리하여 상층액을 얻었다. 이 상층액에는 세포에서 추출된 단백질이 포함되어 있다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질의 크기에 따라 분리하는 기법으로, 단백질이 SDS에 의해 변성되어 전하/분자량 비율이 동일해지면 전기장 내에서 크기에 따라 이동속도가 달라져 분리된다. 이를 통해 단백질의 분자량을 확인할 수 있다. 3. 세포 용해 세포를 깨는 방법에는 homogeniza...2025.01.23
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닭 배아 관찰 및 단백질 분석 보고서2025.01.021. 닭 배아 발달 닭 배아의 발달 과정을 단계별로 설명하였다. 초기 세포 분열부터 시작하여 gastrulation, 신경관 및 심장 형성, 장기 발달 등 닭 배아의 발달 단계를 자세히 기술하였다. 특히 hox 유전자가 닭 배아의 신체 구조 형성에 중요한 역할을 한다는 점을 강조하였다. 2. SDS-PAGE 전기영동 SDS-PAGE 기법의 원리와 방법을 설명하였다. SDS가 단백질의 3차 구조를 1차 구조로 풀어내고 균일한 음전하를 부여하여 단백질을 크기별로 분리하는 과정을 자세히 기술하였다. 또한 전기영동 실험 과정을 단계별로 제...2025.01.02
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대장균에서 재조합 단백질의 생산과 Western blot에 관한 실험2025.01.131. IPTG IPTG는 대장균 lactose operon의 효소합성을 유도하는 강력한 유도물질이다. 보통 유도물질은 operon의 활동에 의해 만들어지는 β-D-galactosidase에 의해 대사 이용하는 것이 많지만, IPTG는 분해되지 않아 비대사성 유도물질이라고도 불린다. 또한, 고농도로 사용시 galactoside permease가 없는 세포에도 투과할 수 있기 때문에 permease가 없는 균주에서의 유도실험에도 사용된다. 2. Buffer condition Tank buffer에는 glycine과 Cl-(Tris-ba...2025.01.13
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단백질 분리 및 전기영동2025.01.121. Lysis buffer Lysis buffer는 세포 화합물을 분석을 위해 개방형 세포를 파괴할 때 사용되는 완충액이다. 대부분의 용해 완충액은 용해물의 산도 및 삼투압을 조절하기 위해 염(NaCl)을 함유한다. 때로는 세제(Triton X-100 또는 SDS)를 첨가하여 막 구조를 해체할 수도 있다. 또한 용해 완충액은 동물과 식물의 조직 세포 모두에서 사용할 수 있다. 2. Bradford assay Bradford assay 단백질 정량(시료 내에 포함된 단백질 양, 농도를 구하는 과정)법 중 하나로 UV-Visible ...2025.01.12
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Cell harvest and protein assay2025.01.231. Cell harvest 세포 배양 시 adherent cell과 suspension cell로 구분할 수 있으며, adherent cell을 harvest하는 방법에는 화학적 방법(trypsin, accutase 사용)과 물리적 방법(scraper 사용)이 있다. 이번 실험에서는 물리적 방법인 scraper를 사용하여 adherent cell을 harvest하였다. 2. Protein extraction 세포 내 단백질을 추출하기 위해 lysis buffer와 phosphatase/protease inhibitor를 사용하여 ...2025.01.23
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Simple tandem repeat를 이용한 인간유전형 분석2025.01.231. 유전자 분석 이 실험은 simple tandem repeat(STR)를 이용하여 인간 유전자의 allelic variation을 분석하는 것을 목적으로 합니다. PCR과 PAGE 분석을 통해 개인과 집단 내에서 alleles의 발현 양상을 확인하고, 유전학적 개념들을 이해하고자 합니다. 2. 유전자 다형성 인간 유전체에는 반복되는 simple sequence가 존재하며, 이 부분의 반복 횟수가 개인마다 다르기 때문에 allelic variation을 쉽게 관찰할 수 있습니다. PCR과 PAGE 분석을 통해 이러한 유전자 다형성...2025.01.23
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Protein Regulation2025.01.181. Auxin-induced degron system Auxin-induced degron system은 특정 target protein을 원하는 상황에서 제거하기 위해 사용되는 방식으로, AID가 결합된 protein과 OsTir1이 같이 존재할 경우에 IAA(auxin)가 존재하지 않을 경우에는 정상적으로 protein이 존재할 수 있지만, IAA가 존재할 경우 IAA가 AID와 OsTir1을 연결하는 bridge 역할을 하고 polyubiquitin 구조가 형성되며 이는 이후 proteosome에 의해 빠르게 분해되어 pro...2025.01.18
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