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Lewin's Essential GENES 분자생물학 4판 정리노트 03. 분단된 유전자2025.05.101. Exon과 Intron Exon은 단백질 암호화 부위(coding region)이며, Intron은 noncoding region으로 RNA splicing 과정에서 제거됩니다. Exon의 순서는 DNA와 RNA 모두 동일합니다. 2. 분단된 유전자의 구조 분단된 유전자는 Exon과 Intron으로 구성되어 있습니다. Intron은 mRNA와 hybridization되지 않고 loop가 형성됩니다. 단백질 서열의 변화에 직접적으로 영향을 미치는 돌연변이는 Exon에서 일어납니다. 3. Exon과 Intron의 진화 Exon 서...2025.05.10
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생물학실험1_생물 정보학2025.05.011. 생물정보학 생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문입니다. 생물정보학은 유전체 서열에서 유전자를 찾아내고 데이터베이스 자료와 비교하여 유사성 정도를 확인하며 유전자 산물의 구조와 기능을 예측하고 진화적인 관계를 유추하는 등 많은 일에 사용됩니다. BLAST와 같은 생물정보학 프로그램은 다양한 단백질들의 아미노산 서열이나 DNA 염기서열을 비교하는 알고리즘입니다. 이를 통해 새로운 유전자를 발견하고 유사한 유전자를 찾을 수 있습니다. 2. BLAST BLAST는 뉴클레오타이드 서열이나 아미노산 ...2025.05.01
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나노의생명공학 레포트입니다.2025.05.081. Corona virus 코로나바이러스는 27~32 kb 길이의 단일가닥 감염성 있는 양성 RNA 게놈을 가지며, 바이러스 입자 표면에 곤봉 모양의 Spike 단백질이 존재한다. 코로나바이러스의 감염은 숙주세포의 수용체와 비리온(virion)의 결합에 의해 개시되며, 바이러스 Spike 단백질이 숙주세포의 수용체 결합에 중요한 역할을 한다. 코로나바이러스의 유전체 RNA로부터 replicase 단백질이 만들어지며, 비구조단백질(nsp3, nsp4, nsp6)에 의해 형성되는 이중막 소포(DMVs)가 바이러스의 RNA 합성과 전사...2025.05.08
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석)2025.01.231. Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석 본 실험에서는 구강 상피세포를 채취하여 PCR로 증폭시키고 PAGE를 이용하여 밴드의 발현양상을 통해 STR을 분석하였다. 인간의 유전자 sequence는 거의 유사하지만 genome상의 simple sequence가 나타나는 부위와 그 크기는 차이가 있다. Simple sequence에서 반복되는 숫자는 allele에 따라 다른데 이 부분을 DNA 비교분석으로 allelic variation을 조사하는 것이다. 밴드의 발현양상을 STR을 분석가능한데 인간의 경우에...2025.01.23
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Genome editing / knockout 벡터 확립 및 도입2025.05.031. Genome Editing Genome Editing은 생명체의 특정 염기서열을 교정하거나 편집하는 기술을 의미한다. 이러한 Genome editing 기술에는 과거부터 이용되었던 Zinc finger nucleases나 TALEN을 이용하는 방법이 있었으나 현재는 높은 정확도와 효율성을 갖추고, 비교적 쉽게 디자인할 수 있는 기술인 CRISPR을 주된 tool로써 사용하고 있다. CRISPR/Cas9 기술은 효소가 절단하는 부분의 염기서열을 guide RNA(gRNA)로서 인위적으로 제공해주어 원하는 부분의 DNA를 절단하도...2025.05.03
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Realtime PCR을 이용한 유전자 발현 분석)2025.01.231. RNA sequencing RNA sequencing은 DNA로부터 전사되는 모든 RNA 전사체의 염기서열을 차세대 분석기술을 사용하여 분석하는 기술이다. RNA sequencing을 위해서는 cDNA가 필요한데 cDNA를 준비하는 일반적 과정은 보통 RNA 추출>RNA 선택>cDNA 합성>라이브러리 제작으로 이루어진다. RNA 염기서열 분석 기술을 통해 alternative RNA splicing, 유전자의 발현량, 염기서열의 변이, gene fusion, single nucleotide polymorphism, SNP 등의...2025.01.23
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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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DNA cloning 방법/enzyme, transformation, selection mark/생화학 보고서2025.01.201. DNA cloning 방법 DNA cloning은 타깃 유전자를 박테리아의 게놈에서 잘라내어 plasmid에 삽입하는 과정입니다. 이 과정에서 restriction enzyme을 사용하여 유전자를 자르고, ligase를 사용하여 유전자를 plasmid에 붙입니다. 이렇게 만들어진 recombinant vector는 박테리아에 형질전환되어 증폭됩니다. 형질전환 과정에서는 열처리를 통해 세포막을 열어 plasmid가 들어가게 하며, 항생제 내성 유전자를 선별 마커로 사용하여 형질전환된 세포를 선별합니다. 2. Enzyme 사용 D...2025.01.20
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CRISPR를 이용한 만성골수성백혈병 유전자 전위의 복구2025.01.281. 만성골수성백혈병 만성 골수성 백혈병은 필라델피아 염색체를 지닌 조혈모 세포의 클론이 비정상적으로 확장되면서 골수 내에 비정상 세포가 과도하게 증식하여 생기는 질환입니다. CML의 원인은 9번 염색체와 22번 염색체의 각각에서 일정 부분이 절단된 후에 두 조각이 서로 위치를 바꾸어 이동하는 전위에 의해서 생긴 필라델피아 염색체에 의해서 발병합니다. 이 전위로 인해서 9번 염색체의 ABL 유전자와 22번 염색체의 BCR 유전자의 융합이 일어나게 되고, BCR-ABL 융합 유전자로 인해 비정상적인 타이로신 카이네이즈의 활성을 가지는...2025.01.28
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Real-time PCR을 이용한 유전자 발현 분석2025.01.231. 전사(Transcription) 수준에서의 유전자 발현 분석 기법들 유전자 발현 분석 기법에는 Single gene analysis와 Whole genome analysis가 있다. Single gene analysis는 개별 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 Northern Blotting과 Real-time PCR이 있다. Whole genome analysis는 세포 내 전체 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 RNA sequencing이 있다. 2. cDNA 합성에 사용될 수 있는 primer의 종류 cDN...2025.01.23
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