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박테리아에서 DNA 분리2025.01.271. plasmid DNA 분리 실험 목적은 plasmid DNA 분리에 대해 이해하고, 그 과정 중 하나인 plasmid mini-preparation에 대해 알아보는 것이다. plasmid DNA 분리법의 공통적인 세 단계는 overnight culture, mini preparation, 순수한 plasmid DNA 분리 과정이다. mini-prep은 plasmid DNA를 소량 분리하는 방법으로, 알칼리 조건에서 세포를 파괴시켜 DNA만을 분리하는 것이다. 2. plasmid DNA 분리 시약 실험에 사용된 시약은 LB 배지...2025.01.27
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일반화학실험 '전기 영동' 예비 레포트(pre_report) A+ 자료2025.01.201. 전기영동 전기영동의 원리를 이해하고 이를 이용하여 DNA의 크기를 확인해 본다. 전기영동은 전류를 흘려보낼 수 있는 장치 안에 담겨있는 용액 속에 전하를 띈 입자를 넣은 뒤, 전기장을 형성시켜 입자를 이동시키는 방법이다. DNA, RNA, 단백질과 같은 물질들은 전하를 띄고 있어 전기영동 방법을 적용할 수 있으며 분리가 가능하다. 전기영동법에서 자주 사용되는 지지매질로 Agrose Gel을 사용하는 겔 전기 영동법과 Polyacrylamide gel을 사용하는 전기 영동법(Polyacrylamide gel, PAGE)이 있다....2025.01.20
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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2주차_pipetting, 50X TAE buffer preparation2025.05.141. Pipetting 사용법 및 주의사항 피펫은 액체 시료를 옮길 때 사용하는 실험기구로, 일체형으로 구성된 유리 피펫부터 전자 피펫까지 그 종류가 매우 다양하다. 피펫은 부분적으로 진공을 만들고, 선택적으로 진공을 풀 때 액체가 끌려오는 현상을 이용한다. 마이크로 피펫의 경우 1~1000 μL 범위에 해당하는 액체를 옮길 때 사용하며, 세부적으로 P10, P20, P200, P1000 등으로 구분할 수 있다. 피펫의 구조는 버튼(plunger), volume adjustment knob 등으로 구성되어 있으며, 용액을 옮길 때는...2025.05.14
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DNA 전기영동 실험 예비 보고서2025.04.281. DNA 전기영동 DNA 전기영동은 전하를 띠고 있는 DNA 분자가 전기장 내에서 이동하는 성질을 이용하여 DNA 분자를 분리하고 분석하는 실험 기법입니다. 이 실험에서는 아가로스 젤을 매질로 사용하며, DNA 분자의 크기와 구조에 따라 이동 속도가 달라져 분리가 가능합니다. 또한 EtBr(Ethidium Bromide)를 사용하여 DNA 밴드를 형광 발광으로 확인할 수 있습니다. 2. 전기영동의 원리 전기영동은 전하를 띤 물질이 전기장 내에서 이동하는 성질을 이용하여 물질을 분리하는 기법입니다. DNA는 인산기 때문에 음전하를...2025.04.28
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Agarose gel electrophoresis2025.05.141. Gel electrophoresis의 원리 Gel electrophoresis는 전기 영동으로, 단백질, 핵산과 같이 전하를 가진 물질이 전기장 존재 환경에서 반대쪽 극을 향해 움직이는 성질을 이용해서 물질을 분리한다. 분자의 이동속도에 영향을 주는 요인은 입자 요인(전하량, 크기, 모양)과 환경 요인(pH, 점성도, 이온 농도, 이온 세기, gel 종류)이 있다. 전기 이동도(μ)를 통해 입자의 이동속도를 이해할 수 있으며, gel의 농도가 높아질수록 미세한 구멍의 크기가 작아져 분자의 이동 속도가 느려진다. 2. Agaro...2025.05.14
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[생화학실험] A+, PCR 및 agarose gel 전기영동 실험2025.01.071. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 원하는 DNA band만을 증폭 가능하며, 이때 DNA polymerase가 사용된다. 30-40 cycle 정도 반복하여 증폭하고자 하는 표적 DNA의 한 DNA 사슬 3'말단에 상보적인 것과 그 반대 사슬의 3'말단에 상보적인 2개의 특정 올리고데옥시뉴클레오티드를 합성하고, 이를 원하는 절편을 함유한 변성된 한 가닥의 표적 DNA와 혼성화 반응 시킨다. DNA polymerase는 Taq DNA polymerase를 사용하며, 이는 열에 안정성이 있는 DNA...2025.01.07
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람다 파지 DNA 관찰, PFU test 및 Optical mapping_서강대학교 바이오융합기술프로젝트1 레포트2025.01.191. λ phage DNA 관찰 실험에서는 DNA damaging을 이해하기 위한 첫 단계로 λ phage를 이용하여 DNA observation을 진행하였다. DNA가 포함된 plug에 proteinase K를 처리하여 phage의 구조 단백질과 DNase를 제거하고, (+)전하 cover glass 위에 DNA를 고정시켜 관찰하였다. PDMS nanochannel을 사용하여 DNA가 일직선으로 펴지도록 하여 관찰하였다. 2. PFU test PFU test를 통해 미지의 농도의 λ phage 용액 내 phage 입자의 개수를 확...2025.01.19
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[일반생물학실험] Plasmid DNA - 전기영동2025.01.031. DNA 전기영동 DNA 전기영동은 DNA를 크기에 따라 분리하는 기술입니다. DNA는 인산기를 가지고 있어 전기영동 완충용액에서 음전하를 띠게 되며, 전류를 흘려주면 양극 쪽으로 이동하게 됩니다. DNA 분자량이 클수록, agarose 농도가 높을수록, 전압이 낮을수록 이동속도가 느려집니다. 또한 DNA 구조에 따라서도 이동속도가 달라집니다. 전기영동 후 ethidium bromide로 염색하면 UV 조사 시 형광을 발하여 DNA를 확인할 수 있습니다. 1. DNA 전기영동 DNA 전기영동은 생명과학 분야에서 매우 중요한 기술...2025.01.03
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일반생물학실험 결과레포트 [실험9] 핵산과 단백질 정량2025.05.131. 핵산 정량 실험을 통해 추출한 plasmid DNA의 농도를 spectrophotometer로 측정하였다. 측정 결과 DNA 농도는 52.00ug/ml로 나타났다. DNA의 순도를 확인하기 위해 A260/A280과 A260/A230 비율을 계산하였다. A260/A280 비율은 2.080으로 순수한 DNA 범위인 1.8-2.0을 벗어나 있어 DNA가 손상되었거나 오염되었음을 알 수 있다. A260/A230 비율은 0.881로 순수한 DNA 범위인 2.0-2.2를 크게 벗어나 있어 EDTA, 탄수화물, 유기용매 등의 오염이 있는 ...2025.05.13
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