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PlasmidDNA Purification & Sanger Sequencing 보고서2025.01.211. Bacterial transformation 박테리아 transformation은 특정 DNA 조각을 박테리아의 유전체 내로 삽입하여 새로운 유전형질이 발현되도록 하는 방법입니다. 박테리아 plasmid는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site와 항생제 내성 유전자를 가지고 있어 외부 유전 물질을 자유롭게 삽입할 수 있습니다. 이를 통해 약 8kb의 긴 DNA 조각을 박테리아 plasmid에 삽입하여 복제할 수 있습니다. 2. Liquid LB culture 및 Colony inoculat...2025.01.21
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DNA 염기서열 분석과 진단의 적용2025.01.291. 생어 염기서열 분석(Sanger Sequencing) 생어 염기서열 분석은 1975년 영국의 생화학자 프레더릭 생어가 개발한 방법으로, DNA 복제 시 진행되는 DNA 중합효소 반응을 기반으로 하여 DNA 서열을 읽어내는 방식이다. 이후 자동화 기계가 개발되면서 인간유전체사업의 성공에 기여했고, 최근에는 차세대염기서열분석(NGS)이 개발되어 다양한 연구와 진단에 이용되고 있다. 2. 자동화 염기서열 분석 생어 염기서열 분석의 자동화를 위해 형광이 표지된 primer를 이용하여 각 튜브에서 반응이 끝난 산물을 하나로 합쳐 전기영...2025.01.29
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유전자와 유전자 활성 연구를 위한 분자도구2025.01.181. 서던블롯 서던블롯은 특정 DNA 절편을 동정하는 데 사용되는 기술입니다. 이 방법은 genomic DNA를 제한효소로 자른 후 아가로스 겔 전기영동을 통해 크기별로 분리합니다. 그리고 DNA를 변성시켜 nitrocellulose 또는 nylon 멤브레인으로 이동시킵니다. 이렇게 이동된 DNA는 방사선 동위원소나 비방사선 물질로 표지된 DNA 또는 RNA 탐침과 하이브리다이제이션되어 자기방사법 등을 통해 검출됩니다. 이 기술은 genomic DNA뿐만 아니라 plasmid, cosmid, bacteriophage 등의 분석에도 ...2025.01.18
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AI와 DNA 시퀀싱2025.01.151. 유전자와 AI DNA 시퀀싱은 유전자의 염기서열을 알아내는 과정으로, 인간의 염색체에는 30억 쌍의 염기서열이 있어 엄청난 크기의 데이터를 다루게 된다. 이에 유전학에서는 막대한 양의 데이터를 처리하고자 AI를 사용하고 있으며, 대표적인 분야가 AI 시퀀싱이다. 2. DNA 시퀀싱 DNA 시퀀싱은 생화학적 방법으로 생명체의 모든 세포의 DNA 염기서열을 분석하는 기술이다. 과거에는 30억 개의 DNA 염기서열을 분석하는데 13년과 30억 달러가 소요되었으나, 현재는 기술 발달로 비용이 크게 감소했다. 다양한 DNA 시퀀싱 방법...2025.01.15
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아주대학교 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서2025.04.261. 생물정보학 생물정보학(bioinformatics)은 생물학과 컴퓨터의 정보학이 융합되어 발전된 학문으로, 생물의학을 포함한 다양한 과학 연구 분야를 지원하기 위해 정보 저장, 배포 및 분석을 위한 기술과 생물 데이터를 연결하는 하이브리드 과학이다. 본 실험에서는 생물정보학 Tool의 사용법을 익히고, 미지 유전자를 데이터베이스에 대조하여 서열을 탐구하며, 단백질 서열의 유사성을 비교해 보았다. 2. 핵산(nucleic acid) 핵산은 분해되어 인산, 당 및 유기 염기의 혼합물(퓨린 및 피리미딘)을 생성할 수 있는 자연 발생 ...2025.04.26
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Bioinformation: Analyzing Gene Sequences Using NCBI and BioEdit2025.01.061. 코돈(Codon) 코돈은 DNA에서 전사된 mRNA의 3염기 조합을 의미합니다. mRNA의 유전암호의 단위로, 이것에 의해 세포 내에서 합성되는 아미노산의 종류가 결정됩니다. 개시코돈(AUG)은 단백질 번역을 시작하는 첫 번째 코돈이며, 종결코돈(UAA, UAG, UGA)은 단백질 합성 과정이 끝났음을 알리는 신호로 작동합니다. 2. NCBI 데이터베이스 활용 NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 웹 기반 생물학 데이터베이스로, 유전자 및 단백질 정보를 얻을 수 있습니다...2025.01.06
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아주대 생명과학실험 생물정보학 실습2025.01.131. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 분석하고 해석하기 위한 분야로, 데이터 세트가 크고 복잡한 경우에 특히 유용하다. 이 분야는 생물학, 화학, 물리학, 컴퓨터 과학, 컴퓨터 프로그래밍, 정보 공학, 수학 및 통계를 포함한 다양한 학문을 통합하여 생물학적 데이터를 분석하고 해석한다. 생물정보학의 주요 응용 분야에는 유전체학, 단백질체학, 이미지 및 신호 처리, 텍스트 마이닝, 생물학적 및 유전자 온톨로지 개발, 유전자 및 단백질 발현 및 조절 분석 등이 포함된다. 2. BLAST BLAST(Basic Local Align...2025.01.13
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개인 유전체 분석 시스템 (염기서열 분석)2025.04.261. 개인 유전체 분석 시스템 개인 유전체 분석 시스템은 개인의 유전 정보를 분석하여 건강 상태와 질병 위험을 파악하는 시스템입니다. 이 시스템은 유전체 해독 기술의 발전과 개인의 건강에 대한 관심 증가로 인해 최근 급격히 확산되고 있습니다. 유전체 분석 시스템은 전장 유전체 분석, 엑솜 분석, 유전자 패널 분석, 단일 염기서열(SNP) 분석 등 다양한 방식으로 이루어지며, 이를 통해 개인의 유전적 특성과 질병 위험을 파악할 수 있습니다. 2. 유전체 분석 시스템의 원리 유전체 분석 시스템의 핵심 원리는 DNA의 염기서열을 분석하는...2025.04.26
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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인간 게놈 프로젝트와 유전병 치료2025.01.291. 인간 게놈 프로젝트 인간 게놈 프로젝트는 인간 DNA를 구성하는 약 30억 쌍의 뉴클레오타이드 염기쌍을 염기 서열화하는 것을 목적으로 진행되었다. 현재 인간 유전자는 약 20,000개에서 25,000개 정도가 있다고 밝혀졌으며, 이 정보를 활용하여 질병 유전자를 확인하고, 유전 질환에 대한 검사와 치료법을 개발할 수 있게 되었다. 2. 계층별 염기 서열법 계층별 염기 서열법은 인간의 염색체를 토막내어 약 200킬로 염기쌍 크기로 벡터에 저장한 게놈 도서관을 만들고, 서로 중복되는 클론들을 찾아내어 배열하는 방식이다. 이 방법의...2025.01.29
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