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[유전학] DNA sequencing, vector의 제작, NGS2025.05.031. DNA sequencing DNA는 단백질을 암호화 하고있는 물질로 A,T,G,C라는 기본 단위로 이루어진다. 어떤 서열을 갖고 있는 지에 따라 결과적으로 생산되는 단백질이 달라지게 되는데 이 서열을 확인하는 것은 분자생물학에 있어서 큰 의미가 있다. DNA sequencing은 그 DNA 서열을 확인하는 방법이다. 과거에는 그 방법으로 sanger method를 사용했지만 현재는 더욱 빠르고 신속하게 원하는 DNA서열을 확인할 수 있는 방법인 NGS를 통해 염기서열을 확인한다. 2. Vector 제작 우리는 DNA 재조합 기...2025.05.03
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암과 항암, NGS, 종양 유전자변이검사2025.01.181. 암 유전자 검사 암은 DNA 돌연변이로 인해 발생하는 대표적인 질환이며, 다양한 돌연변이가 암 발생에 관여한다. 유전자 검사를 통해 관련 질병의 예방, 진단, 치료계획을 수립할 수 있다. 유전자 검사 방식에는 FISH, PCR, RT-PCR, NGS 등이 있으며, 각각의 특징과 장단점이 있다. 2. 비소세포폐암 유전자 검사 비소세포폐암은 유전자 변이와 표적치료제 선택에 있어 유전자검사가 중요하다. EGFR, ALK, ROS1, KRAS 등의 유전자 변이가 관련되며, 이를 확인하기 위한 유전자검사가 권장된다. 3. 대장암 유전자...2025.01.18
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유전자 다형성과 질병의 연관성2025.01.281. 유전자 다형성 유전자 다형성은 개체군 내에서 1% 이상의 개체가 가지고 있는 유전자 변이를 말한다. 이러한 변이는 대부분 돌연변이에 의해 발생하며 개인의 질병 감수성, 약물 반응, 신체적 특징 심지어 행동 특성까지 영향을 미칠 수 있다. 2. 유전자 다형성과 질병 간의 연관성 유전자 다형성은 질병 연구에 있어 매우 중요한 역할을 한다. 특정 유전자 다형성이 특정 질병에 대한 감수성을 높이거나 낮출 수 있기 때문이다. 예를 들어, BRCA1 및 BRCA2 유전자의 특정 다형성은 유방암과 난소암의 높은 발병률과 관련이 있다. 3....2025.01.28
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AI와 DNA 시퀀싱2025.01.151. 유전자와 AI DNA 시퀀싱은 유전자의 염기서열을 알아내는 과정으로, 인간의 염색체에는 30억 쌍의 염기서열이 있어 엄청난 크기의 데이터를 다루게 된다. 이에 유전학에서는 막대한 양의 데이터를 처리하고자 AI를 사용하고 있으며, 대표적인 분야가 AI 시퀀싱이다. 2. DNA 시퀀싱 DNA 시퀀싱은 생화학적 방법으로 생명체의 모든 세포의 DNA 염기서열을 분석하는 기술이다. 과거에는 30억 개의 DNA 염기서열을 분석하는데 13년과 30억 달러가 소요되었으나, 현재는 기술 발달로 비용이 크게 감소했다. 다양한 DNA 시퀀싱 방법...2025.01.15
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DNA 염기서열 분석과 진단의 적용2025.01.291. 생어 염기서열 분석(Sanger Sequencing) 생어 염기서열 분석은 1975년 영국의 생화학자 프레더릭 생어가 개발한 방법으로, DNA 복제 시 진행되는 DNA 중합효소 반응을 기반으로 하여 DNA 서열을 읽어내는 방식이다. 이후 자동화 기계가 개발되면서 인간유전체사업의 성공에 기여했고, 최근에는 차세대염기서열분석(NGS)이 개발되어 다양한 연구와 진단에 이용되고 있다. 2. 자동화 염기서열 분석 생어 염기서열 분석의 자동화를 위해 형광이 표지된 primer를 이용하여 각 튜브에서 반응이 끝난 산물을 하나로 합쳐 전기영...2025.01.29
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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생물공정실험 결과보고서: Bacterial identification2025.01.041. Bacterial identification 이 실험 보고서는 Durham test와 Gram staining을 통해 샘플 박테리아를 식별하는 내용을 다루고 있습니다. Durham test 결과, 1조의 박테리아는 E. coli로 확인되었고, 2,3조의 박테리아는 Enterococcus faecalis와 Salmonella typhimurium으로 추정되었습니다. Gram staining 결과, 1,2조의 박테리아는 그람 음성균, 3조의 박테리아는 그람 양성균으로 확인되었습니다. EMB agar 실험을 통해 1조의 E. col...2025.01.04
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11주차_sequencing BL21 transformation2025.05.141. Sanger sequencing Sanger sequencing은 Frederick Sanger에 의해 1977년 개발된 방법으로, 500bp 이하의 DNA 서열을 결정할 때 99.99%의 매우 높은 정확도를 보인다. 이 방법은 DNA polymerase에 의한 DNA 중합 과정 중 template DNA 서열과 상보적인 염기가 결합된다는 성질을 이용하기 때문에 chain termination method 또는 dideoxynucleotide termination method라고 부르기도 한다. Sanger sequencing...2025.05.14
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개인 유전체 분석 시스템 (염기서열 분석)2025.04.261. 개인 유전체 분석 시스템 개인 유전체 분석 시스템은 개인의 유전 정보를 분석하여 건강 상태와 질병 위험을 파악하는 시스템입니다. 이 시스템은 유전체 해독 기술의 발전과 개인의 건강에 대한 관심 증가로 인해 최근 급격히 확산되고 있습니다. 유전체 분석 시스템은 전장 유전체 분석, 엑솜 분석, 유전자 패널 분석, 단일 염기서열(SNP) 분석 등 다양한 방식으로 이루어지며, 이를 통해 개인의 유전적 특성과 질병 위험을 파악할 수 있습니다. 2. 유전체 분석 시스템의 원리 유전체 분석 시스템의 핵심 원리는 DNA의 염기서열을 분석하는...2025.04.26
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식물분자생물학실험 Colony PCR 결과보고서2025.01.181. Colony PCR Colony PCR은 형질 전환 후 selective media에서 성장한 박테리아의 colony를 신속하게 screening하여 원하는 유전자가 존재하는지 확인하는 PCR 검사 기법입니다. PCR 반응 과정에서 heating step이 존재하기 때문에 대부분의 형질전환체는 lysis되어 유전물질을 방출하게 되고, 이때 방출된 유전물질을 template으로 활용하여 amplification reaction을 진행합니다. Positive Control과 Negative Control은 PCR 반응의 정확성과 ...2025.01.18
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