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마우스 꼬리로부터 게놈 DNA 추출 및 분석2025.01.041. 게놈 DNA 추출 실험을 통해 마우스 꼬리에서 게놈 DNA를 추출하는 과정을 이해하였습니다. 세포 용해, DNA 정제, 농도 측정 등의 단계를 거쳐 순도 높은 게놈 DNA를 얻을 수 있었습니다. 이 과정에서 주의해야 할 점들, 예를 들어 과도한 tapping이나 오염물질 혼입 등을 확인하였습니다. 2. DNA 전기영동 추출한 게놈 DNA를 아가로스 겔 전기영동을 통해 분석하였습니다. 10,000 bp 이상의 큰 DNA 단편이 가장 뚜렷하게 관찰되었지만 번진 모습(smear)을 보였고, 그 외에도 1,000-2,000 bp 및 ...2025.01.04
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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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새로운 박테리아 종 동정을 위한 DNA 추출2025.05.081. DNA 추출 과정 본 실험에서는 미지 균주의 DNA를 추출하는 과정을 수행하였다. 균주를 PBS에 현탁하고 원심분리하여 세척한 뒤, lysozyme과 SDS를 처리하여 세포를 용균시켰다. 이후 PCI, chloroform을 이용하여 단백질과 불순물을 제거하고 에탄올 침전을 통해 DNA를 회수하였다. 최종적으로 0.1x SSC 완충액에 녹여 DNA 농도를 측정하였다. 그러나 260/280, 260/230 비율이 이상적인 수준에 미치지 못하여 순수한 DNA 추출에는 어려움이 있었던 것으로 나타났다. 2. DNA 추출 시약의 역할 ...2025.05.08
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[A+ 보장!] 연세대 의대 의예과 1학년 General Biology 실험 레포트 Gel electrophoresis DNA & Gel extraction2025.01.141. DNA 구조와 특성 DNA는 이중 나선 구조로 구성되며, 당과 인산이 골격을 이루고 염기가 수소 결합으로 쌍을 이룹니다. DNA 염기는 아데닌, 티민, 구아닌, 시토신으로 이루어져 있으며, 이들 사이에는 특정한 상보 관계가 존재합니다. DNA 합성은 5' 말단에서 3' 말단 방향으로 일어나며, DNA 중합 효소가 중요한 역할을 합니다. Genomic DNA는 생명체의 유전 정보를 담고 있으며, 대부분의 생명체에서 히스톤 단백질과 결합한 상태로 염색체를 형성합니다. 2. DNA 추출 실험 이 실험에서는 혈액 샘플을 이용하여 Ge...2025.01.14
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RNA 추출, cDNA 합성 및 qRT-PCR2025.01.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA의 상보적 가닥에 결합하는 2개의 프라이머를 동시에 사용하여 증폭을 원하는 DNA의 특정 영역만을 in vitro에서 복제, 증폭하는 기술이다. 3단계를 거쳐 DNA를 복제하는데, 변성, 결합, 신장 과정을 반복하여 DNA를 증폭시킨다. 2. RT-PCR (Reverse Transcriptase PCR) RT-PCR은 유전자에서 만들어진 RNA에서 역전사효소를 이용하여 cDNA를 생성한 후, cDNA를 주형 가닥으로 PCR을 수행하여, 유전자의 RNA 발현...2025.01.18
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TECAN을 이용한 DNA quality check와 전기영동을 통한 대장균의 병원성 유형 확인2025.01.121. DNA 추출 및 정제 세포로부터 DNA를 분리하기 위해서는 먼저 세포 내 DNA가 세포 밖으로 유출될 수 있도록 세포벽 및 세포막을 분해시켜야 한다. DNA 추출은 크게 세 단계로 이루어지며, sample의 세포막을 제거하는 단계인 Lysis, DNA 구조를 제외한 불순물을 제거하는 단계인 Washing, 불순물이 필터링된 DNA 샘플만을 tube에서 용출해내는 단계인 Elution이 있다. 2. DNA quality check 추출한 DNA는 DNA quality check를 해주고, Nucleic acid quantific...2025.01.12
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DNA 추출 및 전기영동2025.01.121. DNA 추출 바나나에서 DNA를 추출하는 과정을 설명합니다. 바나나를 으깨고 소금, 세제를 섞어 세포벽을 파괴하여 DNA를 추출합니다. 에탄올을 사용하여 DNA를 침전시키고 물에 녹여 관찰할 수 있습니다. DNA는 음전하를 띠는 거대분자이며 뉴클레오타이드로 구성되어 있습니다. 2. 전기영동 추출한 DNA를 전기영동 실험을 통해 분리할 수 있습니다. 아가로즈 겔을 만들고 DNA 샘플에 loading buffer를 섞어 겔의 well에 로딩합니다. 전기장을 걸면 DNA가 음전하를 띠므로 양극 방향으로 이동하게 됩니다. DNA의 크...2025.01.12
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플라스미드 DNA 정제2025.01.121. 플라스미드 DNA 분리 플라스미드 DNA는 재조합 DNA 조작을 위한 운반체 DNA로 사용되며, 대장균에 플라스미드를 삽입하는 과정을 Bacterial Transformation이라고 한다. 대장균 세포에는 플라스미드 DNA와 염색체 DNA가 독립적으로 존재하므로, 플라스미드 DNA를 따로 분리하는 과정을 Purification of plasmid DNA라고 한다. 알칼리 용해법(Alkali lysis)은 높은 pH의 알칼리성 용액을 사용하여 세포벽과 세포막을 용해시킨 후, 산성 용액을 처리하여 플라스미드 DNA만을 분리해내는...2025.01.12
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생물공정실험 예비보고서_RNA Extraction and Quantification2025.01.071. 유전자 발현과 조절 유전자 발현 경로는 전사와 번역으로 나뉘며, 전사 개시, 전사 후 가공, 번역 단계에서 조절될 수 있다. 전사 활성은 크로마틴 구조 변화, 전사인자 결합 등으로 조절되며, 전사 후에는 mRNA 가공, 번역에서는 mRNA 사용 속도 조절 등으로 이루어진다. 2. TRIzol을 이용한 RNA 추출 TRIzol 시약은 페놀-구아니딘 이소티오시아네이트로 구성되어 세포막을 파괴하고 RNase를 억제하여 RNA를 선택적으로 추출할 수 있다. 세포 용해액을 원심분리하면 RNA가 수용층에 존재하게 되며, 이후 isopro...2025.01.07
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인천대학교 나노바이오실험(1) Genomic DNA prep & Gel Electrophoresis2025.01.141. Genomic DNA Genomic DNA는 염색체 DNA로, Plasmid DNA와 같은 Extra-chromosomal DNA와 대조되는 개념이다. 대부분의 생물은 모든 세포에서 같은 Genomic DNA를 갖지만, 특정 gene의 발현으로 cell type과 function이 달라진다. 어떤 organism의 genomic DNA인지에 따라 바이러스, 박테리아, 진핵생물 등의 특성을 지닌다. 2. DNA 추출 방법 DNA 추출은 Lysis, Precipitation, Purification 3단계로 이루어진다. Lysis...2025.01.14
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