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Agarose gel Electrophoresis 결과레포트2025.05.161. Agarose gel Electrophoresis 이번 실험의 목적은 실험2에서 진행된 PCR product를 전기영동해 분리하고 분석하는 것이었습니다. 1000bp가 가장 이상적인 값이었지만, 8개 샘플 중 6개만 1000bp와 비슷한 곳에 나타났고 나머지 2개는 전혀 나타나지 않았습니다. 이는 2개 샘플의 DNA 농도가 상대적으로 낮아서 그런 것으로 보입니다. 또한 약간의 끌림 현상이 관찰되었는데, 이는 DNA가 깨졌거나 농도가 너무 높아서 생긴 것으로 보입니다. 이를 방지하기 위해서는 annealing 온도 조절, DNA...2025.05.16
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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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A+ 생화학실험 <6주차. Plasmid DNA Miniprep> 레포트2025.01.201. Plasmid DNA Plasmid DNA는 박테리아 내에 존재하는 extrachromosomal DNA로, 자체적 복제가 가능한 복제 기점을 가지고 있습니다. 생존에 필수적이지 않은 정보를 담고 있으며, 항생제 내성 유전자 같은 선택적 마커가 포함되기도 합니다. 이를 통해 항생제가 포함된 배지에서 cell-selection을 진행할 수 있으며, 이로부터 유전자 발현 여부를 조사할 수 있습니다. 또한 plasmid DNA는 super coiled 형태의 DNA로, 유전자 조작, 분리, cloning 등 유전공학 분야에 용이하게...2025.01.20
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새로운 박테리아 종 동정을 위한 DNA 추출2025.05.081. DNA 추출 과정 본 실험에서는 미지 균주의 DNA를 추출하는 과정을 수행하였다. 균주를 PBS에 현탁하고 원심분리하여 세척한 뒤, lysozyme과 SDS를 처리하여 세포를 용균시켰다. 이후 PCI, chloroform을 이용하여 단백질과 불순물을 제거하고 에탄올 침전을 통해 DNA를 회수하였다. 최종적으로 0.1x SSC 완충액에 녹여 DNA 농도를 측정하였다. 그러나 260/280, 260/230 비율이 이상적인 수준에 미치지 못하여 순수한 DNA 추출에는 어려움이 있었던 것으로 나타났다. 2. DNA 추출 시약의 역할 ...2025.05.08
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미니프렙을 통한 플라스미드 DNA 분리 및 정량2025.11.161. 미니프렙(Minipreparation) 방법 E. coli에 형질전환된 플라스미드를 미니프렙 방법으로 분리하는 실험이다. Solution I(glucose, Tris-Cl, EDTA)에서 세포 용해 준비, Solution II(SDS, NaOH)에서 세포 용해 및 DNA 변성, Solution III(potassium acetate, glacial acetic acid)에서 중화 과정을 거친다. 최종 DNA 농도는 0.2322 µg/µl이었다. 효율 향상을 위해 bacterial pellet 제거, inverting으로 혼합,...2025.11.16
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구강 상피세포로부터 gDNA 추출 실험2025.11.181. Genomic DNA (gDNA) Genomic DNA는 유전체를 구성하는 긴 DNA 서열로 개체의 모든 유전 정보를 포함한다. 진핵세포의 gDNA는 세포핵 내에 위치하며 긴 선형 구조를 가진다. 플라스미드 DNA와 달리 원형 구조가 아닌 선형 구조이며, 개체의 생명현상에 필요한 모든 유전 정보를 포함할 수 있다. 염색체를 구성하는 DNA로서 세포 내 유전 정보의 주요 저장소 역할을 한다. 2. 동물 세포의 구조 동물 세포는 핵, 세포질, 리보솜, 소포체, 골지체, 리소좀, 미토콘드리아, 중심립 등 다양한 소기관으로 구성된다....2025.11.18
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DNA 겔 전기영동 실험 보고서2025.11.121. DNA 겔 전기영동 DNA 겔 전기영동은 DNA 분자를 전기장을 이용하여 아가로스 겔을 통해 분리하는 생명과학 실험 기법입니다. 음전하를 띤 DNA는 양극으로 이동하며, 분자의 크기에 따라 이동 속도가 달라져 다양한 크기의 DNA 단편을 분리할 수 있습니다. 이 기법은 유전자 분석, DNA 지문 감식, PCR 산물 확인 등 다양한 분야에서 활용됩니다. 2. 아가로스 겔 아가로스는 해조류에서 추출한 다당류로, 겔 전기영동에서 매질로 사용됩니다. 아가로스 농도에 따라 겔의 기공 크기가 결정되며, 이는 분리되는 DNA의 크기 범위를...2025.11.12
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플라스미드 DNA 추출과 Mini-prep 흡광도 분석2025.11.171. 플라스미드 DNA와 Mini-prep 플라스미드 DNA는 박테리아의 세포외에 존재하는 작은 원형 이중 가닥 DNA로, 염색체와 별도로 독자적으로 복제 및 증식할 수 있습니다. 유전자 재조합 기술에 사용되며 크기가 작아 정제가 용이합니다. Mini-prep은 형질전환된 세균을 배양한 후 플라스미드 DNA를 정제하는 과정으로, 알칼리 변성(alkaline lysis) 방법을 주로 사용합니다. 이 방법은 SDS와 수산화나트륨으로 세포를 파괴하고, 아세트산칼륨으로 중성화한 후 원심분리와 에탄올 침전법으로 DNA를 정제합니다. 2. D...2025.11.17
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DNA 젤 전기영동 실험 보고서2025.11.121. DNA 젤 전기영동 DNA 젤 전기영동은 DNA 분자를 전기장을 이용하여 아가로스 젤을 통해 분리하는 분자생물학 기법입니다. DNA는 음전하를 띠고 있어 양극으로 이동하며, 분자의 크기에 따라 이동 속도가 달라져 크기별로 분리됩니다. 이 기술은 DNA 분석, 유전자 검사, PCR 산물 확인 등 다양한 생명과학 연구에서 필수적으로 사용됩니다. 2. 아가로스 젤 아가로스는 해조류에서 추출한 다당류로, 젤 전기영동에서 매질로 사용됩니다. 아가로스 농도에 따라 젤의 기공 크기가 결정되며, 이는 DNA 분자의 분리 해상도에 영향을 미칩...2025.11.12
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[만점보고서]Plasmid DNA 추출과 DNA 정량 실험보고서2025.01.171. Plasmid DNA 추출 Plasmid DNA는 세균의 세포 내에서 염색체와 별개로 존재하는 자가복제 DNA이다. Plasmid DNA 추출을 위해 Alkaline Lysis 법을 사용하여 세포를 용해시키고 plasmid DNA를 염색체 DNA와 분리한다. 이 과정에서 다양한 buffer를 사용하여 pH 변화를 조절하고 불순물을 제거한다. 2. DNA 정량 Nanodrop 분광광도계를 이용하여 추출한 plasmid DNA의 농도와 순도를 측정한다. 260nm 흡광도로 DNA 농도를 측정하고, 260nm/280nm 및 260n...2025.01.17
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