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서울대학교, 화학실험, 만점, A+, 펩타이드 질량분석 결과보고서2025.01.291. MALDI-TOF 펩타이드 질량분석 본 실험에서는 trypsin으로 가수분해한 단백질 샘플을 MALDI-TOF MS로 분석하여, 미지의 샘플이 lysozyme, BSA, ovalbumin 중 어떤 단백질에 해당하는지 알아내고자 하였다. 실험 결과, 미지의 단백질은 BSA로 확인되었으며, MALDI-TOF MS 데이터 분석 시 peptide coverage, miscleavage, 신호 대비 잡음 비율(S/N) 등을 고려하여 정확도를 높이는 것이 중요함을 알 수 있었다. 2. 펩타이드 질량지문(PMF) 단백질을 trypsin으로...2025.01.29
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Peptide 질량분석2025.01.231. 펩타이드 질량분석 단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이며, 펩타이드는 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것이다. MALDI-TOF 질량분석법은 분석 물질에 자외선을 흡수하는 matrix를 넣고 레이저로 기화시켜 기체상 이온을 만들어 질량/전하수 값을 측정하는 방법이다. 실험에서는 단백질을 트립신으로 가수분해한 펩타이드 용액을 CHCA matrix와 혼합하여 MALDI-TOF 질량분석을 수행하였고, 얻어진 펩타이드 질량지문으로부터 주어진 단백질을 동정하였다. 2. MALDI-TOF 질...2025.01.23
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[만점 레포트] 연세대학교 생화학실험(1) 7주차 Peptide Mass Finger-Printing2025.05.041. MALDI-TOF 질량분석법 MALDI-TOF 질량분석법은 고분자 물질에 대해 시료의 분해 없이 기화/이온화가 가능한 방법으로, 일반적으로 질량이 크고 열에 불안정한 생체 고분자나 합성 고분자에 이상적으로 적용할 수 있다. 이 실험에서는 MALDI 이온화 장치와 TOF 질량 분석기를 이용하여 단백질을 동정하는 방법을 공부한다. 2. 단백질 동정 MALDI-TOF 질량분석법을 이용하여 단백질을 동정하는 과정을 설명한다. 시료를 MALDI 장치에 주입하고 질량 분석기로 분석한 후, 결과 스펙트럼을 데이터 검색 엔진에 입력하여 단백...2025.05.04
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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식품생화학 아미노산, 펩타이드, 단백질 요약2025.05.071. 아미노산과 펩타이드 아미노산은 단백질을 이루는 기본단위 물질로서, 20개 다른 종류의 아미노산이 결합하여 펩타이드를 이루고 단백질을 형성합니다. 아미노산은 극성 아미노산(중성, 산성, 염기성)과 비극성 아미노산으로 구분되며, 중성 pH 상태에서 양극성 이온 형태로 존재합니다. 펩타이드는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 구조이며, 일부 펩타이드는 고유의 생리활성을 가지고 있습니다. 대표적인 합성 펩타이드인 아스파탐은 감미료로 사용되고 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 아미노산이 중합된 고분자 물질로, 1차 구조(아미노산 ...2025.05.07
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단백질의 검출2025.01.271. 단백질의 기능과 구조 이번 실험에서는 단백질의 기능과 구조를 이해하고, 단백질의 정성 분석법에 대해 배웠습니다. 실험을 통해 단백질의 존재 유무를 확인하였고, 뷰렛 반응과 Bradford Assay 반응의 특성을 비교하였습니다. 뷰렛 반응은 색 변화가 미미하여 관찰하기 어려웠지만, Bradford Assay 반응은 빠르고 민감도가 높아 확실한 색 변화를 관찰할 수 있었습니다. 이를 통해 단백질 검출 실험에서 Bradford Assay 반응이 더 효과적임을 알 수 있었습니다. 2. 단백질의 정성 분석법 이번 실험에서는 단백질의 ...2025.01.27
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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단백질의 분석(질량, 서열, ELISA) 요약정리2025.04.301. 단백질 질량 측정 단백질의 질량을 측정하기 위해서는 단백질을 기체 상태의 이온으로 바꾼 후 전기장 하에서 질량 대 전하비(m/z)를 구하는 방식을 사용한다. MALDI와 ESI 기법을 통해 단백질을 이온화할 수 있으며, 이후 TOF 분석기를 이용하여 질량을 측정할 수 있다. 2. 항체를 이용한 단백질 검출 및 정량 항체는 특정 단백질에 결합하여 면역 반응을 일으키므로, 이를 이용하여 단백질을 검출하고 정량할 수 있다. ELISA 기법은 항체와 연결된 효소를 이용하여 단백질의 존재 유무와 양을 측정할 수 있다. Western b...2025.04.30
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서강대학교 일반생물학실험1 실험 6. GFP 단백질과 단백질 정량 (Protein Measurements)2025.01.021. 단백질 정량 방법 실험에서는 Lowry assay와 Extinction coefficient assay 두 가지 단백질 정량 방법을 사용하여 EGFP의 질량농도를 측정하였다. Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction을 거쳐 750nm에서 흡광도를 측정하고 BSA 표준곡선을 이용하여 EGFP 농도를 계산하였다. Extinction coefficient assay는 EGFP의 몰흡광계수와 Lambert-Beer's Law를 이용하여 488nm에서 EGFP 농도를 직접 계산하였다. 두 방법의 ...2025.01.02
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[10점/A+] 연세대학교 공학생물학 및 실험I 3주차 단백질의 정량2025.05.041. 단백질 단백질은 생체 내 거대 분자들 중 하나로, 거의 모든 생명체의 역동적인 기능은 단백질에 의존한다. 단백질은 대부분의 세포에서 건조 질량의 50% 이상을 차지하며, 효소 단백질, 방어 단백질, 저장 단백질, 수송 단백질, 호르몬 단백질, 수용체 단백질, 수축 및 운동 단백질, 구조 단백질 등 다양한 기능을 수행한다. 2. Bradford 단백질 정량법 Bradford 단백질 정량법은 분광광도계를 이용하여 용액 속에 함유되어 있는 단백질의 양을 분석하는 방법이다. 이 방법은 쿠마시블루 G-250 (Coomassie Blue...2025.05.04
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