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[만점 레포트] 연세대학교 생화학실험(1) 7주차 Peptide Mass Finger-Printing2025.05.041. MALDI-TOF 질량분석법 MALDI-TOF 질량분석법은 고분자 물질에 대해 시료의 분해 없이 기화/이온화가 가능한 방법으로, 일반적으로 질량이 크고 열에 불안정한 생체 고분자나 합성 고분자에 이상적으로 적용할 수 있다. 이 실험에서는 MALDI 이온화 장치와 TOF 질량 분석기를 이용하여 단백질을 동정하는 방법을 공부한다. 2. 단백질 동정 MALDI-TOF 질량분석법을 이용하여 단백질을 동정하는 과정을 설명한다. 시료를 MALDI 장치에 주입하고 질량 분석기로 분석한 후, 결과 스펙트럼을 데이터 검색 엔진에 입력하여 단백...2025.05.04
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Peptide 질량분석2025.01.231. 펩타이드 질량분석 단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이며, 펩타이드는 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것이다. MALDI-TOF 질량분석법은 분석 물질에 자외선을 흡수하는 matrix를 넣고 레이저로 기화시켜 기체상 이온을 만들어 질량/전하수 값을 측정하는 방법이다. 실험에서는 단백질을 트립신으로 가수분해한 펩타이드 용액을 CHCA matrix와 혼합하여 MALDI-TOF 질량분석을 수행하였고, 얻어진 펩타이드 질량지문으로부터 주어진 단백질을 동정하였다. 2. MALDI-TOF 질...2025.01.23
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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서울대학교, 화학실험, 만점, A+, 펩타이드 질량분석 결과보고서2025.01.291. MALDI-TOF 펩타이드 질량분석 본 실험에서는 trypsin으로 가수분해한 단백질 샘플을 MALDI-TOF MS로 분석하여, 미지의 샘플이 lysozyme, BSA, ovalbumin 중 어떤 단백질에 해당하는지 알아내고자 하였다. 실험 결과, 미지의 단백질은 BSA로 확인되었으며, MALDI-TOF MS 데이터 분석 시 peptide coverage, miscleavage, 신호 대비 잡음 비율(S/N) 등을 고려하여 정확도를 높이는 것이 중요함을 알 수 있었다. 2. 펩타이드 질량지문(PMF) 단백질을 trypsin으로...2025.01.29
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면역혈액학 7과 정리 레포트2025.01.041. 항체 선별 및 동정 항체 선별 테스트(screening test)는 수혈 전에 환자의 혈액에 비예기 항체가 있는지 확인하는 것입니다. 환자의 혈청/혈장과 screening cells(Group O 적혈구)를 반응시켜 항체 유무를 확인합니다. 양성 반응이 나오면 비예기 항체가 있다고 판단하며, 이때 자가항체인지 동종항체인지 확인해야 합니다. 항체 동정 테스트는 비예기 항체가 어떤 항원에 특이성을 가지고 있는지 찾아내는 것입니다. Panel cells(다양한 항원을 가진 Group O 적혈구)를 이용하여 반응 패턴을 분석하여 항체...2025.01.04
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전기영동 결과보고서2025.01.121. 전기영동 전기영동은 DNA, RNA, 단백질 등의 생물학적 거대분자를 분리하는 데 사용되는 기술입니다. 이번 실험에서는 Agarose gel을 사용하여 PCR 증폭 산물을 전기영동으로 분리하였습니다. 전기영동 과정에서 주의해야 할 점으로는 TAE 완충액의 적절한 양 유지, 전기영동 시간 관리, 시료 주입 시 gel 판 손상 방지 등이 있습니다. 또한 Polyacrylamide gel을 사용하는 실험도 있으며, 이는 단백질 분리나 작은 크기의 DNA 분리에 주로 사용됩니다. 2. PCR PCR(Polymerase Chain Re...2025.01.12
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아주대학교 A+ 생명과학실험 생물정보학실습2025.01.131. 생물정보학 생물정보학은 수학이나 통계학을 기초로 하여 컴퓨터를 이용해 생물학을 연구하는 학문을 의미한다. BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과 같이 생물학적 서열 정보를 비교하는 알고리즘이며, BLOSUM은 서열을 정렬할 때 쓰이는 치환 행렬로 두 아미노산 간의 유사성을 나타내는 매트릭스이다. 다중 서열 정렬(MSA)은 3개 이상의 DNA 염기 서열 또는 아미노산 서열을 한꺼번에 묶어서 정렬하는 방법으로, 대표적인 알고리즘은 ClustalW이다. 2. BLAST BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과...2025.01.13
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생명과학실험1 Immunoprecipitation (IP)2025.01.171. Immunoprecipitation (면역침강법, IP) 면역침강법은 항원-항체 반응을 이용하여 원하는 단백질을 분리하고자 하는 실험이다. 단백질은 특정한 항체에만 결합하는 항체 특이성을 가지고 있으므로, 검출하고자 하는 target protein도 특정한 종류의 항체와만 결합하게 된다. 항원-항체 복합체가 바닥에 가라앉도록 하기 위해서 먼저 항체와 Bead를 붙이고, bead와 결합한 항체가 다시 단백질과 결합하여 단백질-항체-Bead 복합체를 형성하게 된다. 이 복합체가 원심분리를 통해 침강하게 되면서 원하는 단백질을 분리...2025.01.17
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미생물의 생화학적 특성 확인(탄수화물, 단백질, 지질의 이용능 확인)2025.01.211. 유산균의 생균수 측정 시판 요구르트에서 유산균의 생균수를 측정하고, 생균수 측정법을 습득하였다. 요구르트 시료 150mL당 약 3.15 x 10^9 CFU/mL의 미생물이 존재하는 것으로 추정되었다. 실험 과정에서 오염이 발생하여 결과의 정확성이 다소 떨어지는 것으로 나타났다. 2. 미생물의 탄수화물 이용능 확인 Starch agar 배지를 이용하여 미생물의 전분 분해능을 확인하였다. Bacillus 균주는 전분을 분해하여 요오드 용액과 반응하지 않았지만, 다른 균주들은 전분 분해가 일어나지 않아 요오드 용액과 반응하여 암청색...2025.01.21
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단백질의 검출2025.01.271. 단백질의 기능과 구조 이번 실험에서는 단백질의 기능과 구조를 이해하고, 단백질의 정성 분석법에 대해 배웠습니다. 실험을 통해 단백질의 존재 유무를 확인하였고, 뷰렛 반응과 Bradford Assay 반응의 특성을 비교하였습니다. 뷰렛 반응은 색 변화가 미미하여 관찰하기 어려웠지만, Bradford Assay 반응은 빠르고 민감도가 높아 확실한 색 변화를 관찰할 수 있었습니다. 이를 통해 단백질 검출 실험에서 Bradford Assay 반응이 더 효과적임을 알 수 있었습니다. 2. 단백질의 정성 분석법 이번 실험에서는 단백질의 ...2025.01.27
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