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아주대 생실1) Plasmid DNA 추출 보고서2025.05.101. 플라스미드 DNA 추출 이 실험을 통해 플라스미드 DNA를 추출하고 전기영동을 통해 플라스미드 DNA의 형태를 관찰할 수 있었습니다. 플라스미드는 생장에 필수적인 염색체 DNA와 물리적으로 분리되어 있는 대표적인 에피솜 DNA 분자로, E.coli 세균에서 플라스미드를 추출하여 DNA를 관찰했습니다. 실험에서는 여러 가지 버퍼를 사용했는데, 이는 플라스미드 DNA 추출을 위한 것입니다. 실험 결과 3kb와 10kb 부분에서 플라스미드 DNA가 관찰되었으며, 3kb 부분은 Linear DNA, 10kb 부분은 Open-circu...2025.05.10
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TECAN을 이용한 DNA quality check와 전기영동을 통한 대장균의 병원성 유형 확인2025.01.121. DNA 추출 및 정제 세포로부터 DNA를 분리하기 위해서는 먼저 세포 내 DNA가 세포 밖으로 유출될 수 있도록 세포벽 및 세포막을 분해시켜야 한다. DNA 추출은 크게 세 단계로 이루어지며, sample의 세포막을 제거하는 단계인 Lysis, DNA 구조를 제외한 불순물을 제거하는 단계인 Washing, 불순물이 필터링된 DNA 샘플만을 tube에서 용출해내는 단계인 Elution이 있다. 2. DNA quality check 추출한 DNA는 DNA quality check를 해주고, Nucleic acid quantific...2025.01.12
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인천대학교 나노바이오실험(1) Genomic DNA prep & Gel Electrophoresis2025.01.141. Genomic DNA Genomic DNA는 염색체 DNA로, Plasmid DNA와 같은 Extra-chromosomal DNA와 대조되는 개념이다. 대부분의 생물은 모든 세포에서 같은 Genomic DNA를 갖지만, 특정 gene의 발현으로 cell type과 function이 달라진다. 어떤 organism의 genomic DNA인지에 따라 바이러스, 박테리아, 진핵생물 등의 특성을 지닌다. 2. DNA 추출 방법 DNA 추출은 Lysis, Precipitation, Purification 3단계로 이루어진다. Lysis...2025.01.14
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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식물 세포의 DNA 추출 및 전기 영동2025.01.171. DNA 추출 식물 세포의 DNA를 추출하는 과정을 설명하였습니다. 세포벽, 세포막, 핵막을 파괴하고 DNA와 결합한 단백질을 제거하는 과정을 거쳤습니다. 세제와 소금을 이용하여 세포막과 핵막을 융해하고, 에탄올을 사용하여 DNA를 분리하는 방법을 사용하였습니다. 2. 전기 영동 추출한 DNA를 이용하여 전기 영동 실험을 진행하였습니다. 전기장 내에서 DNA가 크기와 전하에 따라 이동하는 원리를 설명하였습니다. 1X TAE 버퍼, 6X 로딩 버퍼, DNA 래더 등을 사용하여 DNA 밴드를 관찰할 수 있었습니다. 전압 조절에 따른...2025.01.17
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DNA 추출 및 PCR, PCR 결과 확인(전기영동) 레포트2025.04.251. DNA 추출 DNA 추출 과정에서 Vortexing이나 Tapping을 하지 않고 Inverting하는 이유는 고분자인 gDNA에 물리적인 힘이 크게 가해져 gDNA의 손상이 일어나는 것을 방지하기 위해서이다. gDNA 전기영동 결과에서 Clean band가 나오지 않은 이유는 gDNA가 크기가 무척이나 크기 때문에 일련의 실험 과정에서 많이 부서져 부서진 조각들의 크기가 다양하여 전기영동 시 clean band가 나오지 않고 번진 형태로 나타났기 때문이다. 2. PCR PCR product의 전기영동 결과를 보면 500~60...2025.04.25
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Metagenomics 미생물 실험보고서2025.05.061. Metagenomics Metagenomics는 현재 약 99%의 미생물배양이 어렵다는 실험적인 한계를 보완하는 방법으로 직접환경샘플에서 DNA를 추출하여 Next-generationsequencing(NGS)를 진행하여 다양한 플랫폼을 이용하여 미생물의 군집구조(microbial community) 및 메타유전체(metagenome)를 분석하는데 이용되고 있다. 2. 토양 샘플 분석 이번 실험에서는 주변환경의 토양 sample을 채취하여 유전체 분석을 하는 방법을 이용했으며, 실험 과정은 토양 sample채취, 토양 samp...2025.05.06
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플라스미드 미니 준비 발표2025.01.061. 플라스미드 플라스미드는 박테리아가 가진 염색체 이외의 DNA 분자입니다. 1952년 미국의 유전학자 J. 레더버그가 최초로 플라스미드를 발견했으며, 이는 박테리아가 독자적으로 증식할 수 있는 DNA 분자라는 의미로 명명되었습니다. 플라스미드는 유전공학에서 중요한 역할을 하며, 플라스미드 준비는 플라스미드 DNA를 추출하고 정제하는 과정입니다. 2. 플라스미드 미니 준비 플라스미드 미니 준비는 박테리아로부터 소량의 플라스미드 DNA를 추출하고 정제하는 방법입니다. 이 방법은 많은 후보를 빠른 시간 내에 분석할 수 있게 해줍니다....2025.01.06
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바나나 DNA 추출 실험2025.05.141. DNA 추출 바나나 세포에서 DNA를 추출하는 실험을 수행했다. 소금과 세제를 이용해 세포막과 핵막을 파괴하여 DNA를 세포 밖으로 유출시켰고, 차가운 에탄올을 이용해 DNA를 침전시켜 추출할 수 있었다. 이를 통해 DNA의 위치와 특성을 확인할 수 있었다. 2. DNA 구조 DNA는 인산, 당, 염기가 1:1:1로 결합된 뉴클레오타이드로 구성되어 있으며, 이중 나선 구조를 가지고 있다. 아데닌은 타이민과, 구아닌은 사이토신과 수소결합을 형성하여 상보적 결합을 한다. 이러한 DNA의 구조적 특성은 DNA 복제 과정에 중요한 역...2025.05.14
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아주대 생명과학실험 Plasmid DNA 추출2025.01.131. 플라스미드 DNA 플라스미드 DNA는 원핵세포의 세포질 및 진핵생물의 세포 소기관에서 발견되는 작고 원형의 이중 가닥 DNA 분자이다. 이 DNA 조각들은 자율적으로 복제할 수 있으며, 세포의 염색체 DNA와는 독립적으로 존재한다. 플라스미드는 보통 추가적인 유전 정보를 포함하고 있으며, 특정 환경 조건에서 숙주 세포에 유익할 수 있는 기능들을 부여한다. 2. 제한효소 제한효소(EcoRI)는 플라스미드 DNA를 실험실에서 조작하기 위한 주요 도구이다. 이 효소는 특정 짧은 DNA 서열을 인식하고 절단할 수 있는 능력이 있어, ...2025.01.13
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