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유전학2_경북대2025.05.031. DNA microarray DNA microarray는 고체 표면에 부착된 미세한 DNA 조각의 집합체입니다. DNA 칩과의 차이점은 DNA 칩은 합성된 올리고뉴클레오타이드로 배열되어 있고, DNA 마이크로어레이는 변성된 DNA가 배열되어 있습니다. DNA 마이크로어레이의 장점은 매우 희귀한 전사체도 검출할 수 있고 전사체 수준의 작은 차이도 감지할 수 있습니다. 단점은 프로브의 하이브리드화 효율이 다를 수 있고 사전 서열 지식이 필요하다는 것입니다. 2. RNA-seq RNA-seq은 각 전사체를 서열에 따라 식별할 수 있고...2025.05.03
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[생화학실험] RT-PCR을 통한 간암 세포주에 대한 약물 효능 평가2025.01.291. RT-PCR RT-PCR은 역전사 반응과 PCR 반응을 이용하여 원하는 주형 mRNA의 상보적 염기쌍인 cDNA를 합성, 증폭시키는 분자생물학적 기술이다. 본 실험에서는 RT-PCR을 통해 간암 세포주 HepG2 cell에 처리한 Salsolinol이 Cyclin D1 경로에서 암세포 사멸에 유의미한 결과를 보이는지 관찰하였다. 2. Cyclin D1 Cyclin D1은 세포 주기 조절에 관여하는 단백질로, 암세포의 증식을 억제하는 역할을 한다. 본 실험에서는 Salsolinol 처리가 Cyclin D1 경로를 통해 HepG2...2025.01.29
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RNA와 식물 RNA 중합효소2025.01.141. RNA의 구조적 특징 RNA는 DNA와 구조적으로 다른 점이 있는데, 리보오스 탄소 2'에 수산화기가 존재하고 티민 대신 유라실을 이용하는 등의 차이가 있다. 또한 RNA는 단백질과 같이 접힘을 통해 3차원 구조를 형성할 수 있다. 2. RNA의 종류 RNA에는 mRNA, tRNA, rRNA 등 다양한 종류가 있다. mRNA는 DNA의 유전정보를 리보솜에 전달하여 단백질 합성을 돕고, tRNA와 rRNA는 단백질 번역에 관여한다. 또한 miRNA, lncRNA 등 유전자 발현을 조절하는 비번역 RNA도 존재한다. 3. RNA ...2025.01.14
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아주대학교 A+ 생명과학 실험 DNA 구조의 이해 결과보고서2025.01.131. DNA 구조 DNA는 유전정보를 가지고 있는 디옥시리보뉴클레오티드로 이루어진 고분자 중합체이다. 단일가닥이나 이중가닥의 형태로 존재할 수 있지만 세포를 가진 생물의 DNA는 모두 이중가닥 형태를 가진다. DNA 이중나선 구조에서 나선이 짧게 마주보는 쪽을 minor groove, 넓게 마주보는 쪽을 minor groove 라고 한다. 이 두가지가 번갈아 나오는 형태를 보이며 인산기, 당, 염기가 일직선상에 배열되어 있지 않기 때문에 발생할 수 있다. 2. DNA 염기쌍 DNA의 4가지 염기는 구아닌, 아데닌, 타이민, 사이토신...2025.01.13
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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겔 전기영동 (agarose gel electrophoresis) 실험 리포트2025.01.141. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis은 크기에 따라 핵산(DNA 또는 RNA) 조각을 분리하는 데 사용되는 전기영동 종류이다. 음전하를 띤 DNA/RNA는 전류가 가해질 때 agarose gel의 기공을 통해 gel의 양전하 말단으로 이동하고 이때 더 작은 조각이 더 빠르게 이동한다. 결과 밴드는 자외선(UV)을 사용하여 시각화할 수 있다. 2. Taq polymerase Taq polymerase는 호열성 박테리아인 Thermus aquaticus에서 추출한 열 ...2025.01.14
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재조합 플라스미드 DNA 클로닝 예비2025.05.011. 플라스미드 DNA 플라스미드는 주 염색체와 분리되어 있어 독자적으로 복제가 가능한 환형 DNA이다. 대부분은 세균에 존재하며 생존에 필수적이진 않지만 특정 상황에 유용한 유전자를 포함한다. 플라스미드는 클로닝 벡터로 많이 이용되며 재조합된 플라스미드를 세균에 유입 후 증식시켜 DNA양을 늘린다. 또는 발현벡터로 세포내의 전사,번역기구를 이용해 재조합 유전자를 발현시켜 단백질을 대량 생산시킬 때도 이용 가능하다. 2. 클로닝 생명공학에서 cloning은 세포나 DNA조각을 복제하는 과정이다. 목적DNA조각을 다량 생산하거나 DN...2025.05.01
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[생명공학] RNA extraction, cDNA synthesis, qRT PCR2025.05.031. RNA extraction RNA를 분리하는 과정에서 가장먼저 첨가해주는 물질이 Trizol이다. Trizol은 phenol과 guanidinium thiocyanate라는 두가지 중요한 성분으로 이루어져있고 이들이 cell을 lysis하고 RNA를 안정화시키는 역할을 한다. 추가적으로 chloroform을 첨가하여 RNA와 다른 물질들을 분리한다. 2. cDNA synthesis cDNA 합성 과정에서는 reverse transcriptase 효소가 핵심적인 역할을 한다. 이 효소는 RNA를 DNA로 역전사하는 기능을 가지고...2025.05.03
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핵산의 구조와 기능2025.05.071. 핵산의 구조와 기능 핵산은 1869년 프리드리히 미셰르에 의해 발견되었으며, 모든 생명체에 필수적인 유전물질로 DNA와 RNA의 두 종류가 존재한다. 핵산은 생명체의 핵 속에서 유전정보를 암호화하여 대부분의 단백질, 세포 내 구성성분, 생명유지에 필요한 모든 물질을 만들 수 있는 정보를 가지고 있다. 또한 한 세대에서 다른 세대로 유전정보를 전달하는 역할을 담당한다. 2. 뉴클레오타이드의 구조 뉴클레오타이드는 질소 염기, 5탄당, 인산염의 세 가지 특징적인 구성성분을 가지고 있다. DNA의 뉴클레오타이드 단위는 A, G, T,...2025.05.07
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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