
DNA Ligation & Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA Restriction enzyme & Gel electrophoresis
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_3차 풀레포트_DNA Ligation & Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA Restriction enzyme & Gel electrophoresis
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2024.07.16
문서 내 토픽
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1. DNA Ligation & Transformation제한효소를 처리하여 얻어낸 insert DNA를 T4 DNA ligase를 이용하여 vector에 삽입한다. DNA strand의 5'에 존재하는 인산기와 3'에 존재하는 OH기 사이에 phosphodiester bond를 형성하여 ligation하고, ligation product를 competent cell에 형질전환한 다음 plate에 ampicillin resistance에 의해 생성된 colony를 selection한다.
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2. Mini-scale preparation of plasmid DNAMini-prep을 통해 colony로부터 plasmid DNA를 추출하여 정제하는데, 염기성 조건에서 plasmid DNA와 chromosomal DNA의 denaturation정도의 차이와 다시 중성조건에서 두 DNA의 renaturation 정도의 차이를 이용하여 plasmid DNA를 분리해낸다.
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3. Restriction enzyme & Gel electrophoresis이후 분리한 plasmid DNA에 제한효소를 처리하여 insert DNA 와 vector를 분리하고 전기영동을 통해 확인한다. 제한효소를 이용하여 insert DNA와 vector를 분리한 다음 전기영동을 통해 확인해준 결과는 6kb와 5kb사이에서 band가 형성되었으며, 750bp에도 band가 형성되었다.
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1. DNA Ligation & TransformationDNA ligation and transformation are fundamental techniques in molecular biology and genetic engineering. DNA ligation is the process of joining DNA fragments together using an enzyme called DNA ligase. This is an essential step in the construction of recombinant DNA molecules, which are then introduced into host cells through transformation. Transformation is the process of introducing foreign DNA into a host cell, such as bacteria or yeast, allowing the host cell to express the genes encoded in the introduced DNA. These techniques are crucial for a wide range of applications, including gene cloning, gene expression, and the production of genetically modified organisms. Mastering these techniques is essential for researchers working in fields such as biotechnology, genetics, and molecular biology.
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2. Mini-scale preparation of plasmid DNAMini-scale preparation of plasmid DNA is a widely used technique in molecular biology and genetic engineering. Plasmids are small, circular DNA molecules that can replicate independently within a host cell, such as bacteria. Mini-scale preparation involves the isolation and purification of plasmid DNA from a small-scale bacterial culture, typically using a simple and efficient protocol. This technique allows researchers to quickly and easily obtain small amounts of high-quality plasmid DNA for various applications, such as DNA sequencing, restriction enzyme analysis, and transfection of eukaryotic cells. The ability to rapidly prepare plasmid DNA is essential for many experimental procedures and is a fundamental skill for anyone working in the field of molecular biology.
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3. Restriction enzyme & Gel electrophoresisRestriction enzymes and gel electrophoresis are two essential tools in molecular biology and genetic engineering. Restriction enzymes are enzymes that can recognize and cleave specific DNA sequences, allowing researchers to manipulate and analyze DNA molecules. Gel electrophoresis, on the other hand, is a technique used to separate and visualize DNA fragments based on their size and charge. Together, these techniques are widely used for a variety of applications, such as DNA cloning, DNA sequencing, and genetic analysis. Restriction enzymes enable the precise cutting and manipulation of DNA, while gel electrophoresis allows for the separation and visualization of the resulting DNA fragments. Mastering these techniques is crucial for researchers working in fields such as molecular biology, genetics, and biotechnology, as they provide the fundamental tools for DNA analysis and manipulation.
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DNA ligation, Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA1. DNA ligation DNA ligation은 T4 DNA ligase 효소를 이용하여 DNA 말단을 phosphodiester 결합으로 연결하는 과정이다. 이 과정에서 vector와 insert의 ligation, vector의 self-ligation, insert의 self-ligation 등 세 가지 형태가 나타날 수 있다. 본 실험에서는 H...2025.01.22 · 자연과학
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_2차 풀레포트_TA Cloning과 Mini-Prep, Restriction enzyme & Gel electrophoresis1. TA Cloning TA Cloning은 PCR을 거친 product의 3'에 존재하는 A overhang과 T vector의 3'의 T overhang의 상보성으로 인해 cloning을 진행하는 기법이다. Lac Z selection을 통해 blue colony와 white colony를 확인하여 insert DNA가 정상적으로 삽입되었는지 확인할 ...2025.01.18 · 자연과학
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[서강대학교 현대생물학실험2] (2차 풀레포트) TA cloning & transformation, mini-prep, Enzyme cut, electrophoresis1. TA cloning TA cloning을 통해 insert를 삽입한 vector는 transformation을 이용해 세포에 주입하여 lacZ selection으로 insert 삽입 여부를 확인할 수 있다. lacZ operon이 작동하면 β-1, 4-linkage를 분해 시킬 수 있는 β-galactosidase가 생성된다. X-gal(5-bromo...2025.01.22 · 자연과학
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Plasmid purification & DNA 정량 A+ report1. Plasmid DNA transformation Plasmid DNA transformation이란 특정 종의 세포에 외부 유전자를 도입하여 그 세포가 새로운 유전자 정보를 표현하도록 하는 과정이다. 간단히 말해, ligation된 plasmid를 숙주세포 안으로 넣어주는 것이다. 일반적으로, plasmid는 작은 원형 DNA 조각으로서 bacteri...2025.01.17 · 의학/약학
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[A+ 리포트] Gel Extraction / Digestion & Purification (분자생물학실험)1. Gel Extraction 겔 전기영동 과정으로부터 얻은 DNA 조각을 순수한 형태로 정제할 수 있다. 겔 추출로 얻은 순수한 DNA 조각을 제한효소를 이용하여 특정 부위를 잘라낼 수 있다. 2. Digestion 제한효소를 이용하여 Gel Extraction 산물로 얻은 DNA 조각을 특정 부위에서 절단할 수 있다. 제한효소 처리 시 주의사항으로는 ...2025.04.25 · 자연과학
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_1차 풀레포트_PCR과 Agarose gel electrophoresis and gel purification1. Basic Laboratory Techniques 배지는 세포 배양을 위한 필요물질이 들어있는 것으로 LB broth와 LB agar plate를 이용한다. 수용성 세포를 형질전환 하고 선택배지로 제조된 LB agar plate를 이용해 생성된 colony로 형질전환 효율을 계산한다. 2. Competent Cell 수용성 세포(Competent ce...2025.01.18 · 자연과학
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[생화학 실험보고서] Detection of subcloning 8페이지
Detection of subcloning1. 목적Transformation된 cell을 키운 후 alkali를 이용하여 cell을 깨고 protein을 변성시키는 방법으로 plasmid DNA를 대장균에서 분리하여 subcloning 여부를 확인한다.2. 원리1) Small scale preparation of plasmid DNA by alkaliAlkaline solution이 base pairing을 완전히 파괴시키는 성질을 이용한다. 이러한 alkaline solution은 선택적으로 chromosomal DNA와 prot...2012.07.19· 8페이지 -
Mini scale preparation of plasmid DNA and verification 7페이지
Mini scale preparation of plasmid DNA and verificationAbstract이번 실험은 유전자 재조합에 가장 빈번하게 사용되는 E.coli의 plasmid DNA를 추출하는 기술로서 alkaline lysis를 이용하여 plasmid DNA를 추출하고, 이를 restriction enzyme으로 분석하여 검증하는 것이었다. Alkaline lysis를 이용한 Mini-scale preparation of plasmid DNA는 먼저 E.coli세포를 깨트리고 alkaline 조건을 제공하여 DNA...2009.12.23· 7페이지