계산화학을 이용한 H2 분자의 전자 구조 분석
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계산화학을 이용한 분자의 전자 구조 분석 결과레포트[물리화학실험, A+]
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2025.05.27
문서 내 토픽
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1. 양자화학 계산 방법론HF-SCF, B3LYP(DFT), MP2, CCSD(T) 등 다양한 양자화학 계산 방법을 H2 분자에 적용하여 비교 분석했다. CCSD(T)는 전자 상관관계를 고려하여 가장 정확한 결과를 제공하며, 최종 단일점 에너지가 -0.9997로 -1에 가장 가깝다. DFT(B3LYP)는 계산 속도가 빠르고 정확도도 높아 화학자들 사이에서 널리 사용된다. 각 방법은 전자 상관 효과 고려 여부와 계산 복잡도에서 차이를 보인다.
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2. 분자 구조 최적화 및 에너지 계산Avogadro 프로그램을 사용하여 H2 분자의 입력 파일을 생성하고, Orca를 통해 구조 최적화를 수행했다. 최적화 전 결합 길이는 0.708 Å, 최적화 후 0.747 Å로 이론값 0.74 Å과 유사하게 나타났다. 결합 길이에 따른 에너지 곡선을 0.2~4.0 Å 범위에서 0.1 Å 간격으로 계산하여 분자의 안정성과 반응성을 평가했다.
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3. 전자 상관관계와 기저 집합전자 상관관계는 양자 시스템에서 전자 간의 상호작용을 나타내며, Hartree-Fock 에너지와의 차이로 표현된다. 상관 에너지는 사용된 기저 집합에 크게 의존한다. def2-SVP는 분할된 가치편극, def2-TZVP는 가치 삼중 제타 편광에 사용되며, 분자의 크기와 복잡도에 따라 적절한 기저 집합을 선택해야 한다.
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4. 계산화학 실험 방법론슈퍼컴퓨터 서버에 원격 접속하여 Linux 명령어(ssh, passwd, cp, vi 등)를 사용해 계산을 수행했다. 입력 파일 생성, 에너지 계산, 구조 최적화, 결과 파일 다운로드 등의 전 과정을 터미널에서 관리했다. 계산 결과는 메모장과 Avogadro에서 확인하고, Microsoft Excel로 에너지 곡선 그래프를 작성했다.
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1. 양자화학 계산 방법론양자화학 계산 방법론은 현대 화학 연구의 핵심 기초를 이루고 있습니다. 하트리-포크 방법부터 밀도함수이론(DFT)에 이르기까지 다양한 접근법이 존재하며, 각각의 방법은 정확도와 계산 비용 사이의 균형을 제공합니다. 특히 DFT는 계산 효율성과 정확도의 우수한 조화로 인해 산업계와 학계에서 광범위하게 활용되고 있습니다. 그러나 방법론 선택 시 연구 대상의 특성과 요구되는 정확도를 신중히 고려해야 하며, 지속적인 알고리즘 개선과 컴퓨팅 성능 향상이 이 분야의 발전을 가속화하고 있습니다.
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2. 분자 구조 최적화 및 에너지 계산분자 구조 최적화는 화학적 성질을 예측하는 데 필수적인 과정입니다. 기울기 기반 최적화 알고리즘을 통해 분자의 안정한 기하학적 구조를 찾아내고, 이를 바탕으로 정확한 에너지값을 계산할 수 있습니다. 구조 최적화의 수렴 기준 설정과 초기 구조의 선택이 결과의 신뢰성에 큰 영향을 미치므로, 경험과 화학적 직관이 중요합니다. 또한 전이 상태 구조 탐색과 반응 경로 분석을 통해 화학 반응의 메커니즘을 이해할 수 있으며, 이는 신약 개발과 촉매 설계 등 실제 응용에 매우 유용합니다.
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3. 전자 상관관계와 기저 집합전자 상관관계는 양자화학 계산의 정확도를 결정하는 가장 중요한 요소 중 하나입니다. 하트리-포크 방법은 전자 상관관계를 무시하므로, 더 정확한 결과를 위해서는 상관관계 효과를 포함하는 고급 방법론이 필요합니다. 기저 집합의 선택도 마찬가지로 중요하며, 더 큰 기저 집합은 일반적으로 더 정확한 결과를 제공하지만 계산 비용이 증가합니다. 따라서 연구 목표와 가용 자원을 고려하여 적절한 기저 집합과 상관관계 처리 방법을 선택하는 것이 효율적인 계산을 위해 필수적입니다.
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4. 계산화학 실험 방법론계산화학 실험 방법론은 이론적 예측과 실험적 검증을 연결하는 중요한 다리 역할을 합니다. 계산 결과의 신뢰성을 평가하기 위해서는 실험 데이터와의 비교가 필수적이며, 이를 통해 사용된 방법론의 적절성을 판단할 수 있습니다. 또한 고처리량 계산을 통한 물질 탐색, 분자 성질 예측, 반응성 평가 등 다양한 응용이 가능합니다. 그러나 계산 결과의 한계를 인식하고, 실험과의 불일치 원인을 분석하여 방법론을 개선하는 반복적 과정이 중요합니다. 이러한 통합적 접근은 신소재 개발과 화학 공정 최적화에 큰 가치를 제공합니다.
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계산화학을 통한 유기분자 구조 분석1. C3H5N 이성질체의 에너지 및 분자 특성 C3H5N의 3가지 이성질체(2-propen-1-imine, propionitrile, 2-propargylamine)에 대해 계산화학을 이용하여 에너지(Hartree 및 kJ/mol), 쌍극자 모멘트(Debye)를 계산하고 비교 분석했다. 각 이성질체의 에너지는 -451799~-451570 kJ/mol 범위...2025.11.13 · 자연과학
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소프트웨어를 이용한 분자모델링 실험1. 분자 구조 최적화 및 에너지 계산 살리실산과 β-D포도당의 분자 구조를 소프트웨어로 최적화하여 에너지 값을 계산했다. 살리실산의 에너지 값은 0.480704 Kcal/mol, β-D포도당의 에너지 값은 15.507234 Kcal/mol으로 나타났다. 초기 구조와 최적화 구조의 RMS error 값은 각각 0.1046151Å와 0.5889375Å로 측정...2025.11.17 · 자연과학
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화학실험(A+보고서) - 계산화학실습1. H2 구조 최적화 수소 분자의 구조 최적화 결과를 분석하였다. ab initio 방법을 이용하여 수소 동핵이원자 분자의 구조 최적화를 실시하였으며, 수소 분자의 에너지, 결합 에너지, 분자 오비탈 구조 등을 확인하였다. 수소 분자의 결합 길이와 결합 에너지는 이론값과 비교적 잘 일치하였다. 2. He2 구조 최적화 헬륨 분자(He2)의 구조 최적화 결...2025.05.11 · 자연과학
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서울대학교, 화학실험, 만점, A+, 계산화학실습 예비보고서1. Hartree-Fock method Hartree-Fock method는 양자화학적 분자의 전자 구조 계산 방법으로, 슈뢰딩거 방정식을 풀기 위해 이를 전자 하나에 대한 방정식으로 변형한 후, 다른 전자가 미치는 영향을 평균적으로 근사하여 적용한다. 이를 통해 분자의 전자구조를 계산하고, 전자의 에너지와 분포를 예측할 수 있다. 2. 분자간 상호작용 ...2025.01.29 · 자연과학
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가우시안 프로그램을 통한 유기분자 구조 분석1. 가우시안 프로그램 가우시안 프로그램은 분자와 분자들 간의 화학반응의 모형에 대한 여러 가지 계산을 하는 프로그램 패키지입니다. 양자역학, 생물공학, 제약 등의 분야에서 화합물의 전자 구조 분석, 분자 구조 결정, 에너지 연구 및 반응 메커니즘 연구, 정성적 및 정량적인 양자역학을 이용한 계산 화학의 기본적인 소프트웨어로 사용되고 있습니다. 2. C3H...2025.05.01 · 자연과학
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동핵 이원자 분자의 구조 최적화 및 분자 오비탈 분석1. Hartree-Fock 방법과 계산화학 Hartree-Fock 방법은 원자핵의 위치를 고정시키고 전자들 간 상호작용을 고려하지 않으며 한 전자를 기준으로 다른 전자들의 평균장을 바탕으로 계산하는 방법이다. 이 방법은 정확하지 않으며, 특히 전자 수가 많은 원자(N, F)에서 전자 간 상호작용이 중요하기 때문에 오차가 크게 발생한다. 보다 정확한 값을 ...2025.12.13 · 자연과학
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서울대학교 화학실험 계산화학실습 예비 레포트 2페이지
계산 화학 실습 2 예비보고서(학번, 소속, 이름)계산화학에서는 이론적인 수식을 이용해 화학적 성질을 기술한다. 이론에 따른 수식은 방정식과 값들의 정확한 관계를 담지만, 현실에서는 계산하기 어려운 변수들로 인해 식들을 실험에 정확히 적용하기 어렵다. 따라서 적절한 계산 결과를 얻기 위해서는 변수들을 간단히 고려하거나 제거하는 근사, 가정들이 필요하다. ‘계산 화학 실습 2’에서는 계산 화학의 이론을 이해하고, 계산 화학적 방법으로 단분자와 이분자의 구조를 최적화하는 활동을 진행한다. 또한, 이 과정을 통해 이론과 가정, 근사를 이...2025.07.18· 2페이지 -
서울대학교 화학실험 계산 화학 실습 결과 보고서 5페이지
계산 화학 실습 2(학번, 소속, 이름)Abstract‘계산 화학 실습 2’에서는 양자 계산 소프트웨어를 이용해 분자들의 구조를 최적화하고, 분자 구조에 영향을 주는 요인 및 분자 구조 계산 과정을 이해하고자 했다. ORCA 프로그램을 이용해 주어진 분자들의 구조에 대한 계산을 수행한 후 그 결과를 해석했다. 이 과정에서 양자 화학적 계산의 원리를 이해하고, 분자 구조 결정에 관련되는 요인들을 이해할 수 있었다.Instroduction원자 사이의 결합과 분자 구조의 결정에 있어 전자는 중요한 역할을 한다. 따라서 분자의 구조를 분석...2025.07.18· 5페이지 -
서울대학교, 화학실험, 만점, A+, 계산화학실습 예비보고서 2페이지
계산화학실습 예비보고서 2024-2 화학실험(028) 26동 509호 일시: 2024.11.14(목) Abstract 분자 수준의 할 때, 화학에서는 직접 관측하기 어려운 정보를 컴퓨터의 계산 능력을 빌려 연구한다. 이를 계산 화학이라 하며, 이는 분자 동역학과 양자 화학으로 나뉜다. 본 실험에서는 양자 화학 계산을 위해 Avogadro와 GAMESS 프로그램을 이용하여 CH4, C2H2, C2H4, H2O, H2S, H2Se 등의 6개 분자의 구조를 최적화하고, 각 분자의 에너지를 계산하여 분석하고자 한다. 또한 Hartree-F...2024.12.13· 2페이지 -
계산화학을 이용한 분자의 전자 구조 분석 예비레포트 [물리화학실험, A+] 10페이지
1. 실험 목적① 양자화학 계산 패키지인 ORCA의 사용법을 익힌다.② 분자 모델링 프로그램인 Avogadro를 이용하여 입력 파일을 생성해 계산을 수행한다.③ 분자의 안정한 구조를 찾는 방법을 배운다.④ 계산 결과로 생성된 파일을 해석한다.⑤ 다양한 양자화학 계산 방법들을 이용하여, 수소 분자의 에너지가 결합 길이에 따라 어떻게 변하는지 계산한다.⑥ 다양한 양자화학 계산 방법들의 특징과 한계를 분석한다.2. 실험 이론① 계산화학1) 계산화학(컴퓨터 화학)- 계산으로 이론화학의 문제를 다루는 화학의 분야 중 하나이다.- 분자, 원자...2025.05.25· 10페이지 -
화실기_Quantum Chemistry Calculation SN2 Reaction_보고서 11페이지
Quantum Chemistry Calculation SN2 Reaction1. ABSTRACT계산 화학은 기본적인 물리화학의 원리를 바탕으로 화학물의 구조와 화학 반응을 수치적으로 모델링하여 연구하는 학문이다. 분자의 화학적인 특성은 슈뢰딩거 방정식에서 wave function을 찾아내고, ideal value를 찾은 후 방정식을 풀면 분자의 구조나 모든 chemical property들을 알 수 있다고 알려져 있다. 그러나 문제는, 수학적으로 그 모든 것을 계산하기에는 한계가 있다는 것이다. 즉, H이온이나 He이온 같이 작은 ...2024.07.14· 11페이지
