전자구조 방법을 이용한 계산화학
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Computational Chemistry with Electronic Structure Methods
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2023.06.15
문서 내 토픽
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1. 1,2-Dichloro-1,2-Difluoroethane 입체이성질체의 에너지 계산GaussView 프로그램을 사용하여 1,2-Dichloro-1,2-Difluoroethane의 RR형과 meso형 입체이성질체를 생성하고 RHF/6-31G(d) 방법으로 에너지를 계산했다. RR형의 전체 에너지는 -749683.844 kcal/mol, meso형은 -749685.451 kcal/mol로 약 1.607 kcal/mol의 차이가 있으며, 이는 C-C 단일결합 회전 시 Cl과 F 원자의 입체장애로 인한 것이다. RR형의 쌍극자 모멘트는 2.8351 Debye, meso형은 0.0021 Debye로 대칭 구조의 meso형은 쌍극자 모멘트가 상쇄된다.
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2. 에틸렌과 포름알데히드의 분자궤도 계산 및 시각화에틸렌과 포름알데히드의 분자궤도를 RHF/6-31G(d) 방법으로 계산하여 HOMO와 LUMO를 비교했다. 에틸렌은 대칭 구조로 쌍극자 모멘트가 0이며, 포름알데히드는 3.0447 Debye이다. 두 분자 모두 8번째 분자궤도가 HOMO, 9번째가 LUMO이다. 에틸렌의 HOMO는 π 결합궤도, LUMO는 π* 반결합궤도로 형태 차이가 크며, 탄소의 2p 궤도가 전체 분자궤도에 중요한 역할을 한다.
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3. SN2 반응의 전이상태 최적화 및 반응경로 결정CH3Cl과 F-의 SN2 반응에서 전이상태 구조를 최적화하고 IRC(내재적 반응좌표) 계산을 수행했다. 반응물의 에너지는 -598.545927 hartree, 전이상태는 -598.540393 hartree, 생성물은 -598.6055 hartree이다. 활성화 에너지는 14.629 kJ/mol, 반응 엔탈피는 -156.409 kJ/mol로 발열반응이며, 전이상태가 반응물과 더 유사한 특성을 보인다.
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4. 양자화학 방법과 계산화학의 원리계산화학은 슈뢰딩거 방정식(HΨ=EΨ)을 수치적으로 풀어 분자 구조와 화학반응을 연구하는 분야이다. 양자화학 방법은 반경험적 방법, ab initio 방법, 밀도범함수 방법으로 나뉘며, 전자 분포를 직접 계산하여 화학반응 연구에 적합하다. 그러나 복잡한 분자에 대해 수치 계산에 많은 시간이 소요되는 한계가 있다.
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1. 1,2-Dichloro-1,2-Difluoroethane 입체이성질체의 에너지 계산1,2-Dichloro-1,2-difluoroethane의 입체이성질체 에너지 계산은 계산화학의 중요한 응용 분야입니다. 이 분자는 중심 C-C 결합 주위의 회전으로 인해 여러 입체이성질체를 형성하며, 각 구조의 상대적 안정성을 이해하는 것은 분자의 물리화학적 성질을 예측하는 데 필수적입니다. DFT나 ab initio 방법을 사용한 에너지 계산을 통해 가장 안정한 배치(anti 또는 gauche)를 결정할 수 있으며, 이는 입체 장애와 전자적 효과의 상호작용을 반영합니다. 회전 에너지 장벽 계산은 분자의 동적 거동을 이해하는 데 도움이 되며, 실험적 분광학 데이터와의 비교를 통해 계산 방법의 정확성을 검증할 수 있습니다.
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2. 에틸렌과 포름알데히드의 분자궤도 계산 및 시각화에틸렌과 포름알데히드의 분자궤도 계산은 유기화학의 기본 개념을 이해하는 데 매우 유용합니다. 두 분자 모두 π 결합을 포함하고 있어 HOMO-LUMO 갭과 반응성을 분석하기에 이상적입니다. 분자궤도 시각화를 통해 π 전자의 공간적 분포, 결합 특성, 그리고 친전자성 또는 친핵성 부위를 명확히 파악할 수 있습니다. 특히 포름알데히드의 경우 카보닐 그룹의 극성과 반응성이 분자궤도 이론으로 잘 설명되며, 이는 유기반응 메커니즘 교육에 효과적입니다. 계산 결과의 시각화는 학생들의 이해도를 높이고 분자 구조와 반응성 간의 관계를 직관적으로 보여줍니다.
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3. SN2 반응의 전이상태 최적화 및 반응경로 결정SN2 반응의 전이상태 최적화는 계산화학에서 가장 도전적이면서도 의미 있는 작업 중 하나입니다. 전이상태는 반응 경로상에서 가장 높은 에너지를 가지는 구조이며, 이를 정확히 찾는 것은 반응 메커니즘과 활성화 에너지를 이해하는 데 필수적입니다. 반응경로 결정(IRC) 계산을 통해 전이상태가 실제로 반응물과 생성물을 연결하는지 확인할 수 있습니다. 용매 효과를 포함한 계산은 실제 화학 환경을 더 잘 반영하며, 다양한 핵친핵체와 이탈기의 조합에 대한 반응성 비교가 가능합니다. 이러한 계산은 유기합성 전략 수립과 반응 조건 최적화에 실질적인 도움을 제공합니다.
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4. 양자화학 방법과 계산화학의 원리양자화학 방법과 계산화학의 원리는 현대 화학의 기초를 이루는 중요한 분야입니다. Hartree-Fock, DFT, 그리고 post-Hartree-Fock 방법들은 각각 정확성과 계산 비용 사이의 서로 다른 균형을 제공하며, 연구 목표에 따라 적절한 방법을 선택해야 합니다. 기저 집합의 선택도 계산 결과의 정확성에 큰 영향을 미치므로 신중한 고려가 필요합니다. 계산화학은 실험을 보완하고 분자 수준에서의 메커니즘을 이해하는 강력한 도구이지만, 계산 결과의 한계와 근사를 항상 인식해야 합니다. 지속적인 방법론 개발과 컴퓨터 성능 향상으로 더욱 복잡한 시스템의 정확한 예측이 가능해지고 있습니다.
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양자화학 계산을 이용한 전자구조 방법론 연구1. 1,2-Dichloro-1,2-Difluoroethane의 입체이성질체 에너지 계산 1,2-Dichloro-1,2-Difluoroethane의 meso-form과 RR-form의 쌍극자 모멘트와 전체 에너지를 계산했다. meso-form은 쌍극자 모멘트 0.0174 debye, 전체 에너지 -749688.302 kcal/mol이고, RR-form은 쌍...2025.12.19 · 자연과학
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양자화학 계산을 이용한 전자구조 방법 실험1. 계산화학(Computational Chemistry) 계산화학은 원자와 분자를 수치적으로 모델링하여 화학 반응, 분자 구조, 역학을 연구하는 분야입니다. 실험적 방법의 한계와 일시적 분자 상태의 불안정성으로 알 수 없었던 화학을 이해할 수 있습니다. 양자화학과 고전 분자동역학을 포함하며, Schrödinger 방정식을 기반으로 합니다. 주요 방법으로는...2025.12.19 · 자연과학
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Computational chemistry A+ 물리화학실험 결과보고서1. Avrogadro를 이용한 butane 구조 최적화 Avrogadro 프로그램을 사용하여 butane 분자의 최적화된 구조를 geometry optimization을 통해 그렸다. force field로 UFF를 사용하였으며, gauche와 anti 구조는 그대로 두고 fully eclipsed와 eclipsed 구조에 대해서는 constraints ...2025.01.28 · 자연과학
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동국대학교 화학과 물리화학실험 분자의 구조 및 에너지 예측 레포트1. 계산화학 계산화학(Computational Chemistry)은 컴퓨터를 이용해 이론 계산을 하고 복잡한 화학ㆍ물리 현상을 분자 수준에서부터 해명하려는 것이다. 컴퓨터 화학에는 분자궤도(MO; Molecular Orbital) 계산, 계산기 시뮬레이션, 데이터베이스의 3개 영역이 포함된다. 분자궤도 계산은 이론적으로 도출한 파라미터를 사용하는 애비니시...2025.01.23 · 자연과학
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A+ 물리화학실험-계산화학 실습 (Gaussian View) 실험 보고서1. 계산화학 계산화학은 화학 전체를 크게 나누는 분류 중 하나인 물리화학 분야에 속하는 이론 물리화학의 한 부분이다. 이론 모형을 기반으로 개발된 컴퓨터 프로그램을 연구대상인 분자에 적용하여 모사실험을 수행한 후, 그 결과를 분석하는 것이 계산화학 분야 연구의 주요 내용이다. 계산화학은 실제 실험에서의 제한 조건에서 자유롭기 때문에, 일반 조건에서 안정하...2025.01.07 · 자연과학
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(A+)일반화학실험I 계산화학 결과 보고서1. 계산 화학 계산 화학은 컴퓨터의 계산 능력을 이용하여 복잡한 시스템을 기술하려고 시도하는 분야를 말하며, 주요 방법으로는 Ab initio, Density Functional, Semi-empirical, Molecular Mechanics 등이 있다. 이 실험에서는 이러한 계산 화학 방법들을 이용하여 다양한 분자 구조와 에너지 특성을 분석하였다. 2...2025.05.11 · 자연과학
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계산화학을 이용한 분자의 전자 구조 분석 예비레포트 [물리화학실험, A+] 10페이지
1. 실험 목적① 양자화학 계산 패키지인 ORCA의 사용법을 익힌다.② 분자 모델링 프로그램인 Avogadro를 이용하여 입력 파일을 생성해 계산을 수행한다.③ 분자의 안정한 구조를 찾는 방법을 배운다.④ 계산 결과로 생성된 파일을 해석한다.⑤ 다양한 양자화학 계산 방법들을 이용하여, 수소 분자의 에너지가 결합 길이에 따라 어떻게 변하는지 계산한다.⑥ 다양한 양자화학 계산 방법들의 특징과 한계를 분석한다.2. 실험 이론① 계산화학1) 계산화학(컴퓨터 화학)- 계산으로 이론화학의 문제를 다루는 화학의 분야 중 하나이다.- 분자, 원자...2025.05.25· 10페이지 -
계산화학을 이용한 분자의 전자 구조 분석 결과레포트[물리화학실험, A+] 8페이지
1. 실제 실험방법① 슈퍼컴퓨터 서버 원격 접속하기1) 다음과 같은 명령어를 입력하여 서버에 접속한다.2) passwd 명령어를 사용하여 암호를 변경한다. → passwd: 1 enter② Avogadro 프로그램 실행 후 H2 분자에 대한 입력 파일 생성하기1) 왼쪽 ‘Element’에서 수소(hydrogen)를 선택하여 수소 분자를 그린다.2) 위쪽 ‘Extensions’에서 ‘Optimize Geometry’를 선택하여 구조 최적화를 수행한다. → 0.708 A'3) ‘Extensions’에서 ‘Orca’ 의 ‘Generate...2025.05.25· 8페이지 -
서울대학교 화학실험 계산화학실습 예비 레포트 2페이지
계산 화학 실습 2 예비보고서(학번, 소속, 이름)계산화학에서는 이론적인 수식을 이용해 화학적 성질을 기술한다. 이론에 따른 수식은 방정식과 값들의 정확한 관계를 담지만, 현실에서는 계산하기 어려운 변수들로 인해 식들을 실험에 정확히 적용하기 어렵다. 따라서 적절한 계산 결과를 얻기 위해서는 변수들을 간단히 고려하거나 제거하는 근사, 가정들이 필요하다. ‘계산 화학 실습 2’에서는 계산 화학의 이론을 이해하고, 계산 화학적 방법으로 단분자와 이분자의 구조를 최적화하는 활동을 진행한다. 또한, 이 과정을 통해 이론과 가정, 근사를 이...2025.07.18· 2페이지 -
[물리화학실험] Gaussian을 이용한 양자화학 계산 예비보고서 A+ 3페이지
물리 화학 실험예비보고서1. 실험 제목Gaussian 을 이용한 양자화학 계산2. 실험 원리1) Computational chemistry(계산화학)- 계산화학은 분자, 원자, 원자의 구성 입자의 운동과 상태를 나타내는 함수를 컴퓨터를 이용해 계산함으로써 화학 물질들의 이론적인 문제를 다루는 학문이다.2) Gaussian software- 1970년도 John Pople 연구팀이 계산화학(computational chemistry)을 위해 제조한 양자화학 계산 프로그램이다. 관심 대상 분자들에 의해 single point energ...2024.07.26· 3페이지 -
Exp3. Computational chemistry (Quantum chemistry SN2 reaction) 7페이지
Computational Chemistry with Electronic Structure Methods (Quantum chemistry Calculation: SN2 Reaction) Abstract 본 실험에서는 Gaussian09 및 Gaussianview를 이용하여 총 세 가지의 실험을 진행하였다. 먼저, 1,2-dichloro-1,2-difluoroethane의 RR- 그리고 meso-form을 만들어 에너지와 dipole moment를 계산하였다. 다음으로 isoelectric한 ethylene과 formaldehyde의...2024.10.31· 7페이지
