에도 흔들리지 않았다. 이러한 학문의 태도로 저술된 것이 바로 《화담집》으로 여기에는 시, 편지와 우주에 대한 그의 견해가 실려 있다.현재 《화담선생문집》으로 전하는 이 책은 본집 2권 ... 과 부록 2권으로 꾸며져 있다. 그러나 화담 자신이 쓴 것은 본집 2권이며 부록 2권은 그의 연보와 비명을 비롯한 여러 형식의 추모문으로 후세의 사람들이 써 모은 글이다. 본집 2권 ... 가운데 제1권은 시문을 모은 것이고 제2권은 각종 서신, 잡저, 서문, 명문을 모아 그의 철학을 밝히고 있다. 그 가운데서도 잡저에 있는 원리기(原理氣), 이기설(理氣說), 태허설