화학실험 - 펩타이드 질량분석과 단백질 동정

소개

화학실험 - 펩타이드 질량분석과 단백질 동정 실험으로 요점과 과정 방법 결과를 알아본다

목차

1. Abstract & Introduction
2. Data & Result
3. Discussion

본문내용

1. Abstract & Introduction
우리의 몸은 단백질로 이루어져 있다. 우리 몸 안에서의 반응들을 이해하는 데는 각각의 반응에서 어떤 단백질들이 이용되는지 아는 것이 중요하다. 그러면 단백질을 구분하는 방법에는 어떤 것들이 있을까? 분자량측정이나 다른 여러 방법들이 있겠지만, 최근 가장 많이 쓰이는 것이 MALDI-TOF-MS라는 방법이다. 이번 실험에서는 이러한 MALDI-TOF-MS방법을 사용해 주어진 단백질이 어떤 단백질인지 구별해본다.

2. Data & Result
미지의 단백질 A를 트립신으로 가수분해 시킨 뒤, MALDI-TOF 질량분석기로 펩타이드 조각들의 질량을 측정하였다. 아래는 peak가 비교적 높은 펩타이드들의 결과이다

여기서 m/z는 비질량인데, 원래의 비질량의 정의는 1C당 g수이다. 여기에서는 +1가 이온 1개의 전하량이 1.6*10^(-19)C이니까, 이를 +1z이라 재정의 하고, +1가의 이온의 전하 당 질량을 나타낸 것이다. 우리가 측정한 [M+H]+는 +1가 이므로 여기서의 비질량은 분자량과 같다. intens는 peak의 높이인데, 숫자가 클수록 많이 검출되었다는 소리이다. area는 스펙트럼의 면적을 나타낸 값으로 intens와 같은 추세를 갖는다.

2) 검출될 수 있는 peptide분자량
펩타이드 속 아미노산의 개수가 10개 이상인 것만 계산을 하였다. 10개 이하면 다른 단백질에서도 같은 아미노산 배열을 가진 펩타이드들이 검출될 가능성이 있기 때문이다. 아미노산이 10개인 펩타이드중 같은 것이 형성될 확률은 (1/22)^10+α <= 3.8*10^(-14) ≒ 0이다.(사실 5개나 6개로 잡아도 확률은 0에 상당히 가깝지만, 실험결과 1400~1800대에 해당되는 값들이 주로 나왔고, 이에 맞추어 그냥 제 나름대로 기준을 10개로 잡아보았습니다.)

참고자료

· 없음