미생물의 환경에서는 수소이온의 농도가 미생물의 생장에 매우 중요한 환경요인의 하나이다. 수소이온 농도는 pH로 표시(=log 1/H+)하며, pH는 미생물의 효소의 활성을 좌우한다. 즉 새로운 원형질 합성에 관여하는 여러 종류의 효소들은 모두 수소이온 농도에 따라 활성이 좌우되므로 pH조건은 곧 미생물의 생장과 직결되는 환경 요인인 것이다. 온도의 경우에서도 최적 온도가 있듯이 미생물마다 최적 수소이온의 농도가 존재하는데, 최적 수소이온 농도에서의 생장이 가장 빠르고 양호하다. 배지의 조정, 배양, 온도, 삼투압 등의 환경 조건이 달라질 경우 수소이온 농도도 달라지기 마련이다. 미생물의 생장이 일어날 수 있는 최소의 낮은 값의 pH, 또는 반대로 매우 높은 최대의 pH값을 각각 최소 수소이온 농도와 최대 수소이온 농도 라고 한다.
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