PCR-CAPS에 의한 국내 육성 배 계통의 자가불화합성 유전자형 결정 (Determination of S-genotype of Korean-bred Pyrus pyrifolia Strains Based on PCR-CAPS)

서지정보

· 발행기관 : 한국원예학회
· 수록지 정보 : Horticulture, Environment, and Biotechnology / 43권 / 2호 / 113 ~ 119페이지
· 저자명 : Hoy-Taek Kim, 신동영, 황해성, 황정환, 신용억, Yutaka Hirata, 노일섭

초록

새로 육성된 22개의 국내 육성 배 계통과 2개의 국내육성 배 품종 및 3개의 일본 배 품종의 자가불화합성 유전자형을 PCR-CAPS 분석에 의해 결정하였다. 게놈 DNA로 부터 S-RNase 유전자를 PCR법에 의하여 증폭하였고, 증폭한 S-RNase 산물을 클로닝하여 염기서열을 결정하였다. 7개의 S-RNase 간에 상동성이 높은 영역인 exon 사이에 변이가 큰 영역인 intron이 한 개 존재하였다. Intron 크기는 S1=167 bp, S2=1153 bp, S3=179 bp, S4=168 bp, S5=179 bp, S6=147 bp, S7=152 bp이었다. 그리고 각각의 S-allele의 특이적인 제한효소 EcoRI(S1- and S4-RNase), NdeI(S4-RNase), Eco0109I(S3- and S5-RNase), AlwNI(S5-RNase), MluI(S6- and S7-RNase), HinCII(S6-RNase)를 선발할 수 있었다. S-allele의 특이적인 제한효소를 이용한 PCR-CAPS 분석에 의해 국내 육성 배 계통 및 품종의 자가불화합성 유전자형을 결정하였다.

영어초록

S-genotype of the newly bred 22 Korean-bred pear strains, 2 Korean-bred cultivars and 3 Japanese cultivars were identified using PCR-CAPS analysis. The S-RNase genes were amplified from genomic DNA using S-RNase PCR method. PCR fragments of S-RNase genes were cloned and sequenced. S-RNase genes had an intron, which was hypervariable region, between exons whose homologies were fairly high among S1 to S7 RNase. The intron sizes were S1=167 bp, S2=1153 bp, S3=179 bp, S4=168 bp, S5=179 bp, S6=147 bp, and S7=152 bp, respectively. In addition, the specific restriction endonucleases for each S-allele were selected such as EcoRI (S1- and S4-RNase), NdeI (S4-RNase), Eco0109I (S3- and S5-RNase), AlwNI (S5-RNase), MluI (S6- and S7-RNase), and HinCII (S6-RNase). S-genotype of 2 Korean-bred cultivars and 22 Korean-bred strains and 3 Japanese-bred cultivars were determined by S-allele specific PCR-CAPS analysis.

참고자료

· 없음