매발톱꽃속 12품종의 URP-RAPD에 의한 유전적 관계분석

서지정보

· 발행기관 : 한국화훼학회
· 수록지 정보 : 화훼연구 / 15권 / 1호
· 저자명 : 김동민, 권지연, 임기병, 김현희

초록

매발톱꽃속(genus Aquilegia)에 속하는 국내 3분류 군과 외래종 9분류군을 대상으로 RAPD분석을 실시하 여 종의 특이성 및 종간 유연관계를 비교 분석하였다. RAPD분석은 annealing 온도가 높아 재현성이 뛰어난 20mer primer인 URP primer 12쌍을 사용하였다. 12 쌍의 URP primer 중 6개의 primer에서 polymorphism 을 보이는 DNA band가 검출되었다. 검출된 band는 약 4kbp~200bp의 비교적 넓은 범위에 분포되어 있었 다. 총 93개의 DNA band가 검출되었으며 이 중 81 개 DNA band(87.1%)가 polymorphic한 band 양상 을 보였다. Polymorphism을 보이는 DNA band는 각 primer에 대해 10~16개로, 평균 13.5개의 DNA band 가 검출되어 유사도 행렬 계산에 사용되었다. 유사도 행렬 작성 결과 약 52.7~90.3%의 범위 안에서 유사 도를 나타냈으며, 이를 기준으로 dendrogram을 작성한 결과, 약 63%의 유사도에서 2개의 group으로 나뉘는 것을 확인할 수 있었다.

영어초록

Genetic relationship of 12 taxa of genus Aquilegia was investigated using random amplified polymorphic DNA (RAPD). The RAPD was carried out with 12 universal rice primers (URP), which has high reproducibility and high annealing temperature. Among the 12 primers tested, six primers detected polymorphic DNA bands. The size of amplified DNA fragments were in the range of about 4 kbp~200 bp. Among total 93 bands obtained, 81% (87.1%) showed polymorphic DNA bands. The number of DNA bands, which showed a polymorphism was in the range 10~16 according to the primer. Similarity matrix based on URP-RAPD results was in the range of 52.7~90.3%. The dendrogram was constructed with UPGMA (unweighted pair group method using arithmetic average) and it was divided into two major groups at 63% of a similarity index.

참고자료

· 없음