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Restriction Enzyme Digestion and Gel Electrophoresis 레포트2025.01.211. Plasmid DNA와 Vector Plasmid DNA는 박테리아 세포 내에 염색체와 별도로 존재하면서 독자적으로 복제, 증식할 수 있는 원형 DNA 분자를 말한다. Plasmid Vector는 원하는 특정 유전자를 운반할 수 있고, 한 세대의 박테리아로부터 다음 세대로 전달되기 때문에, DNA 클로닝을 위한 핵심적인 도구이다. Vector에는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site과, 클로닝이 이루어진 후 많은 박테리아 중에서 vector를 가지고 있는 박테리아만 분리할 수 있도록 하는...2025.01.21
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PCR 분자 마커에 의한 식물병원균 동정2025.01.141. 미생물 분류 미생물은 지권, 수권, 기권의 다양한 환경 조건에서 풍부한 현존량으로 환경의 항산성 유지와 물질 순환에 중심적인 역할을 하고 있으며 식물병원체의 감염, 항생물질 생산, 자연 정화 및 식량자원 등 유용‧유해한 역할을 담당하고 있다. 미생물의 분류는 현미경과 배양적 특성 및 이화학적 특성에 의존하여 현재까지 분류체계가 지속되고 있다. 2. PCR 기술 PCR은 표적 핵산을 증폭하여 검출하는 검사법으로 1988년 Saiki에 의해 온천 지역과 같은 고온에서 생육하는 세균인 Thermus aquotus로부터 열에 안정한 ...2025.01.14
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DNA 추출 및 PCR, PCR 결과 확인(전기영동) 레포트2025.04.251. DNA 추출 DNA 추출 과정에서 Vortexing이나 Tapping을 하지 않고 Inverting하는 이유는 고분자인 gDNA에 물리적인 힘이 크게 가해져 gDNA의 손상이 일어나는 것을 방지하기 위해서이다. gDNA 전기영동 결과에서 Clean band가 나오지 않은 이유는 gDNA가 크기가 무척이나 크기 때문에 일련의 실험 과정에서 많이 부서져 부서진 조각들의 크기가 다양하여 전기영동 시 clean band가 나오지 않고 번진 형태로 나타났기 때문이다. 2. PCR PCR product의 전기영동 결과를 보면 500~60...2025.04.25
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겔 전기영동 (agarose gel electrophoresis) 실험 리포트2025.01.141. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis은 크기에 따라 핵산(DNA 또는 RNA) 조각을 분리하는 데 사용되는 전기영동 종류이다. 음전하를 띤 DNA/RNA는 전류가 가해질 때 agarose gel의 기공을 통해 gel의 양전하 말단으로 이동하고 이때 더 작은 조각이 더 빠르게 이동한다. 결과 밴드는 자외선(UV)을 사용하여 시각화할 수 있다. 2. Taq polymerase Taq polymerase는 호열성 박테리아인 Thermus aquaticus에서 추출한 열 ...2025.01.14
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[A]서강대학교 현대생물학실험2_1차 풀레포트_PCR과 Agarose gel electrophoresis and gel purification2025.01.181. Basic Laboratory Techniques 배지는 세포 배양을 위한 필요물질이 들어있는 것으로 LB broth와 LB agar plate를 이용한다. 수용성 세포를 형질전환 하고 선택배지로 제조된 LB agar plate를 이용해 생성된 colony로 형질전환 효율을 계산한다. 2. Competent Cell 수용성 세포(Competent cell)란, 외부의 DNA를 수용할 수 있는 상태의 박테리아로, 자연적으로 유도될 수 있지만 본 실험에서는 Ca2+ 용액 처리와 냉각과 열 충격을 주어 인위적으로 유도한다. 3. P...2025.01.18
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마우스 꼬리로부터 게놈 DNA 추출 및 분석2025.01.041. 게놈 DNA 추출 실험을 통해 마우스 꼬리에서 게놈 DNA를 추출하는 과정을 이해하였습니다. 세포 용해, DNA 정제, 농도 측정 등의 단계를 거쳐 순도 높은 게놈 DNA를 얻을 수 있었습니다. 이 과정에서 주의해야 할 점들, 예를 들어 과도한 tapping이나 오염물질 혼입 등을 확인하였습니다. 2. DNA 전기영동 추출한 게놈 DNA를 아가로스 겔 전기영동을 통해 분석하였습니다. 10,000 bp 이상의 큰 DNA 단편이 가장 뚜렷하게 관찰되었지만 번진 모습(smear)을 보였고, 그 외에도 1,000-2,000 bp 및 ...2025.01.04
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유전자와 유전자 활성 연구를 위한 분자도구2025.01.181. 서던블롯 서던블롯은 특정 DNA 절편을 동정하는 데 사용되는 기술입니다. 이 방법은 genomic DNA를 제한효소로 자른 후 아가로스 겔 전기영동을 통해 크기별로 분리합니다. 그리고 DNA를 변성시켜 nitrocellulose 또는 nylon 멤브레인으로 이동시킵니다. 이렇게 이동된 DNA는 방사선 동위원소나 비방사선 물질로 표지된 DNA 또는 RNA 탐침과 하이브리다이제이션되어 자기방사법 등을 통해 검출됩니다. 이 기술은 genomic DNA뿐만 아니라 plasmid, cosmid, bacteriophage 등의 분석에도 ...2025.01.18
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박테리아에서의 DNA 분리2025.01.231. Plasmid DNA 분리 이 실험에서는 박테리아에서 Plasmid DNA를 분리하는 과정을 이해하는 것이 목적입니다. Plasmid DNA는 박테리아의 염색체 DNA와는 별도로 존재하는 작은 원형 DNA 분자입니다. Plasmid DNA 분리법을 사용하여 박테리아 DNA를 분리하는 단계별 과정을 수행하였습니다. 2. 박테리아 배양 실험 방법에 따르면 ampicillin이 포함된 LB 배지에 박테리아 colony 1개를 넣고 37°C에서 12~16시간 동안 배양하였습니다. 이를 통해 박테리아를 증식시켜 DNA 추출을 위한 충분...2025.01.23
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Realtime PCR을 이용한 유전자 발현 분석)2025.01.231. RNA sequencing RNA sequencing은 DNA로부터 전사되는 모든 RNA 전사체의 염기서열을 차세대 분석기술을 사용하여 분석하는 기술이다. RNA sequencing을 위해서는 cDNA가 필요한데 cDNA를 준비하는 일반적 과정은 보통 RNA 추출>RNA 선택>cDNA 합성>라이브러리 제작으로 이루어진다. RNA 염기서열 분석 기술을 통해 alternative RNA splicing, 유전자의 발현량, 염기서열의 변이, gene fusion, single nucleotide polymorphism, SNP 등의...2025.01.23
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플라스미드 미니 준비 발표2025.01.061. 플라스미드 플라스미드는 박테리아가 가진 염색체 이외의 DNA 분자입니다. 1952년 미국의 유전학자 J. 레더버그가 최초로 플라스미드를 발견했으며, 이는 박테리아가 독자적으로 증식할 수 있는 DNA 분자라는 의미로 명명되었습니다. 플라스미드는 유전공학에서 중요한 역할을 하며, 플라스미드 준비는 플라스미드 DNA를 추출하고 정제하는 과정입니다. 2. 플라스미드 미니 준비 플라스미드 미니 준비는 박테리아로부터 소량의 플라스미드 DNA를 추출하고 정제하는 방법입니다. 이 방법은 많은 후보를 빠른 시간 내에 분석할 수 있게 해줍니다....2025.01.06
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