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세포생리학실험_cell culture, Genomic DNA Isolation_genomic DNA 추출, total RNA 추출, 전기영동2025.01.131. 세포 배양 HEK 293T 세포를 DMEM 배지와 FBS를 사용하여 배양하였다. 세포는 처음에는 동글동글한 모양이었지만 점차 바닥에 붙어 자라나면서 별모양의 형태를 띠었다. 배지의 색이 점점 노란색으로 변하면서 세포가 죽기 시작하였다. 이를 통해 세포가 일정 횟수의 분열을 한 후 노화되는 과정을 관찰할 수 있었다. 2. Genomic DNA 추출 HEK293T 세포에서 genomic DNA를 추출하였다. 세포를 용해시킨 후 단백질과 RNA를 제거하는 과정을 거쳐 순수한 DNA를 분리하였다. 전기영동 결과 DNA 밴드가 마커보다...2025.01.13
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인간 게놈 프로젝트와 유전병 치료2025.01.291. 인간 게놈 프로젝트 인간 게놈 프로젝트는 인간 DNA를 구성하는 약 30억 쌍의 뉴클레오타이드 염기쌍을 염기 서열화하는 것을 목적으로 진행되었다. 현재 인간 유전자는 약 20,000개에서 25,000개 정도가 있다고 밝혀졌으며, 이 정보를 활용하여 질병 유전자를 확인하고, 유전 질환에 대한 검사와 치료법을 개발할 수 있게 되었다. 2. 계층별 염기 서열법 계층별 염기 서열법은 인간의 염색체를 토막내어 약 200킬로 염기쌍 크기로 벡터에 저장한 게놈 도서관을 만들고, 서로 중복되는 클론들을 찾아내어 배열하는 방식이다. 이 방법의...2025.01.29
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생물의 분류-분자계통분류 실험 보고서2025.05.141. 생물의 분류 이번 실험에서는 5s ribosomal mRNA nucleotide sequence를 사용하여 계통수를 그렸다. 5S rRNA는 120nt 정도의 작은 RNA 분자이고 생물학적 기능에 대해 다양한 연구가 진행되어 오고 있다. 5S rRNA는 Escherichia coli ribosomes의 large subunit의 한 부분이다. Prokaryotes와 organelles에서는 5S rRNA는 하나의 긴 transcript의 한 부분으로 형성되어 maturation 과정에서 16S, 23S, 5S로 나뉘어지며 Eu...2025.05.14
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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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DNA 제한효소2025.01.151. 제한효소 제한효소는 세균이 박테리오파지의 공격을 받으면 생산하는 효소로 이중 나선의 DNA의 특정한 염기서열을 인식해 그 부분의 절단에 있어 촉매작용을 하는 효소이다. 대부분의 제한효소는 인식자리(recognition site) 또는 제한 자리(restriction site)라는 특정한 염기서열이 있는 자리에서 DNA를 절단한다. 제한효소는 회문이라는 양 사슬의 5'부터 3' 방향으로 똑같은 서열을 가진 DNA의 부위를 인식해 작용한다. 제한효소가 DNA를 절단하면 이중 가닥 중 한 가닥이 돌출된 형태를 띠는데 이를 점착 말단...2025.01.15
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[A+레포트] DNA 제한효소 예비레포트2025.01.221. 제한효소 제한효소는 생물이 자기 세포에 다른 종류의 DNA가 들어오면 이를 파괴하는 기능을 가진 효소이다. 유전공학에서는 재조합 DNA를 만들기 위해 사용되는 특수한 효소로 알려져 있다. 제한효소에는 크게 3종류가 있으며, 모두 특정한 DNA 염기 배열을 인식한다. 유전공학에서 잘 사용되는 것은 II형 제한효소이며, 절단부위가 인식부위의 가운데 위치하는 것이 특징이다. 2. 아가로스 겔 전기영동 전기영동은 DNA와 같은 전하를 띠는 물질들을 전기적으로 일정한 방향으로 이동시켜 분리하는 기술이다. DNA는 인산기에서 H+를 방출...2025.01.22
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유전적 다양성 및 세포 교배2025.01.181. 유전자 매핑 유전자 매핑은 유전자 간의 상대적 거리를 나타내는 지도로, DNA 염기 서열 내에서의 거리를 나타내는 물리적 지도, 염색체 내에서의 위치를 나타내는 세포학적 지도, 유전자 간의 상대적 거리를 나타내는 유전적 지도가 있다. 유전자 간의 거리는 교차율을 통해 확인할 수 있으며, 교차율이 높을수록 거리가 멀고 교차율이 낮을수록 거리가 가깝다. 2. tetrad 분리 효모의 유전 정보를 확인하는 실험 중 하나로, sporulating 효모의 tetrad를 분리하여 각각의 세포를 분리시켜서 배양하는 것을 의미한다. 이때 t...2025.01.18
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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람다 파지 DNA 관찰, PFU test 및 Optical mapping_서강대학교 바이오융합기술프로젝트1 레포트2025.01.191. λ phage DNA 관찰 실험에서는 DNA damaging을 이해하기 위한 첫 단계로 λ phage를 이용하여 DNA observation을 진행하였다. DNA가 포함된 plug에 proteinase K를 처리하여 phage의 구조 단백질과 DNase를 제거하고, (+)전하 cover glass 위에 DNA를 고정시켜 관찰하였다. PDMS nanochannel을 사용하여 DNA가 일직선으로 펴지도록 하여 관찰하였다. 2. PFU test PFU test를 통해 미지의 농도의 λ phage 용액 내 phage 입자의 개수를 확...2025.01.19
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식물의 DNA추출 - 통합과학 보고서2025.01.121. 식물 DNA 추출 이 보고서는 식물(바나나)에서 DNA를 추출하는 실험 과정과 결과를 설명합니다. 주방세제, 소금, 에탄올 등의 시약을 사용하여 세포막과 핵막을 파괴하고 DNA를 분리하는 방법을 다룹니다. 또한 DNA의 구조와 특성, 유전 정보 활용 등 관련 내용도 학습한 것으로 나타납니다. 2. 세포막 파괴와 DNA 안정화 주방세제는 계면활성제로 세포막의 인지질을 와해시키고, 소금은 DNA의 인산기와 결합하여 안정화시키고 뭉치게 하는 역할을 합니다. 에탄올은 DNA가 에탄올에 녹지 않는 성질을 이용하여 DNA를 침전시키는 데...2025.01.12