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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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아주대학교 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서2025.04.261. 생물정보학 생물정보학(bioinformatics)은 생물학과 컴퓨터의 정보학이 융합되어 발전된 학문으로, 생물의학을 포함한 다양한 과학 연구 분야를 지원하기 위해 정보 저장, 배포 및 분석을 위한 기술과 생물 데이터를 연결하는 하이브리드 과학이다. 본 실험에서는 생물정보학 Tool의 사용법을 익히고, 미지 유전자를 데이터베이스에 대조하여 서열을 탐구하며, 단백질 서열의 유사성을 비교해 보았다. 2. 핵산(nucleic acid) 핵산은 분해되어 인산, 당 및 유기 염기의 혼합물(퓨린 및 피리미딘)을 생성할 수 있는 자연 발생 ...2025.04.26
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유전자와 유전자 활성 연구를 위한 분자도구2025.01.181. 서던블롯 서던블롯은 특정 DNA 절편을 동정하는 데 사용되는 기술입니다. 이 방법은 genomic DNA를 제한효소로 자른 후 아가로스 겔 전기영동을 통해 크기별로 분리합니다. 그리고 DNA를 변성시켜 nitrocellulose 또는 nylon 멤브레인으로 이동시킵니다. 이렇게 이동된 DNA는 방사선 동위원소나 비방사선 물질로 표지된 DNA 또는 RNA 탐침과 하이브리다이제이션되어 자기방사법 등을 통해 검출됩니다. 이 기술은 genomic DNA뿐만 아니라 plasmid, cosmid, bacteriophage 등의 분석에도 ...2025.01.18
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Bioinformation: Analyzing Gene Sequences Using NCBI and BioEdit2025.01.061. 코돈(Codon) 코돈은 DNA에서 전사된 mRNA의 3염기 조합을 의미합니다. mRNA의 유전암호의 단위로, 이것에 의해 세포 내에서 합성되는 아미노산의 종류가 결정됩니다. 개시코돈(AUG)은 단백질 번역을 시작하는 첫 번째 코돈이며, 종결코돈(UAA, UAG, UGA)은 단백질 합성 과정이 끝났음을 알리는 신호로 작동합니다. 2. NCBI 데이터베이스 활용 NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 웹 기반 생물학 데이터베이스로, 유전자 및 단백질 정보를 얻을 수 있습니다...2025.01.06
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식품생화학 아미노산, 펩타이드, 단백질 요약2025.05.071. 아미노산과 펩타이드 아미노산은 단백질을 이루는 기본단위 물질로서, 20개 다른 종류의 아미노산이 결합하여 펩타이드를 이루고 단백질을 형성합니다. 아미노산은 극성 아미노산(중성, 산성, 염기성)과 비극성 아미노산으로 구분되며, 중성 pH 상태에서 양극성 이온 형태로 존재합니다. 펩타이드는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 구조이며, 일부 펩타이드는 고유의 생리활성을 가지고 있습니다. 대표적인 합성 펩타이드인 아스파탐은 감미료로 사용되고 있습니다. 2. 단백질 구조 단백질은 아미노산이 중합된 고분자 물질로, 1차 구조(아미노산 ...2025.05.07
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수학으로 예측한 DNA 염기 서열 '세 글자 암호'의 법칙2025.01.161. DNA 구조와 염기 서열 이 기사는 DNA의 구조와 염기 서열이 어떻게 수학적으로 조합되어 있는지를 설명하고 있습니다. DNA는 네 가지 염기 아데닌(A), 시토신(C), 구아닌(G), 티민(T)이 다양한 조합으로 이루어져 있으며, 이러한 염기 서열이 단백질의 형태와 기능을 결정하는 데 중요한 역할을 합니다. 이를 '생명의 수학'이라고 표현하며, 약물 개발 등 약학 분야에 중요한 영향을 미칠 것으로 기대됩니다. 2. 경우의 수 곱의 법칙 DNA의 네 가지 염기가 3개 조합될 때, AAA, AAC, AAG, ..., TTT와 같...2025.01.16
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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레닌저 생화학 정리노트 Ch09. DNA 기반 정보기술2025.05.101. 유전체(genome) 생물의 완전한 하나의 반수체 유전자를 의미하며, 유전체학(genomics)은 DNA에 대한 학문으로 세포와 개체 수준에서 생화학을 연구하는 학문인 system biology에 기여한다. 2. 클로닝 유전자와 그 산물에 대한 연구를 위해 동일한 복제물을 만드는 것으로, 특정 개체의 복제물(organism cloning), 특정한 유전자나 DNA 단편의 복사물(DNA cloning)을 만들 수 있다. 재조합 DNA(recombinant DNA)는 2개 이상의 소스에서 공유 결합된 조각으로 구성된 복합 DNA ...2025.05.10
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[만점 레포트] 연세대학교 생화학실험(1) 7주차 Peptide Mass Finger-Printing2025.05.041. MALDI-TOF 질량분석법 MALDI-TOF 질량분석법은 고분자 물질에 대해 시료의 분해 없이 기화/이온화가 가능한 방법으로, 일반적으로 질량이 크고 열에 불안정한 생체 고분자나 합성 고분자에 이상적으로 적용할 수 있다. 이 실험에서는 MALDI 이온화 장치와 TOF 질량 분석기를 이용하여 단백질을 동정하는 방법을 공부한다. 2. 단백질 동정 MALDI-TOF 질량분석법을 이용하여 단백질을 동정하는 과정을 설명한다. 시료를 MALDI 장치에 주입하고 질량 분석기로 분석한 후, 결과 스펙트럼을 데이터 검색 엔진에 입력하여 단백...2025.05.04
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유전자와 유전체의 유전암호2025.05.101. DNA 유전물질의 특성 DNA는 정보를 저장하고 복제되어 세대 간 전달될 수 있는 유전분자이다. DNA는 세포 내 과정을 조절하고 형질을 결정하며 새로운 변종의 원천이 된다. 2. DNA 구조와 복제 DNA는 두 가닥이 서로 감겨있는 이중나선 구조이며, 4가지 염기(A, T, G, C)로 구성된다. DNA 복제는 반보존적으로 일어나, 부모 가닥이 딸 가닥의 생산을 위한 주형 역할을 한다. 3. 유전자와 단백질의 관계 DNA의 염기서열은 특정 유형의 단백질을 지정한다. 효소는 생화학적 촉매 역할을 하며, 효소 결함은 유전병을 초...2025.05.10
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