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일반생물학실험 <단백질 검출> 예비레포트2025.01.271. 단백질 단백질은 아미노산의 펩타이드 결합으로 생긴 종합체로, 세포 내외부의 다양한 기능을 수행합니다. 단백질의 구조는 1차, 2차, 3차, 4차 구조로 이루어져 있으며, 이러한 구조에 따라 단백질의 기능이 결정됩니다. 단백질은 세포 내외부의 지지, 운동 조절, 신호 전달, 물질 수송 등의 역할을 합니다. 2. 아미노산 아미노산은 단백질의 기본 구성단위로, 카복실기와 아미노기를 포함한 분자입니다. 총 20종류의 서로 다른 아미노산이 존재하며, 이들이 펩타이드 결합을 통해 연결되어 단백질을 형성합니다. 3. 펩타이드 결합 펩타이드...2025.01.27
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단백질의 분석(질량, 서열, ELISA) 요약정리2025.04.301. 단백질 질량 측정 단백질의 질량을 측정하기 위해서는 단백질을 기체 상태의 이온으로 바꾼 후 전기장 하에서 질량 대 전하비(m/z)를 구하는 방식을 사용한다. MALDI와 ESI 기법을 통해 단백질을 이온화할 수 있으며, 이후 TOF 분석기를 이용하여 질량을 측정할 수 있다. 2. 항체를 이용한 단백질 검출 및 정량 항체는 특정 단백질에 결합하여 면역 반응을 일으키므로, 이를 이용하여 단백질을 검출하고 정량할 수 있다. ELISA 기법은 항체와 연결된 효소를 이용하여 단백질의 존재 유무와 양을 측정할 수 있다. Western b...2025.04.30
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단백질 풀림 예비실험2025.05.091. 단백질 구조 단백질은 20종류의 아미노산이 결합하여 이루어진 고분자 화합물입니다. 단백질은 1차 구조, 2차 구조, 3차 구조, 4차 구조로 이루어져 있으며, 이러한 구조를 유지하기 위해서는 다양한 분자 내 힘과 상호작용이 필요합니다. 단백질의 구조가 변화하면 단백질의 기능도 변화하게 됩니다. 2. 단백질 풀림 단백질은 특정 구조를 유지할 때만 기능을 수행할 수 있습니다. 하지만 온도 상승, pH 변화, 극성/비극성 물질의 첨가 등 다양한 요인에 의해 단백질의 구조가 풀리게 됩니다. 단백질 풀림 여부는 닌히드린 반응, 뷰렛 반...2025.05.09
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Lewin's Essential GENES 분자생물학 4판 정리노트 03. 분단된 유전자2025.05.101. Exon과 Intron Exon은 단백질 암호화 부위(coding region)이며, Intron은 noncoding region으로 RNA splicing 과정에서 제거됩니다. Exon의 순서는 DNA와 RNA 모두 동일합니다. 2. 분단된 유전자의 구조 분단된 유전자는 Exon과 Intron으로 구성되어 있습니다. Intron은 mRNA와 hybridization되지 않고 loop가 형성됩니다. 단백질 서열의 변화에 직접적으로 영향을 미치는 돌연변이는 Exon에서 일어납니다. 3. Exon과 Intron의 진화 Exon 서...2025.05.10
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SDS-PAGE를 통한 단백질 분리 실험2025.01.031. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 기법으로, 단백질을 SDS로 변성시켜 모든 단백질이 유사한 전하/분자량 비를 가지도록 만든 후 전기영동을 통해 분리한다. 이 실험에서는 SDS-PAGE의 원리와 사용되는 시약들의 특성을 이해하고, 실제로 단백질 분리 실험을 진행하여 결과를 분석하였다. 2. 단백질 변성 SDS는 단백질의 3차원 구조를 풀어 선형 구조로 만들어 주며, 단백질에 음전하를 부여한다. 이를 통해 단백질의 고유 전하와 상관없이 분자량에 따라 분리할 수 있게 된다. 실험에서는 단백질 시료를...2025.01.03
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생화학 5단원 단백질의 정제 요약정리2025.04.301. 단백질 정제의 중요성 세포 내에서 일어나는 많은 활동들은 단백질에 의해 수행된다. 따라서 단백질이 생체 내에서 어떤 기능을 하는지 아는 것은 생명활동을 이해하는데 매우 중요하다. 단백질의 아미노산 서열은 단백질의 3차 구조를 결정하고, 이 구조가 상호작용하여 4차 구조를 만든다. 즉 폴리펩타이드의 서열이 전체 구조를 결정하고, 단백질의 고유한 구조는 단백질의 기능을 결정한다. 따라서 이들 간의 관계는 매우 중요하다. 단백질의 구조를 알고, 서열을 구하고 그 기능을 알기 위해서는 반드시 순수한 단백질이 필요하다. 따라서 단백질의...2025.04.30
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레닌저 생화학 정리노트 Ch03. 아미노산 펩타이드 단백질2025.05.101. 아미노산 아미노산은 아미노기와 카복실기를 포함하고 있으며 두 작용기는 a-carbon에 의하여 연결됩니다. a-carbon은 4개의 치환기(substitunents)를 가지기 때문에 사면체(tetrahedral)이며 손대칭 중심(chiral center)입니다. 아미노산은 R기의 특성에 따라 5가지 기본 그룹으로 나뉘어질 수 있습니다: 비극성 지방족, 방향족, 극성 비전하, 양전하, 음전하. 아미노산은 최소 2개의 이온화 가능한 양성자를 가지고 각각의 pKa 값을 가지며, 화학적 환경이 pKa에 영향을 줍니다. 아미노산은 낮은...2025.05.10
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대장균에서 재조합 단백질 생산 및 정제2025.01.131. 재조합 단백질 생산 대장균 BL21(DE3) 균주는 재조합 단백질 고발현에 널리 사용되며, lac 프로모터와 T7 프로모터를 이용하여 IPTG 유도 하에 단백질을 발현할 수 있다. 본 실험에서는 pET28a 벡터를 사용하여 His-tag 융합 단백질을 생산하고, Ni-NTA 친화성 크로마토그래피와 FPLC를 통해 단백질을 정제하는 방법을 익혔다. 2. 단백질 분석 SDS-PAGE를 통해 단백질 크기별 분리와 정제 과정을 확인하였고, Bradford assay로 단백질 농도를 정량하였다. 또한 DES와 OASS 효소 활성 측정을...2025.01.13
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Peptide 질량분석2025.01.231. 펩타이드 질량분석 단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이며, 펩타이드는 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것이다. MALDI-TOF 질량분석법은 분석 물질에 자외선을 흡수하는 matrix를 넣고 레이저로 기화시켜 기체상 이온을 만들어 질량/전하수 값을 측정하는 방법이다. 실험에서는 단백질을 트립신으로 가수분해한 펩타이드 용액을 CHCA matrix와 혼합하여 MALDI-TOF 질량분석을 수행하였고, 얻어진 펩타이드 질량지문으로부터 주어진 단백질을 동정하였다. 2. MALDI-TOF 질...2025.01.23
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생물학실험1_효소 반응2025.05.011. 물질대사 물질대사는 생물의 세포에서 생명을 유지하기 위해 일어나는 화학 반응으로, 효소에 의해 촉매된다. 이화작용은 복잡한 물질을 단순한 물질로 분해하는 과정이며, 동화작용은 단순한 물질로부터 복잡한 물질을 합성하는 과정이다. 2. 효소 효소는 생체 내의 화학반응을 매개하는 단백질 촉매이다. 효소는 특정 반응물과 결합하여 활성화에너지를 낮춰 반응을 촉진한다. 효소의 활성은 온도, pH, 보조인자 등의 요인에 의해 영향을 받는다. 3. 단백질 구조 단백질은 1차, 2차, 3차, 4차 구조로 이루어져 있다. 단백질의 구조가 변성되...2025.05.01
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