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유전자 클러스터와 반복배열2025.05.101. 유전자 클러스터 유사하거나 동일한 유전자가 이웃하여 배열되어 있는 것을 의미합니다. rRNA 유전자가 대표적인 예로, 45S 전구체 rRNA 유전자가 여러 개 존재하는 유전자 클러스터를 이룹니다. 이러한 유전자 클러스터는 unequal crossing over에 의해 유전자 수가 변화될 수 있으며, 이는 질병 발생의 원인이 될 수 있습니다. 2. 반복배열 매우 짧은 염기서열이 커다란 클러스터 안에 여러 번 반복되는 것을 의미합니다. 이러한 반복배열은 satellite DNA라고 불리며, 주로 heterochromatin 영역에...2025.05.10
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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레닌저 생화학 정리노트 Ch04. 단백질의 3차원 구조2025.05.101. 단백질의 3차원 구조 단백질의 3차원 구조는 주로 약한 상호작용에 의해 안정화되며, 4단계로 구성됩니다. 1단계는 아미노산이 공유적으로 연결되는 것이고, 2단계는 3차원 배열인 a 나선과 b 시트 형태입니다. 3단계는 단백질 사슬과 보결분자단을 포함한 모든 원자의 3차원 배열이며, 4단계는 subunits의 배열입니다. 단백질의 3차원 구조는 specific biological function을 결정하며, 이를 native fold라고 합니다. 단백질에서 다수의 호의적인 상호작용, 즉 소수성 효과, 수소 결합, London d...2025.05.10
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[A+ 리포트] Ligation & Transformation (분자생물학실험)2025.04.251. Ligation 실험에서는 Vector와 PCR 산물을 Ligation하는 과정을 수행하였습니다. Ligation 시 주의사항으로는 T4 Ligase를 ice에 보관하며 가장 마지막에 첨가하고, 강한 충격을 피하는 것 등이 있습니다. 2. Transformation Transformation 과정에서는 Competent cell(E.coli)에 Ligation 산물을 처리하고 Heat-shock을 주었습니다. Competent cell은 온도에 매우 민감하므로 실험 중 ice 상태를 유지하는 것이 중요합니다. 실험 결과 일부 ...2025.04.25
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DNA 구조 및 추출2025.01.191. DNA 구조 DNA는 데옥시리보뉴클레오타이드라고 하는 단량체가 사슬의 형태로 연결된 중합체이며, 2개의 폴리뉴클레오타이드 가닥으로 이루어진 이중나선 구조의 고분자 화합물이다. DNA를 구성하는 각각의 뉴클레오타이드는 아데닌(A), 사이토신(C), 타이민(T), 구아닌(G) 중에서 하나의 질소 함유 염기를 가진다. 이 질소 함유 염기는 피리미딘과 퓨린의 2종류로 나뉘며, 각 염기에는 작용기가 부착되어 있어 단 한 가지 종류의 짝과 수소결합을 형성할 수 있다. 2. DNA 추출 DNA 추출 과정에서 buffer1의 EDTA는 세포...2025.01.19
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DNA 추출2025.04.281. DNA 구조 DNA는 Deoxyribonucleic Acid의 약자로 nucleotide의 중합체인 두개의 긴 가닥이 서로 꼬여 이중나선 구조를 이루고 있는 고분자 화합물이다. DNA의 구조를 살펴보면 한 분자당 polynucleotide 사슬 2개로 구성되어 있으며, 각 가닥은 네가지 종류의 nucleotide로 구성되어 있고, 이 두 가닥은 nucleotide의 염기부위 간 수소결합을 통해 결합한다. 2. DNA 추출 과정 바나나를 소금, 물과 함께 믹서기로 갈아서 걸러주어 세포벽을 파괴하고 DNA가 중성을 띠게 만들어주어...2025.04.28
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11주차_sequencing BL21 transformation2025.05.141. Sanger sequencing Sanger sequencing은 Frederick Sanger에 의해 1977년 개발된 방법으로, 500bp 이하의 DNA 서열을 결정할 때 99.99%의 매우 높은 정확도를 보인다. 이 방법은 DNA polymerase에 의한 DNA 중합 과정 중 template DNA 서열과 상보적인 염기가 결합된다는 성질을 이용하기 때문에 chain termination method 또는 dideoxynucleotide termination method라고 부르기도 한다. Sanger sequencing...2025.05.14
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아주대학교 생물학실험1 (A+보고서) DNA추출2025.01.101. 원핵세포와 진핵세포의 차이 원핵세포는 DNA가 코일 모양으로 감겨 핵과 핵양체를 이루고 있으며 핵막이 없어 DNA가 세포질로 노출되어 있다. 또한 리보솜의 크기도 진핵세포에 비해 작다. 이러한 이유로 사람 몸에 박테리아가 침입하면 항생제를 먹더라도 우리 몸에 있는 여러 유용 세포들의 단백질 합성에 영향을 주지 못한다. 원핵세포는 편모가 있어 이동이 가능하다는 점에서 진핵세포와 다르지만, 두 세포 모두 원형질 막으로 둘러싸여 있으며 DNA형태의 염색체를 갖는다는 공통점이 있다. 2. 플라스미드 DNA 박테리아 같은 원핵생물들은 ...2025.01.10
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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Hartl 유전학 정리노트 04. 유전자 연관과 유전자 지도 작성2025.05.101. 유전자 연관 유전자 연관은 동일한 염색체에 있는 유전자들이 함께 유전되는 현상을 말한다. 연관된 대립유전자들은 감수분열 시 서로 같이 있으며, 재조합 빈도를 통해 유전자 간의 거리를 측정할 수 있다. 재조합 빈도가 낮을수록 유전자 간 거리가 가깝다. 유전자 지도 작성에는 다형성 DNA 서열이 사용되며, 이를 통해 유전병 유발 유전자를 찾을 수 있다. 2. 유전자 지도 작성 유전자 지도 작성에는 재조합 빈도, 삼점교배, 다형성 DNA 서열 등이 활용된다. 재조합 빈도를 통해 유전자 간 거리를 측정할 수 있으며, 삼점교배를 통해 ...2025.05.10
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