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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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NCBI의 유전자 서열 분석 및 단백질 삼차원 구조 모델링2025.01.231. NCBI 데이터베이스 NCBI에서 제공하는 다양한 데이터베이스(Genome, BioProject, BioSystems 등)에 대해 설명하고, 이를 통해 유전자 정보와 서열을 분석할 수 있음을 설명하였다. 2. 유전자 돌연변이 유전자 돌연변이의 개념과 종류(염기 치환, 결실, 삽입, 중복, 역위, 반복 확장 등)에 대해 설명하였다. 3. SOD1 유전자 SOD1 유전자의 기능, 발현, 관련 질병 등에 대해 자세히 설명하였다. 4. 서열 정렬 BLAST와 MSA 기법을 사용하여 SOD1 단백질 서열을 다른 생물종과 비교 분석하고,...2025.01.23
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Gene Expression Analysis and Gene Set Enrichment Analysis2025.01.181. 전사체 데이터 유전 요인의 중요성이 부각됨에 따라 의료 분야에서는 사람들의 유전적 성향을 파악하여 질병을 예측, 예방하고, 개인의 유전정보를 기반으로 한 맞춤 의료 서비스에 관한 관심이 높아지고 있다. 맞춤 의료 서비스를 제공하기 위해서는 사람의 유전정보를 분석해야 하는데, 이 경우 전사체 (transcriptome: 세포나 조직에서 한순간 발현되는 전체 RNA의 모음을 의미한다. 이 RNA들을 이용하여 조직에 따라 발현되는 유전자들의 정보를 얻을 수 있다) 분석을 이용할 수 있다. 전사체 분석을 통해 정상 세포와 비정상 세포...2025.01.18
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생물학실험1_생물 정보학2025.05.011. 생물정보학 생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문입니다. 생물정보학은 유전체 서열에서 유전자를 찾아내고 데이터베이스 자료와 비교하여 유사성 정도를 확인하며 유전자 산물의 구조와 기능을 예측하고 진화적인 관계를 유추하는 등 많은 일에 사용됩니다. BLAST와 같은 생물정보학 프로그램은 다양한 단백질들의 아미노산 서열이나 DNA 염기서열을 비교하는 알고리즘입니다. 이를 통해 새로운 유전자를 발견하고 유사한 유전자를 찾을 수 있습니다. 2. BLAST BLAST는 뉴클레오타이드 서열이나 아미노산 ...2025.05.01
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레닌저 생화학 요약, 정리 (8장 뉴클레오타이드와 핵산)2025.05.071. 뉴클레오타이드와 핵산 이 장에서는 뉴클레오타이드와 핵산에 대해 설명합니다. 뉴클레오타이드는 DNA와 RNA의 기본 단위이며, 세포에서 화학 에너지를 운반하는 역할을 합니다. DNA는 이중나선 구조를 가지며 완벽하게 복제되는 특성이 있습니다. RNA는 가닥을 형성하지 않고 불안정한 특성이 있어 유전자로서의 역할을 하지 못합니다. DNA와 RNA는 유전 정보를 전달하는 과정인 복제, 전사, 번역에 관여합니다. 2. DNA 복제와 변이 DNA는 완벽하게 복제되지만 간혹 돌연변이가 발생할 수 있습니다. 이러한 돌연변이의 원인에는 탈아...2025.05.07
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분자생물학 실험 (A+)Agarose gel eelectrophoresis 결과보고서2025.01.041. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis는 DNA 분자를 분리하고 분석하는 기술입니다. 이 실험에서는 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 전기장을 가해 DNA 조각들을 크기에 따라 분리합니다. 이를 통해 DNA 조각의 크기와 양을 확인할 수 있습니다. 이 기술은 유전자 클로닝, DNA 서열 분석, 유전자 발현 분석 등 다양한 분자생물학 실험에 사용됩니다. 2. DNA 분리 및 분석 이 실험에서는 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 전기장을 가해 DNA 조각들을 크기...2025.01.04
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생물정보학 보고서2025.05.111. 생물정보학 이번 실험은 생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구하고, 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해보는 시간을 가졌다. BLAST 검색 결과에서 E-Value가 0에 가까울수록 쿼리 서열이 우연히 조합되어 만들어졌을 가능성이 매우 작다는 것을 의미하며, 이는 해당 서열이 중요한 상보성을 가지고 있다는 것을 나타낸다. 이번 실험을 통해 생물정보학 도구를 활용하여 미지의 유전자와 단백질 서열을 분석하고 비교할 수 있었다. 1. 생물정보학 생물정보학은 ...2025.05.11
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유전자 서열결정법(시퀀싱)의 원리, 현재와 차세대 기술, 서열결정법이 식물에 적용된 사례 리포트2025.01.181. 유전자 서열결정법의 역사와 발전 작물분자육종학 분야에서 가장 유용한 기법 중 하나인 시퀀싱 기술의 발전 과정을 소개하였습니다. 초기의 DNA library 기반 방식에서 생어 시퀀싱, 차세대 시퀀싱 기술, 나노포어 기술 등으로 발전해왔으며, 비용과 시간이 크게 감소하고 정확도가 향상되었습니다. 2. 나팔나리 품종 교잡 연구 나팔나리 4개 품종의 교잡을 통해 잡종강세를 연구한 사례를 소개하였습니다. 유전자 발현 분석을 통해 초장, 잎과 꽃의 숫자, 엽면적 등의 형질에 영향을 주는 후보 유전자를 찾아내었으며, 이를 활용하여 원예 ...2025.01.18
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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[생물학실험1] 생물정보학2025.01.191. 생물정보학 생물정보학은 생물학과 컴퓨터를 이용한 정보학이 통합되어 발전된 학문으로, 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문이다. 생물정보학으로 인해 유전 정보 등을 체계적으로 정리하고 발전시킬 수 있었으며, 컴퓨터를 이용한 실험 모델의 생산 등이 가능해졌다. 2. NCBI NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 미국 국립생물공학정보센터로, 생물 의학 및 게놈 정보에 대한 액세스를 제공함으로써 과학과 건강을 발전시키는 정보센터이다. 게놈 분석, 서...2025.01.19
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