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프로테오믹스 기법을 이용한 파골세포 활성 단백질 탐색2025.01.121. 파골세포의 활성 조절 파골세포는 뼈를 분해하는 역할을 하며, 이들의 활성은 호르몬 변화나 염증에 의해 촉진됩니다. 연구 결과, 파골세포 내의 CK-B 단백질이 이 세포의 활성을 조절하며, CK-B 단백질을 억제하면 뼈의 파괴를 막을 수 있다는 사실이 밝혀졌습니다. 2. 프로테오믹스 기법 프로테오믹스는 수백, 수천 개의 단백질을 한꺼번에 분석할 수 있는 방법입니다. 이를 위해 단백질 분리 정제 기법, 단백질 성상 분석 방법, 생물정보학을 이용한 정보 통합 등의 기술이 사용됩니다. 이를 통해 복잡한 생명 현상을 단백질 수준에서 이...2025.01.12
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인천대학교 나노바이오실험(1) Bioinformation2025.01.141. Bioinformatics 바이오인포매틱스(bioinformatics)는 생물학적인 문제를 응용수학, 정보과학, 통계학, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학, 생화학 등을 이용하여 주로 분자 수준에서 다루는 학문이다. 주 연구 분야는 서열 정렬, 유전자 검색, 유전자 조합, 단백질 구조 정렬, 단백질 구조 예측, 유전자 발현의 예측, 단백질 간 상호작용, 진화모델 등 다양하다. 2. NCBI NCBI는 미국의 대표적 국가 생정보학 기관으로, NCBI의 Gene에서 target 유전자를 검색하고 FASTA를 클릭하면 sequence ...2025.01.14
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Bioinformation: Analyzing Gene Sequences Using NCBI and BioEdit2025.01.061. 코돈(Codon) 코돈은 DNA에서 전사된 mRNA의 3염기 조합을 의미합니다. mRNA의 유전암호의 단위로, 이것에 의해 세포 내에서 합성되는 아미노산의 종류가 결정됩니다. 개시코돈(AUG)은 단백질 번역을 시작하는 첫 번째 코돈이며, 종결코돈(UAA, UAG, UGA)은 단백질 합성 과정이 끝났음을 알리는 신호로 작동합니다. 2. NCBI 데이터베이스 활용 NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 웹 기반 생물학 데이터베이스로, 유전자 및 단백질 정보를 얻을 수 있습니다...2025.01.06
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NCBI의 유전자 서열 분석 및 단백질 삼차원 구조 모델링2025.01.231. NCBI 데이터베이스 NCBI에서 제공하는 다양한 데이터베이스(Genome, BioProject, BioSystems 등)에 대해 설명하고, 이를 통해 유전자 정보와 서열을 분석할 수 있음을 설명하였다. 2. 유전자 돌연변이 유전자 돌연변이의 개념과 종류(염기 치환, 결실, 삽입, 중복, 역위, 반복 확장 등)에 대해 설명하였다. 3. SOD1 유전자 SOD1 유전자의 기능, 발현, 관련 질병 등에 대해 자세히 설명하였다. 4. 서열 정렬 BLAST와 MSA 기법을 사용하여 SOD1 단백질 서열을 다른 생물종과 비교 분석하고,...2025.01.23
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[생물학실험1] 생물정보학2025.01.191. 생물정보학 생물정보학은 생물학과 컴퓨터를 이용한 정보학이 통합되어 발전된 학문으로, 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문이다. 생물정보학으로 인해 유전 정보 등을 체계적으로 정리하고 발전시킬 수 있었으며, 컴퓨터를 이용한 실험 모델의 생산 등이 가능해졌다. 2. NCBI NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 미국 국립생물공학정보센터로, 생물 의학 및 게놈 정보에 대한 액세스를 제공함으로써 과학과 건강을 발전시키는 정보센터이다. 게놈 분석, 서...2025.01.19
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[만점 레포트] 연세대학교 생화학실험(1) 7주차 Peptide Mass Finger-Printing2025.05.041. MALDI-TOF 질량분석법 MALDI-TOF 질량분석법은 고분자 물질에 대해 시료의 분해 없이 기화/이온화가 가능한 방법으로, 일반적으로 질량이 크고 열에 불안정한 생체 고분자나 합성 고분자에 이상적으로 적용할 수 있다. 이 실험에서는 MALDI 이온화 장치와 TOF 질량 분석기를 이용하여 단백질을 동정하는 방법을 공부한다. 2. 단백질 동정 MALDI-TOF 질량분석법을 이용하여 단백질을 동정하는 과정을 설명한다. 시료를 MALDI 장치에 주입하고 질량 분석기로 분석한 후, 결과 스펙트럼을 데이터 검색 엔진에 입력하여 단백...2025.05.04
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변환 분석(Transform Analysis)에 대한 설명2025.01.181. 변환 분석 변환 분석은 논리 개념 데이터 흐름을 물리 개념 설계 구조도로 변환하는 기술입니다. 변환 분석을 통해 설계 구조도를 작성하는 과정은 데이터 흐름 작성, 중앙 변환 영역 추출, 구조도 초안 작성(1차 구조도 지침), 구조도 개선(완전 구조도) 등 4단계로 구성됩니다. 중심변환영역 추출처리에는 논리데이터 흐름에 따른 방법이 2가지가 있으며, 데이터 흐름차트에 신뢰성 있는 중앙처리가 있는 경우에 이용하는 방법과 데이터 흐름차트를 입력영역, 변환영역, 출력영역의 3가지로 분할하는 방법이 있습니다. 2. 폭포수 모델 폭포수 ...2025.01.18
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서울대학교, 화학실험, 만점, A+, 펩타이드 질량분석 결과보고서2025.01.291. MALDI-TOF 펩타이드 질량분석 본 실험에서는 trypsin으로 가수분해한 단백질 샘플을 MALDI-TOF MS로 분석하여, 미지의 샘플이 lysozyme, BSA, ovalbumin 중 어떤 단백질에 해당하는지 알아내고자 하였다. 실험 결과, 미지의 단백질은 BSA로 확인되었으며, MALDI-TOF MS 데이터 분석 시 peptide coverage, miscleavage, 신호 대비 잡음 비율(S/N) 등을 고려하여 정확도를 높이는 것이 중요함을 알 수 있었다. 2. 펩타이드 질량지문(PMF) 단백질을 trypsin으로...2025.01.29
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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