
물리화학실험 Gaussian tutorial
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물리화학실험 Gaussian tutorial
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2024.11.03
문서 내 토픽
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1. Gaussian 프로그램 사용Gaussian 프로그램을 사용하여 다양한 분자의 구조와 물성을 계산하고 분석하였다. OPT, FREQ, SCAN 등의 방법을 통해 분자의 결합길이, 진동수, 해리에너지 등을 구하였고, 이를 바탕으로 분자의 특성을 이해할 수 있었다.
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2. NH3 분자의 구조 분석NH3 분자의 inversion 실험 결과를 Avogadro 프로그램을 통해 확인하였고, 다양한 basis set을 사용하여 계산한 결과와 실험값을 비교하였다. 이를 통해 basis set이 커질수록 실험값과 더 가까운 결과를 얻을 수 있음을 확인하였다.
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3. Ethane 분자의 회전 장벽 분석Ethane 분자의 staggered 구조와 eclipsed 구조를 계산하고, 이를 바탕으로 회전 장벽을 구하였다. 다양한 basis set을 사용하여 계산한 결과와 실험값을 비교하였으며, STO-3G basis set이 실험값과 가장 유사한 결과를 보였다.
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4. H2O2 분자의 회전 장벽 분석H2O2 분자의 Cis 구조와 Trans 구조를 계산하고, 이를 바탕으로 회전 장벽을 구하였다. 다양한 basis set을 사용하여 계산한 결과와 실험값을 비교하였으며, basis set이 커질수록 실험값과 더 가까운 결과를 얻을 수 있음을 확인하였다.
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5. Markovnikov's rule 실험Avogadro 프로그램을 사용하여 Tert-butyl cation, Tert-butyl chloride, Isobutyl cation, Isobutyl chloride 등의 구조를 모델링하고, Gaussian 프로그램을 통해 최적화하였다. 이를 통해 Isobutyl cation의 구조가 잘 최적화되지 않는 것을 확인하였고, 이를 바탕으로 Markovnikov's rule을 도출할 수 있었다.
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1. Gaussian 프로그램 사용Gaussian 프로그램은 양자화학 계산을 수행하는 강력한 도구입니다. 이 프로그램을 사용하면 분자의 구조, 에너지, 진동 주파수 등 다양한 물리화학적 특성을 계산할 수 있습니다. 특히 실험적으로 관찰하기 어려운 중간체나 전이상태와 같은 반응 중간체의 특성을 예측하는 데 유용합니다. 또한 분자 궤도함수, 전하 분포, 반응 메커니즘 등을 분석할 수 있어 화학 연구에 필수적인 도구라고 할 수 있습니다. 다만 계산 시간이 오래 걸리고 계산 결과의 정확성이 계산 방법과 기저함수 선택에 따라 달라지므로 이를 고려하여 적절한 계산 조건을 선택해야 합니다.
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2. NH3 분자의 구조 분석NH3 분자는 질소 원자에 3개의 수소 원자가 결합한 구조를 가지고 있습니다. 질소 원자의 전자쌍 수가 4개이므로 정사면체 구조를 취하게 되며, 이에 따라 H-N-H 결합각이 약 107도로 나타납니다. 이러한 구조는 질소 원자의 sp3 혼성화에 의해 설명될 수 있습니다. 또한 질소 원자의 lone pair 전자가 수소 원자들을 밀어내어 결합각이 109.5도의 정사면체 구조보다 작게 나타나는 것으로 이해할 수 있습니다. 이러한 NH3 분자의 구조적 특성은 분자의 물리화학적 성질, 반응성 등을 이해하는 데 중요한 기초가 됩니다.
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3. Ethane 분자의 회전 장벽 분석Ethane 분자(CH3-CH3)는 두 개의 메틸기(CH3)가 단일 결합으로 연결된 구조를 가지고 있습니다. 이 분자는 C-C 단일 결합 주위에서 자유롭게 회전할 수 있습니다. 그러나 이 회전에는 일정한 에너지 장벽이 존재하는데, 이를 회전 장벽이라고 합니다. 이 장벽은 약 3 kcal/mol 정도로 알려져 있습니다. 이 에너지는 메틸기 사이의 반발력과 van der Waals 인력이 균형을 이루는 지점에 해당합니다. 회전 장벽의 크기는 분자의 구조와 결합 특성을 이해하는 데 중요한 정보를 제공합니다. 또한 이 값은 분자의 열역학적 성질과 반응성 등을 예측하는 데 활용될 수 있습니다.
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4. H2O2 분자의 회전 장벽 분석H2O2 분자(과산화수소)는 두 개의 수소 원자와 두 개의 산소 원자로 구성된 분자입니다. 이 분자는 O-O 단일 결합 주위에서 자유롭게 회전할 수 있습니다. 그러나 이 회전에는 일정한 에너지 장벽이 존재하는데, 이를 회전 장벽이라고 합니다. H2O2 분자의 회전 장벽은 약 3-4 kcal/mol 정도로 알려져 있습니다. 이 에너지는 두 개의 OH기 사이의 반발력과 수소 결합 등이 균형을 이루는 지점에 해당합니다. 회전 장벽의 크기는 분자의 구조와 결합 특성을 이해하는 데 중요한 정보를 제공합니다. 또한 이 값은 분자의 열역학적 성질과 반응성 등을 예측하는 데 활용될 수 있습니다.
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5. Markovnikov's rule 실험Markovnikov's rule은 알켄과 수소 할로겐화물의 첨가 반응에서 관찰되는 반응 방향성을 설명하는 경험적 규칙입니다. 이 규칙에 따르면 수소 할로겐화물이 알켄에 첨가될 때 수소 원자는 상대적으로 안정한 카보늄 이온이 형성되는 쪽으로 첨가됩니다. 이를 실험적으로 검증하기 위해서는 다음과 같은 실험을 수행할 수 있습니다. 1) 프로펜과 HBr의 첨가 반응을 수행하여 2-브로모프로판이 생성되는 것을 확인 2) 2-부텐과 HBr의 첨가 반응을 수행하여 2-브로모부탄이 생성되는 것을 확인 3) 이소부틸렌과 HBr의 첨가 반응을 수행하여 2-브로모이소부탄이 생성되는 것을 확인 이러한 실험 결과는 Markovnikov's rule을 뒷받침하며, 카보늄 이온 중간체의 안정성이 반응 방향성을 결정하는 주요 요인임을 보여줍니다.