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1. 단백질 발현 분석
1.1. 실험 개요
실험 개요는 단백질 발현 분석을 위한 전반적인 실험 과정을 설명한다. 이 실험은 대장균(E. coli)에서 특정 유전자를 발현시켜 단백질을 생산하고, SDS-PAGE를 통해 발현된 단백질을 확인하는 것이 주요 목적이다.
우선, 대장균 세포에 목적 유전자가 도입된 발현 벡터를 형질전환하여 균주를 만든다. 이 균주를 배양하면서 IPTG를 처리하여 Lac operon 시스템을 활성화시켜 단백질 발현을 유도한다. 발현된 단백질은 세포 용해 과정을 거쳐 추출하고, SDS-PAGE를 통해 단백질의 크기와 발현 정도를 확인한다. 이러한 일련의 과정을 통해 대장균에서 특정 단백질의 발현과 분리를 달성할 수 있다.
이 실험은 재조합 단백질 생산을 위한 기본적인 기술들을 다루고 있으며, 향후 단백질의 기능 분석이나 정제, 응용 연구 등 다양한 분야에 활용될 수 있다. 전반적인 실험 내용과 원리를 이해하고 최적의 실험 조건을 확립하는 것이 중요할 것으로 보인다.
1.2. SDS-PAGE를 통한 단백질 분석
1.2.1. SDS-PAGE 원리
SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis)는 단백질의 구조를 선형으로 만든 뒤 Acrylamide gel을 이용하여 전기영동하는 방법이다.""
SDS는 음이온 계면활성제로, SDS에 의해 단백질이 1차 구조로 펼쳐지고 음성으로 코팅된다.""그 결과 단백질은 자신이 본래 가지고 있던 전하와 관계없이 (-)전하를 띠게 된다.""이렇게 선형이 된 단백질은 질량에 따라 크기에 비례하여 전기영동으로 분리된다.""따라서 SDS-PAGE를 통해 단백질의 분자량을 확인할 수 있다.""
1.2.2. 실험 재료 및 방법
실험 재료 및 방법은 다음과 같다.
전기영동 장비들을 조립한다. 먼저 stacking gel을 pH 6.8에서 1시간 동안 굳힌다. 이를 위해 30% acrylamide와 10.8% bisacrylamide 용액 0.65ml, 4× Tris-HCl pH 6.8 buffer/SDS 용액 1.25ml, 증류수 3.05ml, 10% ammonium persulfate 용액 25μl, TEMED 5μl를 혼합한다. TEMED와 amm...