이동 더 이상 일어나지 않고 끝남⦁Local Sequence Alignment;: 지엽적 focus → ★Smith-watermanAlignment (연속적인 gap ... ⇒Local alignmentalgorithms which seek only relatively conserved pieces of sequenceex) Si,j=MAXIMUM[Si ... aligning part of sequences-Often beats global alignment score⇒Global alignmentalgorithms which optimize
에는 Probalign, Hirschberg's algorithm, Needlman-Wunsch algorithm(Global Alignment), 그리고 Smith-Watermanalgorithm ... 하고 sequence의 길이는 200~400bp를 사용한다.2.Dynamic programming를 기초로 한 sequence alignmentalgorithm ... Alignment 두 방법 모두 초기화, 점수계산, 정렬의 3단계로 이루어져 있다. 두 alignmentalgorithm의 가장 큰 차이점은 Global Alignment에서는 점수계산을 할
( Naeedleman-Wunch , Smith-waterman 휴리스틱프로그래밍 (heuristic programming algorithm) 시간과 노력을 줄여 효율성을 높이기 위한 알고리즘 ... 정렬 알고리즘 ( pairwise -sequence alignmentalgorithm) 정렬대성 2 개의 서열 상동성 분석 (BLAST, FASTA, BLAT) 다중서열정렬 ... 알고리즘 (multiple sequence alignmentalgorithm) 3 개 이상의 서열의 단백질 패밀리 , 유연관계 , 도메인 , 모티프 분석 (CLUSTALW, Pile