equence를 만들게 된다.3. SequenceAlignment (진화를 고려한 DNA sequence의 배열)- 종들마다 가지고 있는 seqeunce가 다르기에 다른 결과가 나온다. ... 된 Column에 대해서 더 높은 점수를 부여하여 가장 높은 점수를 가지는, True alignment라고 추측되거나 제일 비슷한 Optimalalignment를 찾는 것을 목표로 한다 ... .→ 따라서 Scoring Scheme을 어떻게 설정하는지에 따라 Optimalalignment가 달라질 수 있으며, True alignment의 특징을 기반으로 설정되어야 한다
2. Pairwise SequenceAlignmnet⦁Pairwise SequenceAlignment : compare two sequences → BLASTMultiple ... SequenceAlignment : compare more than two sequences → Clustal W⦁★★SequenceAlignment 하는 목적. Why?★★1 ... 이동 더 이상 일어나지 않고 끝남⦁Local SequenceAlignment;: 지엽적 focus → ★Smith-waterman Alignment (연속적인 gap
alignment 시켜 model을 만들었다. Sequence 전체를 이용해 global alignment 시킬 경우 template sequence에 gap이 너무 많이 생기기 때문 ... 을 통해 query sequence를 template sequence에 대해 sequencealignment를 수행하여 비슷한 구조를 가진 sequence 부분을 찾아내고, 이 ... 를 통해 query sequence의 대략적인 structure를 파악하고자 한다.Theoretical Background① SequenceAlignmentSequence