[미생물생태학]수인성 박테리아 및 바이러스 검출에 사용되는 분자생물학적 방법

소개

생명과학부 졸업논문으로 작성한 것입니다.
수인성 질병을 일으키는 박테리아와 바이러스의 검출방법은 크게 세포배양법과 분자생물학적 방법의 두 가지가 있습니다. 이 레포트는 위의 두 가지 방법에 대해 조사하여 정리한 것입니다. 특히 각 방법의 장단점을 위주로 작성했기 때문에 관련 주제로 공부하시는 분들께 도움이 될 것이라 생각합니다

목차

1. 서론

2. Bacteral detection method
2.1. 5S rRNA 분석방법
2.2. 16S rRNA 분석방법
2.2.1. RFLP pattern 분석
2.2.2. DNA-hybridization
2.2.3. DGGE & SSCP
2.3. 지방산 조성 분석
　
3. Virus detection method
3.1. virus concentration
3.2. cell culture assay
3.3. polymerase chain reaction
3.3.1. RT-PCR
3.3.2. nested-PCR
3.3.3. integrated cell culture-PCR
3.3.4. competitive PCR
3.3.5. real time PCR

4. 결론

본문내용

서론 입니다.

인간 사회의 발전과 인구의 급속한 증가는 수자원의 양과 질에 많은 압력을 가하고 있고, 전염성이 있고 물과 연관되어 있는 각종 질병들은 전 세계의 사람들의 생존에 영향을 미치고 있다. 비록 이러한 헤아릴 수 없는 질병들의 대부분이 cholera나 typhoid와 같은 고전적인 수인성 pathogen에 의해 야기되지만 새로이 인식되어진 pathogen들 또한 물과 공중보건 영역에 끊임없이 도전을 가하고 있다. 국제기구인 WHO에서 2003년에 발간한 보고서에 따르(그림1) 면 1972년부터 1999년 사이 기
간 동안35개의 새로운 질병체가 발견되었고 오랜 잠복기를 지내다가 다시 활성화된 질병체도 상당하였다. 또한 예전에는 보고된 적인 없는 지역에까지 질병체가 퍼져나가게 되었는데 물에 의해 전파되는 pathogen들이 이러한 범주에 속한다. 1970년까지 인간과 동물의 배설물 그리고 환경 자원으로부터 발견된 몇몇 미생물종이 pathogen으로 확인되었고 Crytosporidium,
Legionella, Eschrichia coli O157, rotavirus, hepatitis E virus, norovirus 등이 그 대표적인 예라고 볼 수 있다. 게다가 pathogen의 전파에 있어서 물의 중요성은 계속적으로 새로운 tool에 의해 평가되고 있다.
병원성 미생물을 분석하는데 있어서 배양을 통하지 않고 이해하기 위한 접근 방법 중의 하
나가 분자생물학적 방법을 이용하는 것이다. 과거에는 특정 미생물의 기능과 성장 특성 등 표현 형질에 기초를 둔 연구가 주로 행해졌으나 이는 연구 대상의 순수 분리와 배양이 성공적으로 이루어져야만 가능했던 방법이었다. 이러한 한계를 보완하기 위해 배양을 통하지 않고 군집의 미생물을 파악할 수 있는 분자생물학적 방법을 연구하기 위해 많은 노력이 시도되어 왔고 지금까지도 새로운 기법들이 연구 중에 있다. 다양한 유전자를 대상으로 분자생물학적 방법을 적용시킬 수 있지만 DNA보다는 안정적인 RNA를 대상으로 활발히 연구가 진행되고 있으며 RNA에 대한 상당한 양의 data가 웹상에 구축되어 있어 효과적인 분석을 돕고 있다. 이번 논문에서는 수인성 박테리아와 바이러스를 수계 생태계 내에서 검출할 수 있는 다양한 분자생물학적 분석 방법에 대해 살펴볼 것이고, 분자생물학적 방법의 유용한 점과 한계점에 대해 요약해 보도록 하겠다.

참고자료

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· 추여진. 1999. 지방산 조성을 통한 지하수 미생물생태계의 군집구조 분석. 이학석사학위논 문. 서울대학교