[식물생리학] 애기장대 (Arabidopsis thalian)

소개

애기장대
Introduction에서는 DNA 추출, genom DNA의 분리, DNA의 순도 및 정량, 전기영동, PCR, 유전자형, 표현형에 대해 설명하였다.
실험은 애기장대(Ler, Spl)를 5주 동안 키우면서 진행됐으며 이것에서 genomic DNA를 추출했으며 PCR, gDNA 전기영동을 하였다.
결과는 흡광도 결과와 헤테로, 호모, 야생형의 애기장대, genomic DNA 전기영동, PCR 전기영동 결과를 기재하였다.
이 실험들에 대한 고찰을 Discussion에 기술하였다.

목차

I. Introduction
II. Material
III. Method
IV. Result
V. Discussion

본문내용

I. Introduction
- 애기장대
애기장대(Arabidopsis thalian)는 유럽, 아시아, 아프리카 북서부에 자생하는 조그마한 속씨식물이다. 이 식물은 약 135개 염기쌍(Mbp)의 복잡한 다세포, 진핵생물인데 비해 상대적으로 작은 게놈을 지니고 있다. 한 동안은 속씨식물 가운데 가장 작은 게놈을 지니고 있었다고 간주되었으나, 현재 알려진 가장 작은 속씨식물의 게놈은 식충식물로 알려진 꿀풀목 게늘리세아속 Genlisea margaretae 식물에 속하며 그 게놈의 크기는 63.4 Mbp이다. 애기장대는 연속 게놈을 지닌 최초의 식물로, 꽃 발생, 굴광성을 포함한 수많은 식물적 특징에 대해 분자생물학을 이해할 때 잘 쓰이는 도구이다.

- DNA 추출
DNA를 추출하는 것은 핵에서 일어나며 대개의 경우 어떤 종류의 세포에서도 얻어지고, 혈액속의 백혈구, 모근세포, 구강상피세포 정자, 태아의 융모막등이 흔히 접하게 되는 것들이다. 세포는 핵산외에도 많은 종류의 물질로 되어 있는데 이들은 차후의 생화학적 실험에 장애가 되거나 최소한 불필요하기 때문에 가급적 제거하고 DNA만을 순수하게 회수한다. 추출된 DNA의 질은 저장조건, 열, 햇빛, 수분 및 미생물과 화학적 오염들에 의해 좌우된다. DNA를 추출하는 방법에는 유기추출, 무기추출 및 Chelating resin을 사용하는 방법 등이 있다. 유기추출 방법은 세포막을 SDS와 같은 세제로 녹이고 단백질 분해효소(Proteinase K)로 단백질을 분해시키고 DNA이외의 단백질이나 세포내 불순물을 유기용매로 추출한 후 DNA를 에탄올로 침전하는 방법이다.
이 방법은 Heme와 같은 PCR 반응을 저해하는 물질들을 제거하지 못하여 때로는 DNA를 추출하지 못하는 경우가 생긴다. 무기 추출 방법은 고농도의 염분으로 이물질들을 침전시켜 제거하고 유리가루나 실리카 젤 분산액 같은 것에 DNA를 흡착시켜 추출하는 것이다. Cheating resin을 사용하는 경우는 5% chelex-100분산액에 sample을 넣고 끓여주어 세포막을 파괴하고 DNA를 추출한다.

참고자료

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