연구자료12 (분변 바이러스)

목차

1. 서론
2. 장내 바이러스이 검출 및 정량화
3. 장내 바이러스의 미생물 근원추적
4. 장내 바이러스와 분변 연관 환경시료
5. 바이러스 지표종
6. 메타게놈 분석과 바이러스-MST
7. 바이러스 농축기술
8. 결론
9. 출처

본문내용

장내 바이러스는 MST(microbial source tracking)로서 큰 잠재성을 갖고 있다. 다양한 숙주의 환경 바이러스를 동일한 시료에서 시험해야 하는 경우의 수단으로 사용할 때에 그러하다. 또한 세균성 지표종에 대한 환경 바이러스의 지속성이 상대적으로 크게 되면, 오염원으로부터 멀리
떨어진 하류 지역에서의 분변 오염을 추적할 수 있는 환경 바이러스 분석의 이점이 크다. 바이러스는 일반적으로 숙주-특정적이지만, 표적 유전자의 선택은 검출분석법의 포괄성과 배타성을 결정하는데 중요한 것이다.

<중 략>

영역의 표적-시퀜싱이 포함된다. 또한 PCR의 시발체(primer)는 동시발생적인 시퀜싱 및 다중시료의 미분화를 가능하게 하는 바코드(barcode) 혹은 태그(tag)도 포함한다. 바코드와 태그는 시발체 영역 이전에 자리한 특정한 시퀜스 확인체이다. 염기서열분석(sequencing)에 이어, 당해
시퀜스(염기서열)는 그 바코드에 따라 분리된다.
PCR 증폭 단계로 인해, 유전자-표적 메타게노믹스는 당해 선택 표적에 특정적이게 작용한다.
여기서 주의할 일은 PCR 증폭이 당해 증폭 및 시발체 특이성으로 인해 편의성(bias)을 나타낼 수 있다는 것이다. 더욱이 유전자-표적 메타게노믹스 기술은 박테리아의 다양성을 이용하는 16S rRNA 유전자 파이로시퀜싱 기술과 크게 유사하다는 점이다.

<중 략>

장내 바이러스는 MST(microbial source tracking)로서 큰 잠재성을 갖고 있다. 다양한 숙주의 환경 바이러스를 동일한 시료에서 시험해야 하는 경우의 수단으로 사용할 때에 그러하다. 또한 세균성 지표종에 대한 환경 바이러스의 지속성이 상대적으로 크게 되면, 오염원으로부터 멀리
떨어진 하류 지역에서의 분변 오염을 추적할 수 있는 환경 바이러스 분석의 이점이 크다. 바이러스는 일반적으로 숙주-특정적이지만, 표적 유전자의 선택은 검출분석법의 포괄성과 배타성을 결정하는데 중요한 것이다.
인간-폴리오마바이러스는 인간의 분변 오염을 추적하는 데 좋은 수단이 되고 있고, 수질환경에 서 인간 오염원 및 비-인간 오염원을 구별하는 데도 좋은 수단이 되고 있다. 그러나 인간-아데노바이러스의 높은 출현율과 밀도 및 환경적 지속성은 여타 장내 바이러스에 비해 MST 용으
로 다양한 이점을 가져다준다.

참고자료

· Kelvin Wong, Theng-Theng Fong, Kyle Bibby, Marirosa Molina, “Application of enteric viruses for fecal pollution source tracking in environmental waters”, Environment International, Vol. 45, 2012, pp.151~164
· Jay F. Martin, Eric D. Roy, Stewart A. W. Diemont, Bruce G. Ferguson, “Traditional Ecological Knowledge (TEK) : Ideas, inspiration, and designs for ecological engineering”,Ecological Engineering, Vol. 36, 2010, pp.839~849
· Xuliang Zhuang, Zhen Han, Zhihui Bai, Guoqiang Zhuuang, Hojae Shim,Progress in decontamination by halophilic microorganisms in saline wastewater and soil, Environmental Pollution, Vol. 158, 2010, pp.1119~1126
· Adam M. Paruch, Trond Maehlum,Specific features of Escherichia coli that distinguish it from coliform and thermotolerant coliform bacteria and define it as the most accurate indicator of faecal contamination in the environment, Ecological Indicators, Vol. 23, 2012, pp.140~142
· Gretchen Vogel,Diseases in a Dish Take Off. SCIENCE, Vol. 330(NOVEMBER 26), 2010, pp.1172~1173
· http://www.upaper.net/efictions
· http://www.kosen21.org
· http://www.reseat.re.kr
· http://www.daum.net/enviromath