TG 유전자 다형성과 갑상선 질환과의 상관성 연구 (Association between TG Genetic Polymorphisms and Thyroid Diseases)

서지정보

· 발행기관 : 대한임상검사과학회
· 수록지 정보 : 대한임상검사과학회지 / 57권 / 1호 / 66 ~ 75페이지
· 저자명 : 김가은, Eun-Jung Kim

초록

갑상선 질환은 가장 흔한 내분비계 질환으로, 특히 여성에게서 더 높은 발병률을 보인다. 본 연구는 갑상선 질환과 관련된 TG 유전자의 유전적 다형성을 조사하기 위해 한국인유전체역학조사사업의 Health Examinees 데이터를 활용하여 TG 유전자 내 104개의 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP)에 대해 연관성 분석을 수행하였다. 분석 결과, 갑상선 질환과 관련된 28개의 유의미한 SNP가 확인되었으며, 그중 rs2248346 (odds ratio=1.46, P=5.30×10−3)이 가장 유의미한 SNP로 확인되었다. Haploview 기반의 연관불균형(linkage disequilibrium, LD) 분석을 통해 5개의 LD 블록을 확인하였으며, block 2와 3, block 4와 5 간의 강한 유전적 연관성이 관찰되었다. Locuszoom 분석을 통해 rs2248346은 TG 유전자의 3’ 말단에 위치하고, 재조합률이 낮은 영역에서 주변 SNP들과 높은 LD를 형성함을 확인하였다. RegulomeDB 분석에서는 6개의 SNP가 높은 기능적 점수로 평가되었으며, 이들 SNP는 전사 인자 결합 부위와 크로마틴 접근성에 큰 영향을 미치는 것으로 나타났다. 유전자 발현 양적 형질 좌위 분석에서는 r s2246611 (NES=−0.37, P=1.96×10−5)이 위식도 접합부 조직의 TG 발현 감소와 관련이 있는 것으로 확인되었다. 스플라이싱 양적 형질 좌위 분석에서는 갑상선 조직 내 RNA 스플라이싱에 영향을 미치는 11개의 SNP가 확인되었다. 이러한 결과는 한국인에게서TG 유전자의 다형성이 갑상선 질환의 병리학적 기전에 중요한 역할을 한다는 점을 입증하며, 정밀 진단 및 맞춤형 치료 전략을 위한 바이오 마커로써의 가능성을 제시하고 있다.

영어초록

Thyroid diseases are among the most prevalent endocrine diseases and are more common in females. A genetic association study of 104 single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the TG gene was conducted using data from the Korean Genome and Epidemiology Study (KoGES) to identify SNPs associated with thyroid diseases. The analysis identified 28 significant SNPs, with rs2248346 (odds ratio=1.46, P=5.30×10−3) as the most significant variant. Haploview-based linkage disequilibrium (LD) analysis revealed five LD blocks, with strong genetic associations observed between blocks 2 and 3 and blocks 4 and 5. Locuszoom analysis identified rs2248346 at the 3’ end of the TG gene, showing high LD (r2≥0.8) with neighboring SNPs in a low recombination rate region. RegulomeDB analysis identified six SNPs with high regulatory potential, influencing transcription factor binding sites and chromatin accessibility. Expression quantitative trait loci analysis showed that rs2246611 (normalized effect size=−0.37, P=1.96×10−5) was linked to reduced TG expression in esophagus-gastroesophageal junction tissue. Splicing quantitative trait loci analysis identified 11 SNPs affecting RNA splicing in thyroid tissue. These findings underscore the role of TG genetic polymorphisms in the etiology of thyroid diseases in Koreans, supporting their potential as biomarkers for precision diagnostics and targeted therapies.

참고자료

· 없음