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Western blot 실험 방법2025.05.101. Western blotting Western blotting (immunoblotting)은 샘플 내 특정 단백질의 존재 여부, 양, 크기를 측정하는 실험이다. 단백질이 소량이어도 검출 가능하고, 다양한 종류의 단백질이 혼합된 시료를 검사할 때도 항체의 기질 특이성 덕분에 원하는 단백질만 검출할 수 있다는 장점이 있다. 2. Western blot 실험 순서 Western blot 실험은 크게 5개의 순서로 이루어진다. 1) SDS-PAGE를 시행하여 단백질을 크기별로 분리, 2) 분리된 단백질을 membrane에 전이, 3)...2025.05.10
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BCA assay 정량2025.01.241. BCA assay BCA assay는 단백질 정량 방법 중 하나로, 구리 이온이 단백질과 반응하여 발색하는 원리를 이용합니다. A 용액과 B 용액을 50:1 비율로 섞어 사용하며, 표준 단백질 농도를 0, 0.125, 0.25, 0.5, 1, 2 ug/ml로 준비하여 흡광도를 측정합니다. 이를 통해 샘플의 단백질 농도를 계산할 수 있습니다. 샘플 버퍼, 단백질 양, 용해 버퍼의 양 등을 고려하여 western blotting 실험에 사용할 수 있습니다. 1. BCA assay The BCA (Bicinchoninic Acid)...2025.01.24
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생명과학 보고서_SDS-PAGE & Western blot(아주대 전공실험2)2025.05.161. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 기법으로, 단백질 시료에 SDS를 처리하여 단백질의 3차 구조를 풀어 선형화시킨 후 전기영동을 통해 분리한다. SDS는 단백질에 결합하여 음전하를 띠게 하므로, 단백질은 분자량에 비례하여 양극으로 이동하게 된다. 이를 통해 복잡한 단백질 혼합물을 효과적으로 분리할 수 있다. 2. Western blot Western blot은 특정 단백질의 유무 또는 양을 확인하는 분석 방법이다. 전기영동으로 분리된 단백질을 membrane에 전이시킨 후, 표적 단백질에 특이적...2025.05.16
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생명과학실험1 Western Blot2025.01.171. Western Blot Western Blot은 gel 전기영동을 통해 단백질을 분리하고, 특정 단백질의 존재 여부를 확인하는 실험이다. 이 실험에서는 SDS-PAGE를 이용하여 단백질을 크기별로 분류하고, 분류된 단백질을 membrane으로 옮긴 후에 항원-항체 상보적 결합을 이용하여 단백질의 존재 여부를 시각화하여 결과를 확인한다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 SDS라는 detergent를 사용하여 단백질의 구조를 선형으로 만듦으로써 단백질의 전하 밀도를 일정하게 만들고, 결국 단백질들이 크기로만 분류될 수 있게...2025.01.17
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대장균에서 재조합 단백질의 생산과 Western blot에 관한 실험2025.01.131. IPTG IPTG는 대장균 lactose operon의 효소합성을 유도하는 강력한 유도물질이다. 보통 유도물질은 operon의 활동에 의해 만들어지는 β-D-galactosidase에 의해 대사 이용하는 것이 많지만, IPTG는 분해되지 않아 비대사성 유도물질이라고도 불린다. 또한, 고농도로 사용시 galactoside permease가 없는 세포에도 투과할 수 있기 때문에 permease가 없는 균주에서의 유도실험에도 사용된다. 2. Buffer condition Tank buffer에는 glycine과 Cl-(Tris-ba...2025.01.13
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Cell harvest and protein assay2025.01.231. Cell harvest 세포 배양 시 adherent cell과 suspension cell로 구분할 수 있으며, adherent cell을 harvest하는 방법에는 화학적 방법(trypsin, accutase 사용)과 물리적 방법(scraper 사용)이 있다. 이번 실험에서는 물리적 방법인 scraper를 사용하여 adherent cell을 harvest하였다. 2. Protein extraction 세포 내 단백질을 추출하기 위해 lysis buffer와 phosphatase/protease inhibitor를 사용하여 ...2025.01.23
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Protein Regulation2025.01.181. Auxin-induced degron system Auxin-induced degron system은 특정 target protein을 원하는 상황에서 제거하기 위해 사용되는 방식으로, AID가 결합된 protein과 OsTir1이 같이 존재할 경우에 IAA(auxin)가 존재하지 않을 경우에는 정상적으로 protein이 존재할 수 있지만, IAA가 존재할 경우 IAA가 AID와 OsTir1을 연결하는 bridge 역할을 하고 polyubiquitin 구조가 형성되며 이는 이후 proteosome에 의해 빠르게 분해되어 pro...2025.01.18
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생명과학실험1 ELISA2025.01.171. ELISA 실험의 원리 ELISA 실험은 항원-항체 결합 반응과 효소를 이용한 발색 반응을 통해 특정 항원의 존재 여부 및 농도를 분석하는 기법이다. 항체와 항원의 특이적 결합과 효소-기질 반응을 이용하여 목표 항원을 검출할 수 있다. 2. ELISA의 종류 ELISA에는 Direct ELISA, Indirect ELISA, Sandwich ELISA 등 다양한 방식이 있다. 각 방식은 항원과 항체의 배치와 사용되는 항체의 수에 따라 차이가 있다. Indirect ELISA는 2차 항체를 사용하여 다양한 1차 항체에 대한 검출...2025.01.17
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Protein Electro-transfer and Western blot2025.01.231. Western blotting Western blotting은 단백질에 대한 blotting 기술을 뜻하며, 항원-항체 반응을 이용한다. 단백질 혼합물을 polyacrylamide gel에서 SDS-PAGE를 이용하여 크기에 따라 분리하고 membrane으로 electro-transfer하여 흡착시킨 후 membrane 표면에서 항체를 이용하여 원하는 단백질의 존재를 확인하는 전반적인 과정을 의미한다. 2. SDS의 역할 및 원리 SDS-PAGE는 SDS가 단백질에 일정 간격으로 결합하여 charge density를 일정하게 ...2025.01.23
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Cycloheximide chase assay를 이용한 단백질 half-life 측정2025.01.141. 단백질 분해 경로 세포 내에는 주요한 단백질 분해 경로인 ubiquitin-proteasome pathway와 autophagy-lysosome pathway가 존재한다. 이 두 경로를 통해 세포 내 단백질이 분해되며, 특정 단백질의 half-life는 이 분해 경로에 따라 달라진다. 2. cycloheximide의 작용 기전 cycloheximide는 진핵세포의 단백질 번역 과정을 억제하여 새로운 단백질 합성을 막는다. 따라서 기존에 존재하던 단백질만 남게 되어 시간에 따른 단백질 분해 정도를 관찰할 수 있다. 3. 단백질 ...2025.01.14
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