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생화학 PyMol 사용 단백질 구조 관찰 보고서2025.04.301. Myoglobin (PDB ID: 1MBN) Myoglobin은 근육 세포에 존재하는 단백질로, 산소 운반 및 저장 기능을 합니다. 이 보고서에서는 PyMol 프로그램을 사용하여 Myoglobin의 3차원 구조를 다양한 그래픽 표현 방식으로 관찰하였습니다. 스틱, 카툰, 구 모델 등을 통해 Myoglobin의 전반적인 구조와 Heme 그룹 및 His93 잔기와의 상호작용을 확인할 수 있었습니다. 1. Myoglobin (PDB ID: 1MBN) Myoglobin is a small, globular protein found i...2025.04.30
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말라카이트 그린 (Malachite green)과 곰팡이(Fungi)2025.05.061. 말라카이트 그린 (Malachite Green) 말라카이트 그린은 밝은 청록색의 염기성 염료로서 트리페닐메탄계 염료의 일종이다. 광택이 나는 녹색 결정으로 물과 알코올에 녹는다. 말라카이트 그린은 염색약의 형태인 chromatic form으로 주로 존재하지만, 체내에 흡수되면 대사되어 먼저 carbinol form으로 변화되며 이 형태는 세포막을 보다 빠르게 통과한다. 다음으로 세포 내에서 carbinol form이 대사되어 류코말라카이트 그린으로 변화되며 이 형태가 말라카이트 그린의 chromatic form보다 보다 오래 ...2025.05.06
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PDB를 이용한 이성질화 효소 PIN1의 구조 이해 및 PIN1 발현을 억제하는 ATRA를 통한 암 발병 예방2025.01.281. 이성질화 효소 이성질화효소란 하나의 분자 내에서 이성질화를 촉매하여 이성질체를 생성하는 효소군으로 효소 위원회 번호 EC 5로 분류된다. 이성질화는 분자를 구성하는 원자의 종류 및 개수가 동일하지만, 분자의 구조적 또는 공간적 배치가 달라지는 현상으로 원자의 배열 및 결합이 달라지거나 3차원적 배치가 다른 분자들을 생성하는 반응이다. 2. PIN1의 구조 및 암 발병과의 관계 PIN1은 프롤린 잔기 앞에 있는 Ser/Thr 잔기의 인산화를 인식하고 프롤린 펩타이드 결합의 시스/트랜스 입체구조 변화를 촉매하는 역할을 한다. PI...2025.01.28